MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 6861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	CGG	3	9	254	262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834106
2	NC_021909	CGA	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834106
3	NC_021909	GCG	2	6	351	356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834106
4	NC_021909	CAG	2	6	363	368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834106
5	NC_021909	CCT	2	6	446	451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834106
6	NC_021909	GAG	2	6	468	473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834106
7	NC_021909	GGC	2	6	507	512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834106
8	NC_021909	GCT	2	6	629	634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834107
9	NC_021909	TTG	2	6	644	649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834107
10	NC_021909	CAG	2	6	762	767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834107
11	NC_021909	CGT	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834107
12	NC_021909	GCA	2	6	830	835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834107
13	NC_021909	TGT	2	6	1036	1041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834107
14	NC_021909	CTG	2	6	1049	1054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834107
15	NC_021909	CCG	4	12	1240	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834107
16	NC_021909	AGC	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834107
17	NC_021909	CGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834108
18	NC_021909	GCC	2	6	1712	1717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834108
19	NC_021909	TGT	2	6	1776	1781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834108
20	NC_021909	TGC	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834108
21	NC_021909	GCC	2	6	2068	2073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834108
22	NC_021909	GTG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834108
23	NC_021909	CGG	2	6	2280	2285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834108
24	NC_021909	GTC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834109
25	NC_021909	GAG	3	9	3218	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834109
26	NC_021909	CTT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834109
27	NC_021909	AGC	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834109
28	NC_021909	TTA	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528834109
29	NC_021909	CCG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834109
30	NC_021909	GGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834109
31	NC_021909	AGC	2	6	3585	3590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834109
32	NC_021909	GGA	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834109
33	NC_021909	AGG	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834109
34	NC_021909	AGT	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834109
35	NC_021909	CGG	2	6	4063	4068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834109
36	NC_021909	GAC	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834109
37	NC_021909	CGG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834109
38	NC_021909	TGG	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528834109
39	NC_021909	CGA	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834109
40	NC_021909	GGC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834109
41	NC_021909	AAG	2	6	4664	4669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834109
42	NC_021909	TGA	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834109
43	NC_021909	CGA	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834109
44	NC_021909	GCC	2	6	4913	4918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834109
45	NC_021909	ACC	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834110
46	NC_021909	ACC	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834110
47	NC_021909	GGC	2	6	5106	5111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834110
48	NC_021909	TGC	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834110
49	NC_021909	GAT	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834110
50	NC_021909	GCG	2	6	5171	5176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834110
51	NC_021909	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528834110
52	NC_021909	GCT	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834110
53	NC_021909	CGA	2	6	5313	5318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834110
54	NC_021909	GAG	2	6	5381	5386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834110
55	NC_021909	GAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834110
56	NC_021909	GTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834110
57	NC_021909	AGG	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834110
58	NC_021909	CGA	2	6	5547	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834110
59	NC_021909	CGA	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834110
60	NC_021909	GGC	2	6	5628	5633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834110
61	NC_021909	CGA	3	9	5860	5868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
62	NC_021909	GCT	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834111
63	NC_021909	GGC	2	6	6109	6114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834111
64	NC_021909	GCA	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
65	NC_021909	CGA	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
66	NC_021909	TCG	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834111
67	NC_021909	ACG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
68	NC_021909	CGA	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
69	NC_021909	GGC	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834111
70	NC_021909	CTT	2	6	6522	6527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834111
71	NC_021909	GAG	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834111
72	NC_021909	CGC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834111
73	NC_021909	CTC	2	6	6664	6669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834111
74	NC_021909	GCA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
75	NC_021909	TCG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834111
76	NC_021909	GAC	3	9	6728	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834111
77	NC_021909	GGA	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834111
78	NC_021909	GCC	2	6	6820	6825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834111
79	NC_021909	GAA	2	6	6916	6921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528834111
80	NC_021909	GCT	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834111
81	NC_021909	CCT	2	6	6936	6941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834111
82	NC_021909	CTG	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834112
83	NC_021909	CGC	2	6	7097	7102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834112
84	NC_021909	GCC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834112
85	NC_021909	ACG	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834112
86	NC_021909	GCC	2	6	7253	7258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834112
87	NC_021909	CGA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834112
88	NC_021909	TTG	2	6	7285	7290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834112
89	NC_021909	ATC	2	6	7441	7446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834113
90	NC_021909	GTT	2	6	7533	7538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834113
91	NC_021909	TCA	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834113
92	NC_021909	CCA	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834113
93	NC_021909	CCG	2	6	7770	7775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
94	NC_021909	CGA	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
95	NC_021909	CAG	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
96	NC_021909	TGC	2	6	7842	7847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
97	NC_021909	GCT	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
98	NC_021909	CGA	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
99	NC_021909	TGA	2	6	8066	8071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834113
100	NC_021909	CGC	2	6	8118	8123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
101	NC_021909	GGC	2	6	8126	8131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
102	NC_021909	CGG	2	6	8163	8168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
103	NC_021909	GCA	2	6	8282	8287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
104	NC_021909	ACG	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
105	NC_021909	TCC	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834113
106	NC_021909	ACT	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834113
107	NC_021909	CGC	2	6	8447	8452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
108	NC_021909	CAG	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
109	NC_021909	GGA	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834113
110	NC_021909	GCA	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
111	NC_021909	ATC	2	6	8596	8601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834113
112	NC_021909	CGC	2	6	8756	8761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
113	NC_021909	CGT	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
114	NC_021909	CGG	2	6	8805	8810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
115	NC_021909	CCT	2	6	8897	8902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834113
116	NC_021909	TGT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834113
117	NC_021909	GCC	2	6	9004	9009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
118	NC_021909	CAT	2	6	9012	9017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834113
119	NC_021909	GCT	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
120	NC_021909	CAC	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834113
121	NC_021909	CAA	2	6	9247	9252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834113
122	NC_021909	GCG	2	6	9355	9360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
123	NC_021909	CGT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
124	NC_021909	AGC	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
125	NC_021909	GGC	2	6	9552	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
126	NC_021909	ACG	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
127	NC_021909	GGC	2	6	9786	9791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
128	NC_021909	AGC	2	6	9818	9823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
129	NC_021909	TTC	2	6	9826	9831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834113
130	NC_021909	TCT	2	6	9837	9842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834113
131	NC_021909	CTC	2	6	9865	9870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834113
132	NC_021909	TGC	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
133	NC_021909	CGC	2	6	10004	10009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
134	NC_021909	GAG	2	6	10060	10065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834113
135	NC_021909	CGA	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
136	NC_021909	CGC	2	6	10264	10269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834113
137	NC_021909	GGA	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834113
138	NC_021909	CGA	2	6	10341	10346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834113
139	NC_021909	CGG	2	6	10398	10403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
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142	NC_021909	GAT	2	6	10554	10559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834113
143	NC_021909	CCA	2	6	10562	10567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834113
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145	NC_021909	CGG	2	6	10653	10658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834113
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159	NC_021909	GTT	2	6	11388	11393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834113
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162	NC_021909	TCG	2	6	11468	11473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834113
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220	NC_021909	TTC	2	6	15906	15911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834120
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223	NC_021909	GCT	2	6	16061	16066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834120
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234	NC_021909	GGA	2	6	17220	17225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834123
235	NC_021909	TCC	3	9	17240	17248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528834123
236	NC_021909	ATG	2	6	17257	17262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834123
237	NC_021909	TAG	2	6	17351	17356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834123
238	NC_021909	TAC	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834124
239	NC_021909	TTG	2	6	17990	17995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528834124
240	NC_021909	CAT	2	6	18052	18057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834124
241	NC_021909	CGA	2	6	18163	18168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834124
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243	NC_021909	CGG	2	6	18234	18239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834124
244	NC_021909	CGG	2	6	18298	18303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834124
245	NC_021909	ATC	2	6	18314	18319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834124
246	NC_021909	CAA	2	6	19526	19531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834125
247	NC_021909	CCG	2	6	19844	19849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834126
248	NC_021909	TCG	2	6	19949	19954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834126
249	NC_021909	CGT	2	6	19992	19997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834126
250	NC_021909	TGA	2	6	20153	20158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834126
251	NC_021909	GAC	2	6	20317	20322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834126
252	NC_021909	GGC	2	6	20576	20581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834127
253	NC_021909	TCA	2	6	20606	20611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834127
254	NC_021909	ACA	2	6	20686	20691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528834127
255	NC_021909	TCG	2	6	20692	20697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834127
256	NC_021909	TTC	2	6	21219	21224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834128
257	NC_021909	CAG	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834128
258	NC_021909	TTC	2	6	21301	21306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528834128
259	NC_021909	GGC	2	6	21334	21339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834128
260	NC_021909	GCC	2	6	21346	21351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834128
261	NC_021909	CGA	2	6	21396	21401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834128
262	NC_021909	TGC	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834128
263	NC_021909	ATC	2	6	21514	21519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834128
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266	NC_021909	CGC	3	9	21961	21969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834128
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273	NC_021909	CGA	2	6	22373	22378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834129
274	NC_021909	CGG	3	9	22409	22417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834129
275	NC_021909	CGC	2	6	22443	22448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834129
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281	NC_021909	GCG	2	6	22909	22914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834130
282	NC_021909	GGC	2	6	22941	22946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834130
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285	NC_021909	TGC	2	6	23170	23175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834131
286	NC_021909	CGC	2	6	23189	23194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528834131
287	NC_021909	TCG	2	6	23208	23213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834131
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290	NC_021909	CGG	2	6	23426	23431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528834131
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358	NC_021909	TGC	2	6	27234	27239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834133
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372	NC_021909	CAT	2	6	28331	28336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528834135
373	NC_021909	ATG	2	6	28368	28373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528834135
374	NC_021909	CCA	2	6	28396	28401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528834135
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498	NC_021909	GAC	2	6	35495	35500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528834140
499	NC_021909	GTC	2	6	35668	35673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528834141
500	NC_021909	GAG	2	6	35740	35745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528834141

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