MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	T	6	6	1909	1914	0 %	100 %	0 %	0 %	528835313
2	NC_021910	G	6	6	5461	5466	0 %	0 %	100 %	0 %	528835316
3	NC_021910	T	6	6	7611	7616	0 %	100 %	0 %	0 %	528835319
4	NC_021910	T	6	6	9303	9308	0 %	100 %	0 %	0 %	528835321
5	NC_021910	A	6	6	9576	9581	100 %	0 %	0 %	0 %	528835321
6	NC_021910	T	6	6	11196	11201	0 %	100 %	0 %	0 %	528835323
7	NC_021910	G	6	6	11935	11940	0 %	0 %	100 %	0 %	528835324
8	NC_021910	T	6	6	15072	15077	0 %	100 %	0 %	0 %	528835327
9	NC_021910	C	7	7	17469	17475	0 %	0 %	0 %	100 %	528835330
10	NC_021910	G	6	6	18757	18762	0 %	0 %	100 %	0 %	528835331
11	NC_021910	G	6	6	20523	20528	0 %	0 %	100 %	0 %	528835335
12	NC_021910	G	6	6	24182	24187	0 %	0 %	100 %	0 %	528835338
13	NC_021910	T	7	7	29347	29353	0 %	100 %	0 %	0 %	528835341
14	NC_021910	G	6	6	29549	29554	0 %	0 %	100 %	0 %	528835341
15	NC_021910	C	6	6	30684	30689	0 %	0 %	0 %	100 %	528835342
16	NC_021910	T	6	6	32075	32080	0 %	100 %	0 %	0 %	528835343
17	NC_021910	G	6	6	36385	36390	0 %	0 %	100 %	0 %	528835348
18	NC_021910	G	6	6	37920	37925	0 %	0 %	100 %	0 %	528835350
19	NC_021910	A	6	6	52415	52420	100 %	0 %	0 %	0 %	528835365
20	NC_021910	C	6	6	52514	52519	0 %	0 %	0 %	100 %	528835365
21	NC_021910	T	7	7	52623	52629	0 %	100 %	0 %	0 %	528835365
22	NC_021910	C	6	6	63398	63403	0 %	0 %	0 %	100 %	528835377
23	NC_021910	T	6	6	82650	82655	0 %	100 %	0 %	0 %	528835397
24	NC_021910	T	6	6	85086	85091	0 %	100 %	0 %	0 %	528835399
25	NC_021910	A	7	7	85288	85294	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
26	NC_021910	A	6	6	86434	86439	100 %	0 %	0 %	0 %	528835399
27	NC_021910	T	6	6	90531	90536	0 %	100 %	0 %	0 %	528835404
28	NC_021910	T	7	7	92239	92245	0 %	100 %	0 %	0 %	528835407
29	NC_021910	C	6	6	94822	94827	0 %	0 %	0 %	100 %	528835409
30	NC_021910	T	6	6	95481	95486	0 %	100 %	0 %	0 %	528835409
31	NC_021910	G	6	6	95714	95719	0 %	0 %	100 %	0 %	528835409
32	NC_021910	A	6	6	98656	98661	100 %	0 %	0 %	0 %	528835411
33	NC_021910	A	6	6	98764	98769	100 %	0 %	0 %	0 %	528835411
34	NC_021910	T	6	6	98869	98874	0 %	100 %	0 %	0 %	528835411
35	NC_021910	A	6	6	107523	107528	100 %	0 %	0 %	0 %	528835419
36	NC_021910	A	6	6	107577	107582	100 %	0 %	0 %	0 %	528835419
37	NC_021910	A	6	6	110427	110432	100 %	0 %	0 %	0 %	528835422
38	NC_021910	C	6	6	116698	116703	0 %	0 %	0 %	100 %	528835426
39	NC_021910	T	7	7	117147	117153	0 %	100 %	0 %	0 %	528835427
40	NC_021910	A	7	7	119970	119976	100 %	0 %	0 %	0 %	528835429
41	NC_021910	A	7	7	121457	121463	100 %	0 %	0 %	0 %	528835431
42	NC_021910	G	6	6	121642	121647	0 %	0 %	100 %	0 %	528835431
43	NC_021910	T	6	6	122405	122410	0 %	100 %	0 %	0 %	528835432
44	NC_021910	T	6	6	122502	122507	0 %	100 %	0 %	0 %	528835432
45	NC_021910	T	7	7	139193	139199	0 %	100 %	0 %	0 %	528835445
46	NC_021910	A	6	6	140195	140200	100 %	0 %	0 %	0 %	528835448
47	NC_021910	T	6	6	140943	140948	0 %	100 %	0 %	0 %	528835449
48	NC_021910	T	6	6	141645	141650	0 %	100 %	0 %	0 %	528835450
49	NC_021910	G	7	7	142678	142684	0 %	0 %	100 %	0 %	528835451
50	NC_021910	T	6	6	143049	143054	0 %	100 %	0 %	0 %	528835452
51	NC_021910	C	6	6	143898	143903	0 %	0 %	0 %	100 %	528835453
52	NC_021910	T	6	6	151466	151471	0 %	100 %	0 %	0 %	528835459
53	NC_021910	G	6	6	152039	152044	0 %	0 %	100 %	0 %	528835459
54	NC_021910	C	7	7	156540	156546	0 %	0 %	0 %	100 %	528835463
55	NC_021910	A	6	6	165215	165220	100 %	0 %	0 %	0 %	528835468
56	NC_021910	C	7	7	166631	166637	0 %	0 %	0 %	100 %	528835469
57	NC_021910	C	6	6	167394	167399	0 %	0 %	0 %	100 %	528835469
58	NC_021910	A	7	7	167585	167591	100 %	0 %	0 %	0 %	528835469
59	NC_021910	T	6	6	174617	174622	0 %	100 %	0 %	0 %	528835475
60	NC_021910	A	6	6	175722	175727	100 %	0 %	0 %	0 %	528835477
61	NC_021910	G	7	7	181483	181489	0 %	0 %	100 %	0 %	528835479
62	NC_021910	A	6	6	184761	184766	100 %	0 %	0 %	0 %	528835482
63	NC_021910	G	6	6	185092	185097	0 %	0 %	100 %	0 %	528835482
64	NC_021910	G	6	6	187570	187575	0 %	0 %	100 %	0 %	528835483
65	NC_021910	C	7	7	194344	194350	0 %	0 %	0 %	100 %	528835490
66	NC_021910	A	6	6	194382	194387	100 %	0 %	0 %	0 %	528835490
67	NC_021910	T	7	7	195281	195287	0 %	100 %	0 %	0 %	528835491
68	NC_021910	G	6	6	195454	195459	0 %	0 %	100 %	0 %	528835491
69	NC_021910	C	6	6	195497	195502	0 %	0 %	0 %	100 %	528835491
70	NC_021910	G	6	6	196974	196979	0 %	0 %	100 %	0 %	528835493
71	NC_021910	A	6	6	198030	198035	100 %	0 %	0 %	0 %	528835493
72	NC_021910	A	8	8	199828	199835	100 %	0 %	0 %	0 %	528835496
73	NC_021910	T	6	6	202697	202702	0 %	100 %	0 %	0 %	528835498
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76	NC_021910	T	6	6	210647	210652	0 %	100 %	0 %	0 %	528835507
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79	NC_021910	A	6	6	228515	228520	100 %	0 %	0 %	0 %	528835523
80	NC_021910	C	6	6	232359	232364	0 %	0 %	0 %	100 %	528835526
81	NC_021910	A	6	6	259433	259438	100 %	0 %	0 %	0 %	528835562
82	NC_021910	C	6	6	265086	265091	0 %	0 %	0 %	100 %	528835569
83	NC_021910	T	6	6	266523	266528	0 %	100 %	0 %	0 %	528835570
84	NC_021910	A	6	6	267011	267016	100 %	0 %	0 %	0 %	528835570

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.