MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	A	8	8	1678	1685	100 %	0 %	0 %	0 %	528834108
2	NC_021909	T	6	6	2136	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	528834108
3	NC_021909	T	6	6	16191	16196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021909	T	6	6	18982	18987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021909	G	6	6	19028	19033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021909	T	6	6	22465	22470	0 %	100 %	0 %	0 %	528834129
7	NC_021909	G	6	6	22570	22575	0 %	0 %	100 %	0 %	528834129
8	NC_021909	T	6	6	22878	22883	0 %	100 %	0 %	0 %	528834130
9	NC_021909	G	6	6	25725	25730	0 %	0 %	100 %	0 %	528834132
10	NC_021909	C	7	7	30595	30601	0 %	0 %	0 %	100 %	528834138
11	NC_021909	T	6	6	36157	36162	0 %	100 %	0 %	0 %	528834142
12	NC_021909	G	6	6	40116	40121	0 %	0 %	100 %	0 %	528834148
13	NC_021909	A	7	7	46148	46154	100 %	0 %	0 %	0 %	528834156
14	NC_021909	A	6	6	46744	46749	100 %	0 %	0 %	0 %	528834157
15	NC_021909	A	6	6	48600	48605	100 %	0 %	0 %	0 %	528834158
16	NC_021909	A	7	7	49537	49543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021909	G	7	7	49796	49802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021909	T	6	6	53961	53966	0 %	100 %	0 %	0 %	528834162
19	NC_021909	A	6	6	55396	55401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021909	A	6	6	55934	55939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021909	T	6	6	58222	58227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021909	A	7	7	58879	58885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021909	T	6	6	59556	59561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021909	A	6	6	59680	59685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021909	G	6	6	60544	60549	0 %	0 %	100 %	0 %	528834165
26	NC_021909	T	6	6	60596	60601	0 %	100 %	0 %	0 %	528834165
27	NC_021909	T	6	6	61974	61979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021909	A	7	7	62790	62796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021909	G	6	6	63411	63416	0 %	0 %	100 %	0 %	528834168
30	NC_021909	A	6	6	64909	64914	100 %	0 %	0 %	0 %	528834170
31	NC_021909	C	6	6	68046	68051	0 %	0 %	0 %	100 %	528834173
32	NC_021909	A	6	6	68785	68790	100 %	0 %	0 %	0 %	528834174
33	NC_021909	T	6	6	70406	70411	0 %	100 %	0 %	0 %	528834176
34	NC_021909	A	6	6	70679	70684	100 %	0 %	0 %	0 %	528834176
35	NC_021909	T	7	7	73615	73621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021909	C	6	6	84207	84212	0 %	0 %	0 %	100 %	528834188
37	NC_021909	A	7	7	96385	96391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021909	T	6	6	102004	102009	0 %	100 %	0 %	0 %	528834211
39	NC_021909	A	6	6	104032	104037	100 %	0 %	0 %	0 %	528834212
40	NC_021909	T	6	6	109887	109892	0 %	100 %	0 %	0 %	528834219
41	NC_021909	A	6	6	116725	116730	100 %	0 %	0 %	0 %	528834225
42	NC_021909	A	6	6	118073	118078	100 %	0 %	0 %	0 %	528834228
43	NC_021909	C	6	6	124473	124478	0 %	0 %	0 %	100 %	528834234
44	NC_021909	A	9	9	126069	126077	100 %	0 %	0 %	0 %	528834236
45	NC_021909	T	7	7	127837	127843	0 %	100 %	0 %	0 %	528834237
46	NC_021909	A	6	6	132632	132637	100 %	0 %	0 %	0 %	528834242
47	NC_021909	G	6	6	135471	135476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021909	G	6	6	136284	136289	0 %	0 %	100 %	0 %	528834247
49	NC_021909	C	6	6	137474	137479	0 %	0 %	0 %	100 %	528834249
50	NC_021909	T	7	7	140215	140221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021909	C	6	6	143869	143874	0 %	0 %	0 %	100 %	528834255
52	NC_021909	A	6	6	144384	144389	100 %	0 %	0 %	0 %	528834255
53	NC_021909	T	6	6	151043	151048	0 %	100 %	0 %	0 %	528834263
54	NC_021909	T	6	6	156846	156851	0 %	100 %	0 %	0 %	528834269
55	NC_021909	C	6	6	162052	162057	0 %	0 %	0 %	100 %	528834276
56	NC_021909	G	6	6	166673	166678	0 %	0 %	100 %	0 %	528834281
57	NC_021909	A	6	6	167996	168001	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
58	NC_021909	A	6	6	168004	168009	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
59	NC_021909	A	7	7	168250	168256	100 %	0 %	0 %	0 %	528834281
60	NC_021909	T	6	6	169324	169329	0 %	100 %	0 %	0 %	528834282
61	NC_021909	T	6	6	172174	172179	0 %	100 %	0 %	0 %	528834284
62	NC_021909	A	6	6	172325	172330	100 %	0 %	0 %	0 %	528834284
63	NC_021909	A	6	6	176516	176521	100 %	0 %	0 %	0 %	528834288
64	NC_021909	G	6	6	178046	178051	0 %	0 %	100 %	0 %	528834289
65	NC_021909	C	6	6	179164	179169	0 %	0 %	0 %	100 %	528834289
66	NC_021909	A	6	6	179760	179765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021909	C	7	7	182648	182654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_021909	G	6	6	183002	183007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021909	A	6	6	194114	194119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021909	G	6	6	194937	194942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021909	A	6	6	198459	198464	100 %	0 %	0 %	0 %	528834296
72	NC_021909	G	7	7	201173	201179	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
73	NC_021909	G	6	6	203890	203895	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
74	NC_021909	G	6	6	204507	204512	0 %	0 %	100 %	0 %	528834300
75	NC_021909	A	6	6	204919	204924	100 %	0 %	0 %	0 %	528834300
76	NC_021909	T	6	6	209257	209262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021909	G	6	6	210445	210450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021909	C	6	6	215607	215612	0 %	0 %	0 %	100 %	528834307
79	NC_021909	A	6	6	216119	216124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021909	A	7	7	220056	220062	100 %	0 %	0 %	0 %	528834310
81	NC_021909	G	6	6	221236	221241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021909	T	7	7	227525	227531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021909	A	6	6	228342	228347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021909	T	7	7	231302	231308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021909	G	6	6	231910	231915	0 %	0 %	100 %	0 %	528834315
86	NC_021909	T	6	6	235587	235592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021909	T	6	6	235942	235947	0 %	100 %	0 %	0 %	528834319
88	NC_021909	G	6	6	239310	239315	0 %	0 %	100 %	0 %	528834322
89	NC_021909	C	6	6	240760	240765	0 %	0 %	0 %	100 %	528834324
90	NC_021909	T	6	6	241757	241762	0 %	100 %	0 %	0 %	528834325
91	NC_021909	T	6	6	242459	242464	0 %	100 %	0 %	0 %	528834326
92	NC_021909	G	6	6	242601	242606	0 %	0 %	100 %	0 %	528834326
93	NC_021909	G	6	6	243594	243599	0 %	0 %	100 %	0 %	528834326
94	NC_021909	G	6	6	245239	245244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021909	G	6	6	248400	248405	0 %	0 %	100 %	0 %	528834327
96	NC_021909	T	6	6	251076	251081	0 %	100 %	0 %	0 %	528834329
97	NC_021909	C	7	7	255208	255214	0 %	0 %	0 %	100 %	528834331
98	NC_021909	A	6	6	257605	257610	100 %	0 %	0 %	0 %	528834333
99	NC_021909	A	6	6	263987	263992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021909	T	6	6	264858	264863	0 %	100 %	0 %	0 %	528834340
101	NC_021909	T	6	6	267288	267293	0 %	100 %	0 %	0 %	528834342
102	NC_021909	C	6	6	270080	270085	0 %	0 %	0 %	100 %	528834344
103	NC_021909	T	6	6	271801	271806	0 %	100 %	0 %	0 %	528834346
104	NC_021909	A	6	6	274479	274484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021909	A	6	6	282729	282734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021909	T	6	6	285038	285043	0 %	100 %	0 %	0 %	528834356
107	NC_021909	T	6	6	288068	288073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021909	A	6	6	289939	289944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021909	T	9	9	290237	290245	0 %	100 %	0 %	0 %	528834359
110	NC_021909	T	6	6	293114	293119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021909	G	6	6	295709	295714	0 %	0 %	100 %	0 %	528834364
112	NC_021909	C	6	6	296771	296776	0 %	0 %	0 %	100 %	528834365
113	NC_021909	A	6	6	303787	303792	100 %	0 %	0 %	0 %	528834369
114	NC_021909	T	6	6	304034	304039	0 %	100 %	0 %	0 %	528834370
115	NC_021909	A	6	6	305200	305205	100 %	0 %	0 %	0 %	528834371
116	NC_021909	T	7	7	305565	305571	0 %	100 %	0 %	0 %	528834372
117	NC_021909	T	6	6	311547	311552	0 %	100 %	0 %	0 %	528834378
118	NC_021909	A	6	6	315282	315287	100 %	0 %	0 %	0 %	528834381
119	NC_021909	A	6	6	316792	316797	100 %	0 %	0 %	0 %	528834383
120	NC_021909	G	7	7	317391	317397	0 %	0 %	100 %	0 %	528834384
121	NC_021909	T	6	6	318310	318315	0 %	100 %	0 %	0 %	528834385
122	NC_021909	T	6	6	321541	321546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021909	A	7	7	322357	322363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021909	G	6	6	325668	325673	0 %	0 %	100 %	0 %	528834392
125	NC_021909	T	6	6	327026	327031	0 %	100 %	0 %	0 %	528834394
126	NC_021909	A	6	6	329952	329957	100 %	0 %	0 %	0 %	528834399
127	NC_021909	T	6	6	333527	333532	0 %	100 %	0 %	0 %	528834401
128	NC_021909	A	6	6	337042	337047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021909	T	7	7	341918	341924	0 %	100 %	0 %	0 %	528834410
130	NC_021909	A	6	6	344007	344012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021909	T	6	6	344859	344864	0 %	100 %	0 %	0 %	528834413
132	NC_021909	A	7	7	345795	345801	100 %	0 %	0 %	0 %	528834414
133	NC_021909	A	6	6	347380	347385	100 %	0 %	0 %	0 %	528834415
134	NC_021909	A	6	6	347757	347762	100 %	0 %	0 %	0 %	528834416
135	NC_021909	A	6	6	353481	353486	100 %	0 %	0 %	0 %	528834421
136	NC_021909	T	6	6	354166	354171	0 %	100 %	0 %	0 %	528834423
137	NC_021909	C	6	6	363887	363892	0 %	0 %	0 %	100 %	528834433
138	NC_021909	A	6	6	368421	368426	100 %	0 %	0 %	0 %	528834438
139	NC_021909	A	6	6	370537	370542	100 %	0 %	0 %	0 %	528834440
140	NC_021909	A	6	6	374883	374888	100 %	0 %	0 %	0 %	528834443
141	NC_021909	A	6	6	376004	376009	100 %	0 %	0 %	0 %	528834445
142	NC_021909	A	7	7	376579	376585	100 %	0 %	0 %	0 %	528834446
143	NC_021909	A	6	6	377891	377896	100 %	0 %	0 %	0 %	528834447
144	NC_021909	A	6	6	380509	380514	100 %	0 %	0 %	0 %	528834449
145	NC_021909	T	6	6	382479	382484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021909	T	6	6	382493	382498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021909	C	6	6	383244	383249	0 %	0 %	0 %	100 %	528834452
148	NC_021909	C	6	6	384735	384740	0 %	0 %	0 %	100 %	528834453
149	NC_021909	A	6	6	385666	385671	100 %	0 %	0 %	0 %	528834453
150	NC_021909	T	6	6	386701	386706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021909	T	6	6	387510	387515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021909	A	6	6	388254	388259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021909	C	6	6	388808	388813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
154	NC_021909	C	6	6	390737	390742	0 %	0 %	0 %	100 %	528834459
155	NC_021909	T	6	6	391247	391252	0 %	100 %	0 %	0 %	528834460
156	NC_021909	A	6	6	392277	392282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021909	A	7	7	393008	393014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021909	A	6	6	396693	396698	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
159	NC_021909	A	6	6	396911	396916	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
160	NC_021909	A	6	6	397135	397140	100 %	0 %	0 %	0 %	528834464
161	NC_021909	C	6	6	397265	397270	0 %	0 %	0 %	100 %	528834464
162	NC_021909	A	6	6	397668	397673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021909	T	6	6	398430	398435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021909	T	6	6	400247	400252	0 %	100 %	0 %	0 %	528834467
165	NC_021909	A	6	6	402396	402401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021909	A	6	6	402904	402909	100 %	0 %	0 %	0 %	528834468
167	NC_021909	T	6	6	405176	405181	0 %	100 %	0 %	0 %	528834471
168	NC_021909	T	6	6	406472	406477	0 %	100 %	0 %	0 %	528834472
169	NC_021909	A	6	6	406825	406830	100 %	0 %	0 %	0 %	528834472
170	NC_021909	A	7	7	411115	411121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021909	T	7	7	413329	413335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021909	A	7	7	414665	414671	100 %	0 %	0 %	0 %	528834481
173	NC_021909	G	7	7	415378	415384	0 %	0 %	100 %	0 %	528834482
174	NC_021909	T	6	6	415636	415641	0 %	100 %	0 %	0 %	528834482
175	NC_021909	A	6	6	416849	416854	100 %	0 %	0 %	0 %	528834482
176	NC_021909	T	6	6	419681	419686	0 %	100 %	0 %	0 %	528834486
177	NC_021909	T	7	7	420034	420040	0 %	100 %	0 %	0 %	528834486
178	NC_021909	G	6	6	434835	434840	0 %	0 %	100 %	0 %	528834507
179	NC_021909	T	6	6	436824	436829	0 %	100 %	0 %	0 %	528834509
180	NC_021909	A	6	6	437283	437288	100 %	0 %	0 %	0 %	528834510
181	NC_021909	T	6	6	437936	437941	0 %	100 %	0 %	0 %	528834510
182	NC_021909	A	7	7	445556	445562	100 %	0 %	0 %	0 %	528834518
183	NC_021909	G	6	6	445666	445671	0 %	0 %	100 %	0 %	528834518
184	NC_021909	T	6	6	445765	445770	0 %	100 %	0 %	0 %	528834518
185	NC_021909	C	6	6	446114	446119	0 %	0 %	0 %	100 %	528834518
186	NC_021909	A	6	6	448783	448788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021909	T	6	6	452213	452218	0 %	100 %	0 %	0 %	528834523
188	NC_021909	C	6	6	453427	453432	0 %	0 %	0 %	100 %	528834525
189	NC_021909	C	6	6	456293	456298	0 %	0 %	0 %	100 %	528834529
190	NC_021909	T	6	6	459489	459494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021909	G	6	6	464924	464929	0 %	0 %	100 %	0 %	528834538
192	NC_021909	T	7	7	468231	468237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021909	A	6	6	468288	468293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021909	A	6	6	468373	468378	100 %	0 %	0 %	0 %	528834541
195	NC_021909	A	6	6	470442	470447	100 %	0 %	0 %	0 %	528834543
196	NC_021909	T	6	6	476342	476347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021909	A	7	7	477158	477164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021909	T	6	6	481992	481997	0 %	100 %	0 %	0 %	528834552
199	NC_021909	T	6	6	485450	485455	0 %	100 %	0 %	0 %	528834556
200	NC_021909	C	6	6	486475	486480	0 %	0 %	0 %	100 %	528834557
201	NC_021909	C	6	6	491261	491266	0 %	0 %	0 %	100 %	528834559
202	NC_021909	C	6	6	492420	492425	0 %	0 %	0 %	100 %	528834560
203	NC_021909	A	6	6	495734	495739	100 %	0 %	0 %	0 %	528834562
204	NC_021909	C	6	6	503950	503955	0 %	0 %	0 %	100 %	528834570
205	NC_021909	G	6	6	512182	512187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
206	NC_021909	C	7	7	515254	515260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
207	NC_021909	A	6	6	517188	517193	100 %	0 %	0 %	0 %	528834585
208	NC_021909	T	6	6	519736	519741	0 %	100 %	0 %	0 %	528834586
209	NC_021909	C	6	6	520799	520804	0 %	0 %	0 %	100 %	528834587
210	NC_021909	A	6	6	523260	523265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_021909	C	6	6	530662	530667	0 %	0 %	0 %	100 %	528834598
212	NC_021909	G	6	6	534814	534819	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
213	NC_021909	C	8	8	547837	547844	0 %	0 %	0 %	100 %	528834616
214	NC_021909	T	6	6	556564	556569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_021909	A	6	6	565927	565932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_021909	G	6	6	568037	568042	0 %	0 %	100 %	0 %	528834641
217	NC_021909	T	7	7	569838	569844	0 %	100 %	0 %	0 %	528834643
218	NC_021909	A	7	7	572666	572672	100 %	0 %	0 %	0 %	528834646
219	NC_021909	C	7	7	572972	572978	0 %	0 %	0 %	100 %	528834646
220	NC_021909	T	6	6	573743	573748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_021909	C	6	6	574522	574527	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
222	NC_021909	C	6	6	574529	574534	0 %	0 %	0 %	100 %	528834648
223	NC_021909	A	6	6	574586	574591	100 %	0 %	0 %	0 %	528834648
224	NC_021909	G	6	6	578045	578050	0 %	0 %	100 %	0 %	528834651
225	NC_021909	G	7	7	578206	578212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
226	NC_021909	T	6	6	581220	581225	0 %	100 %	0 %	0 %	528834653
227	NC_021909	A	6	6	581454	581459	100 %	0 %	0 %	0 %	528834654
228	NC_021909	A	7	7	587091	587097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_021909	T	6	6	587306	587311	0 %	100 %	0 %	0 %	528834660
230	NC_021909	T	6	6	587396	587401	0 %	100 %	0 %	0 %	528834660
231	NC_021909	T	6	6	588886	588891	0 %	100 %	0 %	0 %	528834661
232	NC_021909	A	6	6	604596	604601	100 %	0 %	0 %	0 %	528834673
233	NC_021909	T	6	6	605162	605167	0 %	100 %	0 %	0 %	528834674
234	NC_021909	A	6	6	608142	608147	100 %	0 %	0 %	0 %	528834679
235	NC_021909	T	6	6	609100	609105	0 %	100 %	0 %	0 %	528834681
236	NC_021909	C	6	6	610930	610935	0 %	0 %	0 %	100 %	528834682
237	NC_021909	A	6	6	613977	613982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.