MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 3270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	CGT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835311
2	NC_021910	GAG	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835311
3	NC_021910	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835311
4	NC_021910	GCG	2	6	379	384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835311
5	NC_021910	GCT	2	6	401	406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835311
6	NC_021910	AAG	2	6	416	421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835311
7	NC_021910	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835311
8	NC_021910	CCG	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835311
9	NC_021910	CTT	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835312
10	NC_021910	GAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835312
11	NC_021910	TGC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835312
12	NC_021910	TGC	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835312
13	NC_021910	GCG	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835313
14	NC_021910	ACA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835313
15	NC_021910	TGG	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835313
16	NC_021910	GAT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835313
17	NC_021910	CGA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835313
18	NC_021910	ACA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835313
19	NC_021910	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835313
20	NC_021910	TGA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835313
21	NC_021910	CAT	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835313
22	NC_021910	CGC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835314
23	NC_021910	GCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835314
24	NC_021910	CGG	2	6	3197	3202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835314
25	NC_021910	CAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
26	NC_021910	CTT	2	6	3259	3264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835315
27	NC_021910	CGC	2	6	3267	3272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
28	NC_021910	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
29	NC_021910	TCA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835315
30	NC_021910	CGA	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
31	NC_021910	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
32	NC_021910	CGC	2	6	3816	3821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
33	NC_021910	CTC	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835315
34	NC_021910	ACG	3	9	3887	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
35	NC_021910	GTG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835315
36	NC_021910	AGC	2	6	3923	3928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
37	NC_021910	ATC	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835315
38	NC_021910	GTT	2	6	4077	4082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835315
39	NC_021910	GCT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835316
40	NC_021910	GAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835316
41	NC_021910	GCC	2	6	4783	4788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
42	NC_021910	CGG	2	6	4820	4825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
43	NC_021910	GCG	2	6	4831	4836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
44	NC_021910	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
45	NC_021910	CGA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
46	NC_021910	GGT	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835316
47	NC_021910	CAA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835316
48	NC_021910	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
49	NC_021910	CCT	2	6	5240	5245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835316
50	NC_021910	CGG	2	6	5253	5258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
51	NC_021910	GGC	2	6	5259	5264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
52	NC_021910	AGC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
53	NC_021910	TCG	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835316
54	NC_021910	CGG	2	6	5408	5413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
55	NC_021910	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
56	NC_021910	GCC	2	6	5551	5556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
57	NC_021910	ATC	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835316
58	NC_021910	GAT	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835316
59	NC_021910	CGC	3	9	5864	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
60	NC_021910	CGG	2	6	5898	5903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
61	NC_021910	GCC	2	6	5908	5913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
62	NC_021910	CGC	2	6	5971	5976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
63	NC_021910	CGA	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
64	NC_021910	GCT	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
65	NC_021910	GCC	2	6	6071	6076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
66	NC_021910	TGC	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
67	NC_021910	CGA	2	6	6145	6150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
68	NC_021910	CAA	2	6	6184	6189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835317
69	NC_021910	GGC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
70	NC_021910	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835317
71	NC_021910	GGA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835317
72	NC_021910	GGC	2	6	6238	6243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
73	NC_021910	CGC	2	6	6295	6300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
74	NC_021910	CGC	2	6	6309	6314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
75	NC_021910	TTC	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835317
76	NC_021910	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
77	NC_021910	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
78	NC_021910	TGG	2	6	6389	6394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835317
79	NC_021910	GCT	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
80	NC_021910	GCG	2	6	6470	6475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
81	NC_021910	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
82	NC_021910	TGG	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835317
83	NC_021910	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
84	NC_021910	GCC	2	6	6692	6697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
85	NC_021910	TGA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835317
86	NC_021910	ACG	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
87	NC_021910	GCC	2	6	6894	6899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835318
88	NC_021910	TGC	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
89	NC_021910	TCG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
90	NC_021910	GCA	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
91	NC_021910	CGA	2	6	7023	7028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
92	NC_021910	GGA	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
93	NC_021910	TCG	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
94	NC_021910	CGG	2	6	7077	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835318
95	NC_021910	GCA	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
96	NC_021910	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835318
97	NC_021910	GGC	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835318
98	NC_021910	AGG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
99	NC_021910	GAC	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
100	NC_021910	GCT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
101	NC_021910	CTG	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
102	NC_021910	GGA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
103	NC_021910	CTT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835319
104	NC_021910	TCG	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835319
105	NC_021910	TCA	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835319
106	NC_021910	CGG	2	6	7781	7786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835320
107	NC_021910	CAT	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835320
108	NC_021910	TCG	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835320
109	NC_021910	GAT	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835320
110	NC_021910	CGG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835320
111	NC_021910	GCA	2	6	8154	8159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835320
112	NC_021910	GTG	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835320
113	NC_021910	TCG	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835320
114	NC_021910	GAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835321
115	NC_021910	GAG	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835321
116	NC_021910	TTG	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835321
117	NC_021910	CAG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835321
118	NC_021910	ATT	2	6	9212	9217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835321
119	NC_021910	GAT	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835321
120	NC_021910	TGC	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835321
121	NC_021910	AGC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835321
122	NC_021910	CTC	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835321
123	NC_021910	TTG	2	6	10250	10255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835322
124	NC_021910	GAT	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835323
125	NC_021910	CTT	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835323
126	NC_021910	TCG	2	6	10629	10634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
127	NC_021910	AGT	2	6	10715	10720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835323
128	NC_021910	ATC	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835323
129	NC_021910	TCG	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
130	NC_021910	GTC	2	6	11139	11144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
131	NC_021910	GTC	2	6	11172	11177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
132	NC_021910	CTT	2	6	11259	11264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835323
133	NC_021910	GCT	2	6	11281	11286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
134	NC_021910	CGC	2	6	11298	11303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835323
135	NC_021910	CGT	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835324
136	NC_021910	GTC	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835324
137	NC_021910	TGT	2	6	11536	11541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835324
138	NC_021910	TGA	2	6	11545	11550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835324
139	NC_021910	GAC	2	6	11552	11557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
140	NC_021910	CCT	2	6	11578	11583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835324
141	NC_021910	CAG	2	6	11648	11653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
142	NC_021910	CGC	2	6	11701	11706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835324
143	NC_021910	CAG	2	6	11801	11806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
144	NC_021910	CAT	2	6	11807	11812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835324
145	NC_021910	CCT	3	9	11833	11841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835324
146	NC_021910	GAA	2	6	11852	11857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835324
147	NC_021910	GAT	2	6	11882	11887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835324
148	NC_021910	GAC	2	6	11903	11908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
149	NC_021910	CTG	2	6	11954	11959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835324
150	NC_021910	GAT	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835324
151	NC_021910	GAC	2	6	12202	12207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835325
152	NC_021910	AGA	3	9	12221	12229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835325
153	NC_021910	TGA	3	9	12294	12302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835325
154	NC_021910	CCA	2	6	12338	12343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835325
155	NC_021910	CGC	2	6	12354	12359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835325
156	NC_021910	CAT	2	6	12460	12465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835325
157	NC_021910	CGC	2	6	12523	12528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835325
158	NC_021910	CCA	2	6	12539	12544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835325
159	NC_021910	AGA	2	6	12618	12623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835325
160	NC_021910	GCC	2	6	12742	12747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835325
161	NC_021910	CAG	2	6	12787	12792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835325
162	NC_021910	CAC	2	6	12880	12885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528835325
163	NC_021910	ATC	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835325
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165	NC_021910	CGA	2	6	12979	12984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835325
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167	NC_021910	GAA	2	6	13042	13047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835325
168	NC_021910	CGC	3	9	13141	13149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835325
169	NC_021910	GAA	2	6	13395	13400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835326
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172	NC_021910	GCA	2	6	13588	13593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835326
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184	NC_021910	CTT	2	6	14525	14530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835327
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236	NC_021910	ACG	2	6	19622	19627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835332
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238	NC_021910	CGG	2	6	20034	20039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835334
239	NC_021910	CTG	2	6	20109	20114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835334
240	NC_021910	AGC	4	12	20133	20144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835334
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242	NC_021910	TGT	2	6	20806	20811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835335
243	NC_021910	CGT	2	6	20974	20979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835335
244	NC_021910	TGC	2	6	21031	21036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835335
245	NC_021910	TCT	2	6	21052	21057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835335
246	NC_021910	GAG	2	6	21164	21169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835335
247	NC_021910	CGT	2	6	21190	21195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835335
248	NC_021910	GTA	2	6	21487	21492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835335
249	NC_021910	TGG	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835336
250	NC_021910	CTC	2	6	21790	21795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835336
251	NC_021910	GGC	2	6	21801	21806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835336
252	NC_021910	GAT	2	6	21981	21986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835336
253	NC_021910	GTT	2	6	21995	22000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835336
254	NC_021910	GTT	2	6	22002	22007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835336
255	NC_021910	AAC	2	6	22141	22146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835336
256	NC_021910	AAG	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835336
257	NC_021910	CTT	2	6	22279	22284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835336
258	NC_021910	GCA	2	6	22317	22322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835336
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260	NC_021910	TGG	2	6	22618	22623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835336
261	NC_021910	TCT	2	6	22742	22747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835336
262	NC_021910	CTG	2	6	22756	22761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835336
263	NC_021910	TTC	2	6	22765	22770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835336
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265	NC_021910	GCG	2	6	22839	22844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835336
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269	NC_021910	TAC	2	6	23226	23231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835336
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272	NC_021910	CTT	2	6	23406	23411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835336
273	NC_021910	ACG	2	6	23443	23448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835336
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277	NC_021910	GAT	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835337
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284	NC_021910	GGA	2	6	24527	24532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835338
285	NC_021910	ACG	2	6	24536	24541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835338
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290	NC_021910	TGG	2	6	24994	24999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835338
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375	NC_021910	CGC	2	6	32111	32116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835343
376	NC_021910	TTG	2	6	32376	32381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835344
377	NC_021910	AGA	2	6	32400	32405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835344
378	NC_021910	CGT	2	6	32413	32418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835344
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380	NC_021910	TCG	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835344
381	NC_021910	GCG	2	6	32475	32480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835344
382	NC_021910	TCC	2	6	32496	32501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835344
383	NC_021910	ACT	2	6	32517	32522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835344
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387	NC_021910	AGG	2	6	32766	32771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835344
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392	NC_021910	GCC	2	6	33299	33304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835344
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498	NC_021910	ATG	2	6	41885	41890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835354
499	NC_021910	TTG	2	6	42213	42218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835355
500	NC_021910	GGC	2	6	42292	42297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835355

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