MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	GA	4	8	640	647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021910	AT	3	6	720	725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021910	GC	3	6	841	846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021910	CA	3	6	904	909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021910	CG	3	6	4263	4268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021910	CT	3	6	16482	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021910	GC	3	6	16496	16501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021910	GA	3	6	17766	17771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021910	CG	3	6	18232	18237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021910	AG	3	6	25366	25371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021910	CG	4	8	30237	30244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021910	GA	3	6	30376	30381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021910	CG	3	6	31139	31144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021910	GC	3	6	31154	31159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021910	GC	3	6	37065	37070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021910	AT	3	6	45618	45623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021910	TC	3	6	50975	50980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021910	GC	3	6	51142	51147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021910	CG	3	6	61741	61746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021910	CG	3	6	72780	72785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021910	CG	4	8	86744	86751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021910	TC	3	6	92903	92908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021910	TC	3	6	93229	93234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021910	GC	3	6	98335	98340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021910	GC	3	6	101526	101531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021910	GC	3	6	111178	111183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021910	GA	3	6	111597	111602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021910	TA	3	6	111800	111805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021910	AG	3	6	120215	120220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021910	TC	4	8	122030	122037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021910	CG	3	6	123862	123867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021910	GA	3	6	123888	123893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021910	AG	3	6	127224	127229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021910	GC	3	6	133062	133067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021910	CG	4	8	133346	133353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021910	CT	3	6	133371	133376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021910	GA	3	6	147896	147901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021910	GC	3	6	149245	149250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021910	GC	3	6	150784	150789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021910	GT	3	6	150861	150866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021910	TG	3	6	160918	160923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021910	CG	3	6	161710	161715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021910	CA	3	6	161879	161884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021910	CT	3	6	162235	162240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021910	AT	3	6	164330	164335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021910	AC	3	6	164411	164416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021910	AC	3	6	164486	164491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021910	CG	4	8	164561	164568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021910	GC	3	6	164718	164723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021910	GC	3	6	165387	165392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021910	AT	3	6	173660	173665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021910	CA	3	6	173787	173792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021910	GC	3	6	173812	173817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021910	CG	3	6	174364	174369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021910	GC	3	6	176477	176482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021910	GA	3	6	177115	177120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021910	CG	3	6	177203	177208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021910	GC	3	6	177217	177222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021910	GC	3	6	177408	177413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021910	CG	3	6	178136	178141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021910	GC	3	6	179203	179208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021910	GC	3	6	179481	179486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021910	CT	3	6	184612	184617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021910	GC	4	8	190767	190774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021910	GT	3	6	213721	213726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021910	GC	3	6	223204	223209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021910	GC	3	6	223278	223283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021910	TA	3	6	229146	229151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021910	CT	5	10	240742	240751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.