MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 1634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	CGGC	2	8	695	702	0 %	0 %	50 %	50 %	528834107
2	NC_021909	CGGC	2	8	713	720	0 %	0 %	50 %	50 %	528834107
3	NC_021909	AGGT	2	8	1357	1364	25 %	25 %	50 %	0 %	528834107
4	NC_021909	CTGT	2	8	1524	1531	0 %	50 %	25 %	25 %	528834108
5	NC_021909	CCGC	2	8	1824	1831	0 %	0 %	25 %	75 %	528834108
6	NC_021909	AGCC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	25 %	50 %	528834108
7	NC_021909	CGTA	2	8	2210	2217	25 %	25 %	25 %	25 %	528834108
8	NC_021909	GTTC	2	8	2325	2332	0 %	50 %	25 %	25 %	528834108
9	NC_021909	CGTA	2	8	2694	2701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021909	CCGG	2	8	2774	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021909	CAGC	2	8	2869	2876	25 %	0 %	25 %	50 %	528834109
12	NC_021909	GGCG	2	8	2896	2903	0 %	0 %	75 %	25 %	528834109
13	NC_021909	TCGA	2	8	2906	2913	25 %	25 %	25 %	25 %	528834109
14	NC_021909	CGGC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	50 %	50 %	528834109
15	NC_021909	GGCT	2	8	3276	3283	0 %	25 %	50 %	25 %	528834109
16	NC_021909	ACGA	2	8	3359	3366	50 %	0 %	25 %	25 %	528834109
17	NC_021909	CGAG	2	8	3952	3959	25 %	0 %	50 %	25 %	528834109
18	NC_021909	GATC	2	8	4330	4337	25 %	25 %	25 %	25 %	528834109
19	NC_021909	ATGG	2	8	4745	4752	25 %	25 %	50 %	0 %	528834109
20	NC_021909	GATG	2	8	6172	6179	25 %	25 %	50 %	0 %	528834111
21	NC_021909	TTCG	2	8	8230	8237	0 %	50 %	25 %	25 %	528834113
22	NC_021909	TGCG	2	8	8432	8439	0 %	25 %	50 %	25 %	528834113
23	NC_021909	CCGA	2	8	9967	9974	25 %	0 %	25 %	50 %	528834113
24	NC_021909	GCCG	2	8	10319	10326	0 %	0 %	50 %	50 %	528834113
25	NC_021909	ACCG	2	8	11002	11009	25 %	0 %	25 %	50 %	528834113
26	NC_021909	GACG	2	8	11448	11455	25 %	0 %	50 %	25 %	528834113
27	NC_021909	GATC	2	8	11523	11530	25 %	25 %	25 %	25 %	528834113
28	NC_021909	CGGT	2	8	11689	11696	0 %	25 %	50 %	25 %	528834113
29	NC_021909	GCCG	2	8	11908	11915	0 %	0 %	50 %	50 %	528834114
30	NC_021909	CGGG	2	8	11917	11924	0 %	0 %	75 %	25 %	528834114
31	NC_021909	GGAC	2	8	12008	12015	25 %	0 %	50 %	25 %	528834114
32	NC_021909	CCGG	2	8	12338	12345	0 %	0 %	50 %	50 %	528834114
33	NC_021909	CTAT	2	8	12417	12424	25 %	50 %	0 %	25 %	528834114
34	NC_021909	GCTG	2	8	12803	12810	0 %	25 %	50 %	25 %	528834114
35	NC_021909	CCGC	2	8	12827	12834	0 %	0 %	25 %	75 %	528834114
36	NC_021909	GAGG	2	8	12904	12911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021909	GTCG	2	8	13020	13027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021909	CCCT	2	8	13085	13092	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021909	CCCG	2	8	13095	13102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_021909	CCGA	2	8	13264	13271	25 %	0 %	25 %	50 %	528834115
41	NC_021909	CGGC	2	8	13787	13794	0 %	0 %	50 %	50 %	528834115
42	NC_021909	GGCA	2	8	14126	14133	25 %	0 %	50 %	25 %	528834115
43	NC_021909	TTGA	2	8	14894	14901	25 %	50 %	25 %	0 %	528834117
44	NC_021909	GGCC	2	8	14950	14957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021909	GCGA	2	8	15546	15553	25 %	0 %	50 %	25 %	528834119
46	NC_021909	CTGG	2	8	15953	15960	0 %	25 %	50 %	25 %	528834120
47	NC_021909	CCGC	2	8	16138	16145	0 %	0 %	25 %	75 %	528834120
48	NC_021909	TCGA	2	8	17336	17343	25 %	25 %	25 %	25 %	528834123
49	NC_021909	GATT	2	8	17481	17488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021909	CCAC	2	8	18186	18193	25 %	0 %	0 %	75 %	528834124
51	NC_021909	CCCG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_021909	CAAA	2	8	18575	18582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021909	TTCG	2	8	18673	18680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021909	CGCC	2	8	18930	18937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_021909	GCGA	2	8	18956	18963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021909	ACTG	2	8	19198	19205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021909	GTTC	2	8	19694	19701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021909	CCGC	2	8	20074	20081	0 %	0 %	25 %	75 %	528834126
59	NC_021909	GGCA	2	8	20519	20526	25 %	0 %	50 %	25 %	528834126
60	NC_021909	TGAA	2	8	21441	21448	50 %	25 %	25 %	0 %	528834128
61	NC_021909	GCCG	2	8	22081	22088	0 %	0 %	50 %	50 %	528834128
62	NC_021909	CGGG	2	8	22126	22133	0 %	0 %	75 %	25 %	528834128
63	NC_021909	CCCG	2	8	22183	22190	0 %	0 %	25 %	75 %	528834128
64	NC_021909	ACGG	2	8	22216	22223	25 %	0 %	50 %	25 %	528834128
65	NC_021909	TGAA	2	8	22264	22271	50 %	25 %	25 %	0 %	528834128
66	NC_021909	TTTC	2	8	23134	23141	0 %	75 %	0 %	25 %	528834131
67	NC_021909	GCGG	2	8	24522	24529	0 %	0 %	75 %	25 %	528834131
68	NC_021909	GAAG	2	8	24647	24654	50 %	0 %	50 %	0 %	528834131
69	NC_021909	GTCC	2	8	24704	24711	0 %	25 %	25 %	50 %	528834131
70	NC_021909	AGCG	2	8	24771	24778	25 %	0 %	50 %	25 %	528834131
71	NC_021909	CGCC	2	8	24797	24804	0 %	0 %	25 %	75 %	528834131
72	NC_021909	GAGC	2	8	25489	25496	25 %	0 %	50 %	25 %	528834131
73	NC_021909	CGGC	2	8	25499	25506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021909	GCTC	2	8	27270	27277	0 %	25 %	25 %	50 %	528834133
75	NC_021909	GGCG	2	8	27603	27610	0 %	0 %	75 %	25 %	528834134
76	NC_021909	GGCC	2	8	28337	28344	0 %	0 %	50 %	50 %	528834135
77	NC_021909	GGCC	2	8	28628	28635	0 %	0 %	50 %	50 %	528834135
78	NC_021909	CCGG	2	8	29294	29301	0 %	0 %	50 %	50 %	528834136
79	NC_021909	TCTG	2	8	29306	29313	0 %	50 %	25 %	25 %	528834136
80	NC_021909	CTCA	2	8	29779	29786	25 %	25 %	0 %	50 %	528834137
81	NC_021909	CCTG	2	8	30243	30250	0 %	25 %	25 %	50 %	528834137
82	NC_021909	TCGA	2	8	30389	30396	25 %	25 %	25 %	25 %	528834138
83	NC_021909	CAGG	2	8	30766	30773	25 %	0 %	50 %	25 %	528834138
84	NC_021909	CGCC	2	8	30903	30910	0 %	0 %	25 %	75 %	528834138
85	NC_021909	GTCG	2	8	30991	30998	0 %	25 %	50 %	25 %	528834138
86	NC_021909	CGGC	2	8	31132	31139	0 %	0 %	50 %	50 %	528834138
87	NC_021909	ACGG	2	8	31433	31440	25 %	0 %	50 %	25 %	528834138
88	NC_021909	CTTT	2	8	31737	31744	0 %	75 %	0 %	25 %	528834139
89	NC_021909	GCAA	2	8	32039	32046	50 %	0 %	25 %	25 %	528834139
90	NC_021909	GCGT	2	8	32175	32182	0 %	25 %	50 %	25 %	528834139
91	NC_021909	GCAA	2	8	33179	33186	50 %	0 %	25 %	25 %	528834140
92	NC_021909	TTGG	2	8	33344	33351	0 %	50 %	50 %	0 %	528834140
93	NC_021909	CGAT	2	8	34119	34126	25 %	25 %	25 %	25 %	528834140
94	NC_021909	GCAG	2	8	34557	34564	25 %	0 %	50 %	25 %	528834140
95	NC_021909	GTCG	2	8	34588	34595	0 %	25 %	50 %	25 %	528834140
96	NC_021909	GGAC	2	8	35006	35013	25 %	0 %	50 %	25 %	528834140
97	NC_021909	GCTC	2	8	35349	35356	0 %	25 %	25 %	50 %	528834140
98	NC_021909	ACCC	2	8	36054	36061	25 %	0 %	0 %	75 %	528834142
99	NC_021909	GTTC	2	8	37152	37159	0 %	50 %	25 %	25 %	528834142
100	NC_021909	GCAA	2	8	37173	37180	50 %	0 %	25 %	25 %	528834142
101	NC_021909	GTGG	2	8	37339	37346	0 %	25 %	75 %	0 %	528834142
102	NC_021909	GAAG	2	8	38054	38061	50 %	0 %	50 %	0 %	528834144
103	NC_021909	TTCC	2	8	38105	38112	0 %	50 %	0 %	50 %	528834144
104	NC_021909	ACTG	2	8	39456	39463	25 %	25 %	25 %	25 %	528834147
105	NC_021909	AGGA	2	8	39811	39818	50 %	0 %	50 %	0 %	528834148
106	NC_021909	GCCG	2	8	40223	40230	0 %	0 %	50 %	50 %	528834148
107	NC_021909	CCGC	2	8	40689	40696	0 %	0 %	25 %	75 %	528834149
108	NC_021909	GCCG	2	8	41068	41075	0 %	0 %	50 %	50 %	528834150
109	NC_021909	GCGA	2	8	41268	41275	25 %	0 %	50 %	25 %	528834150
110	NC_021909	GAGC	2	8	41596	41603	25 %	0 %	50 %	25 %	528834150
111	NC_021909	CGTC	2	8	41629	41636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021909	TCGC	2	8	42175	42182	0 %	25 %	25 %	50 %	528834152
113	NC_021909	CGAT	2	8	42842	42849	25 %	25 %	25 %	25 %	528834152
114	NC_021909	GAAC	2	8	42921	42928	50 %	0 %	25 %	25 %	528834153
115	NC_021909	GGAA	2	8	43078	43085	50 %	0 %	50 %	0 %	528834153
116	NC_021909	CATG	2	8	43443	43450	25 %	25 %	25 %	25 %	528834154
117	NC_021909	GCTC	2	8	44127	44134	0 %	25 %	25 %	50 %	528834155
118	NC_021909	CGAT	2	8	44313	44320	25 %	25 %	25 %	25 %	528834155
119	NC_021909	TGCG	2	8	44340	44347	0 %	25 %	50 %	25 %	528834155
120	NC_021909	GGCC	2	8	44631	44638	0 %	0 %	50 %	50 %	528834155
121	NC_021909	GATA	2	8	45511	45518	50 %	25 %	25 %	0 %	528834155
122	NC_021909	CGGA	2	8	45599	45606	25 %	0 %	50 %	25 %	528834155
123	NC_021909	CAAC	2	8	45616	45623	50 %	0 %	0 %	50 %	528834155
124	NC_021909	GGCT	2	8	46003	46010	0 %	25 %	50 %	25 %	528834156
125	NC_021909	TCCA	2	8	46033	46040	25 %	25 %	0 %	50 %	528834156
126	NC_021909	GCGA	2	8	46792	46799	25 %	0 %	50 %	25 %	528834157
127	NC_021909	GATC	2	8	47028	47035	25 %	25 %	25 %	25 %	528834157
128	NC_021909	GGAA	2	8	47493	47500	50 %	0 %	50 %	0 %	528834157
129	NC_021909	ATCA	2	8	47848	47855	50 %	25 %	0 %	25 %	528834158
130	NC_021909	CATA	2	8	48124	48131	50 %	25 %	0 %	25 %	528834158
131	NC_021909	TCCT	2	8	48235	48242	0 %	50 %	0 %	50 %	528834158
132	NC_021909	AGCC	2	8	48328	48335	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
133	NC_021909	GTAT	2	8	48502	48509	25 %	50 %	25 %	0 %	528834158
134	NC_021909	TCGG	2	8	48556	48563	0 %	25 %	50 %	25 %	528834158
135	NC_021909	GAAA	2	8	48749	48756	75 %	0 %	25 %	0 %	528834158
136	NC_021909	GCCA	2	8	49067	49074	25 %	0 %	25 %	50 %	528834158
137	NC_021909	CACC	2	8	49242	49249	25 %	0 %	0 %	75 %	528834158
138	NC_021909	CGTC	2	8	49472	49479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021909	ATAA	2	8	49588	49595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021909	CTCA	2	8	49849	49856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021909	GGCC	2	8	50400	50407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021909	GCTC	2	8	50640	50647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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262	NC_021909	ACGC	2	8	92991	92998	25 %	0 %	25 %	50 %	528834205
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281	NC_021909	CGAG	2	8	99923	99930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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