MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	A	7	7	728	734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021910	T	6	6	1909	1914	0 %	100 %	0 %	0 %	528835313
3	NC_021910	G	6	6	5461	5466	0 %	0 %	100 %	0 %	528835316
4	NC_021910	T	6	6	7611	7616	0 %	100 %	0 %	0 %	528835319
5	NC_021910	A	6	6	8404	8409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021910	T	6	6	9303	9308	0 %	100 %	0 %	0 %	528835321
7	NC_021910	A	6	6	9576	9581	100 %	0 %	0 %	0 %	528835321
8	NC_021910	T	6	6	11196	11201	0 %	100 %	0 %	0 %	528835323
9	NC_021910	G	6	6	11935	11940	0 %	0 %	100 %	0 %	528835324
10	NC_021910	T	6	6	15072	15077	0 %	100 %	0 %	0 %	528835327
11	NC_021910	C	7	7	17469	17475	0 %	0 %	0 %	100 %	528835330
12	NC_021910	T	7	7	18352	18358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021910	G	6	6	18757	18762	0 %	0 %	100 %	0 %	528835331
14	NC_021910	G	6	6	20523	20528	0 %	0 %	100 %	0 %	528835335
15	NC_021910	G	6	6	24182	24187	0 %	0 %	100 %	0 %	528835338
16	NC_021910	T	6	6	28335	28340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021910	T	7	7	29347	29353	0 %	100 %	0 %	0 %	528835341
18	NC_021910	G	6	6	29549	29554	0 %	0 %	100 %	0 %	528835341
19	NC_021910	C	6	6	30684	30689	0 %	0 %	0 %	100 %	528835342
20	NC_021910	T	6	6	32075	32080	0 %	100 %	0 %	0 %	528835343
21	NC_021910	G	6	6	36385	36390	0 %	0 %	100 %	0 %	528835348
22	NC_021910	G	6	6	37920	37925	0 %	0 %	100 %	0 %	528835350
23	NC_021910	T	7	7	44218	44224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021910	C	7	7	51180	51186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_021910	A	6	6	52415	52420	100 %	0 %	0 %	0 %	528835365
26	NC_021910	C	6	6	52514	52519	0 %	0 %	0 %	100 %	528835365
27	NC_021910	T	7	7	52623	52629	0 %	100 %	0 %	0 %	528835365
28	NC_021910	C	6	6	63398	63403	0 %	0 %	0 %	100 %	528835377
29	NC_021910	T	6	6	82650	82655	0 %	100 %	0 %	0 %	528835397
30	NC_021910	T	6	6	85086	85091	0 %	100 %	0 %	0 %	528835399
31	NC_021910	A	7	7	85288	85294	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
32	NC_021910	A	6	6	86434	86439	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
33	NC_021910	T	6	6	90531	90536	0 %	100 %	0 %	0 %	528835404
34	NC_021910	T	7	7	92239	92245	0 %	100 %	0 %	0 %	528835407
35	NC_021910	G	6	6	94375	94380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021910	C	6	6	94822	94827	0 %	0 %	0 %	100 %	528835409
37	NC_021910	T	6	6	95481	95486	0 %	100 %	0 %	0 %	528835409
38	NC_021910	G	6	6	95714	95719	0 %	0 %	100 %	0 %	528835409
39	NC_021910	A	6	6	98656	98661	100 %	0 %	0 %	0 %	528835411
40	NC_021910	A	6	6	98764	98769	100 %	0 %	0 %	0 %	528835411
41	NC_021910	T	6	6	98869	98874	0 %	100 %	0 %	0 %	528835411
42	NC_021910	A	6	6	104235	104240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021910	A	6	6	107523	107528	100 %	0 %	0 %	0 %	528835419
44	NC_021910	A	6	6	107577	107582	100 %	0 %	0 %	0 %	528835419
45	NC_021910	A	6	6	110427	110432	100 %	0 %	0 %	0 %	528835422
46	NC_021910	C	6	6	116698	116703	0 %	0 %	0 %	100 %	528835426
47	NC_021910	T	7	7	117147	117153	0 %	100 %	0 %	0 %	528835427
48	NC_021910	A	7	7	119970	119976	100 %	0 %	0 %	0 %	528835429
49	NC_021910	A	7	7	121457	121463	100 %	0 %	0 %	0 %	528835431
50	NC_021910	G	6	6	121642	121647	0 %	0 %	100 %	0 %	528835431
51	NC_021910	T	6	6	122405	122410	0 %	100 %	0 %	0 %	528835432
52	NC_021910	T	6	6	122502	122507	0 %	100 %	0 %	0 %	528835432
53	NC_021910	A	6	6	123803	123808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021910	G	6	6	127319	127324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021910	T	7	7	132033	132039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021910	T	6	6	132505	132510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021910	G	6	6	137194	137199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021910	T	7	7	139193	139199	0 %	100 %	0 %	0 %	528835445
59	NC_021910	A	6	6	139788	139793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021910	A	6	6	140195	140200	100 %	0 %	0 %	0 %	528835448
61	NC_021910	T	6	6	140943	140948	0 %	100 %	0 %	0 %	528835449
62	NC_021910	T	6	6	141645	141650	0 %	100 %	0 %	0 %	528835450
63	NC_021910	G	7	7	142678	142684	0 %	0 %	100 %	0 %	528835451
64	NC_021910	T	6	6	143049	143054	0 %	100 %	0 %	0 %	528835452
65	NC_021910	C	6	6	143898	143903	0 %	0 %	0 %	100 %	528835453
66	NC_021910	T	6	6	151466	151471	0 %	100 %	0 %	0 %	528835459
67	NC_021910	G	6	6	152039	152044	0 %	0 %	100 %	0 %	528835459
68	NC_021910	C	7	7	156540	156546	0 %	0 %	0 %	100 %	528835463
69	NC_021910	A	6	6	165215	165220	100 %	0 %	0 %	0 %	528835468
70	NC_021910	C	7	7	166631	166637	0 %	0 %	0 %	100 %	528835469
71	NC_021910	C	6	6	167394	167399	0 %	0 %	0 %	100 %	528835469
72	NC_021910	A	7	7	167585	167591	100 %	0 %	0 %	0 %	528835469
73	NC_021910	A	6	6	168833	168838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021910	T	6	6	174617	174622	0 %	100 %	0 %	0 %	528835475
75	NC_021910	A	6	6	175722	175727	100 %	0 %	0 %	0 %	528835477
76	NC_021910	G	7	7	181483	181489	0 %	0 %	100 %	0 %	528835479
77	NC_021910	A	6	6	184761	184766	100 %	0 %	0 %	0 %	528835482
78	NC_021910	G	6	6	185092	185097	0 %	0 %	100 %	0 %	528835482
79	NC_021910	G	6	6	187570	187575	0 %	0 %	100 %	0 %	528835483
80	NC_021910	C	7	7	194344	194350	0 %	0 %	0 %	100 %	528835490
81	NC_021910	A	6	6	194382	194387	100 %	0 %	0 %	0 %	528835490
82	NC_021910	T	7	7	195281	195287	0 %	100 %	0 %	0 %	528835491
83	NC_021910	G	6	6	195454	195459	0 %	0 %	100 %	0 %	528835491
84	NC_021910	C	6	6	195497	195502	0 %	0 %	0 %	100 %	528835491
85	NC_021910	G	6	6	196974	196979	0 %	0 %	100 %	0 %	528835493
86	NC_021910	A	6	6	198030	198035	100 %	0 %	0 %	0 %	528835493
87	NC_021910	A	8	8	199828	199835	100 %	0 %	0 %	0 %	528835496
88	NC_021910	T	6	6	202697	202702	0 %	100 %	0 %	0 %	528835498
89	NC_021910	T	6	6	203102	203107	0 %	100 %	0 %	0 %	528835499
90	NC_021910	C	6	6	204109	204114	0 %	0 %	0 %	100 %	528835500
91	NC_021910	T	6	6	210647	210652	0 %	100 %	0 %	0 %	528835507
92	NC_021910	T	6	6	217315	217320	0 %	100 %	0 %	0 %	528835515
93	NC_021910	T	6	6	222110	222115	0 %	100 %	0 %	0 %	528835519
94	NC_021910	A	6	6	225600	225605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021910	T	7	7	225729	225735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021910	A	6	6	228515	228520	100 %	0 %	0 %	0 %	528835523
97	NC_021910	C	6	6	232359	232364	0 %	0 %	0 %	100 %	528835526
98	NC_021910	G	6	6	234442	234447	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021910	T	6	6	240202	240207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021910	A	6	6	259433	259438	100 %	0 %	0 %	0 %	528835562
101	NC_021910	C	6	6	265086	265091	0 %	0 %	0 %	100 %	528835569
102	NC_021910	T	6	6	266523	266528	0 %	100 %	0 %	0 %	528835570
103	NC_021910	A	6	6	267011	267016	100 %	0 %	0 %	0 %	528835570

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.