Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 265

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_021908AGGGGA21252053133.33 %0 %66.67 %0 %528832487
2NC_021908AGAGCG2121492150333.33 %0 %50 %16.67 %528832488
3NC_021908CGGCGA2124898490916.67 %0 %50 %33.33 %528832493
4NC_021908ACGGCG2125428543916.67 %0 %50 %33.33 %528832493
5NC_021908GCTGGC21213875138860 %16.67 %50 %33.33 %528832496
6NC_021908GGCGCC21214170141810 %0 %50 %50 %528832496
7NC_021908GGTCGA212143771438816.67 %16.67 %50 %16.67 %528832496
8NC_021908GGCATG212190581906916.67 %16.67 %50 %16.67 %528832499
9NC_021908GCTGGC21225052250630 %16.67 %50 %33.33 %528832505
10NC_021908GATGGC212262892630016.67 %16.67 %50 %16.67 %528832505
11NC_021908GCCGAT212281122812316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832506
12NC_021908GCCGTT21229249292600 %33.33 %33.33 %33.33 %528832507
13NC_021908CTCGGC21231582315930 %16.67 %33.33 %50 %528832509
14NC_021908CGGCGC21233607336180 %0 %50 %50 %528832510
15NC_021908CCCGGC21234358343690 %0 %33.33 %66.67 %528832511
16NC_021908GCCGGT21237017370280 %16.67 %50 %33.33 %528832515
17NC_021908CCAGAA212374103742150 %0 %16.67 %33.33 %528832515
18NC_021908CCAGAT212379443795533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832515
19NC_021908GCGCCG21238882388930 %0 %50 %50 %528832516
20NC_021908TCGGCG21239220392310 %16.67 %50 %33.33 %528832516
21NC_021908GGCCGA212496054961616.67 %0 %50 %33.33 %528832523
22NC_021908TGACGC212498764988716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832524
23NC_021908AGGCCG212499354994616.67 %0 %50 %33.33 %528832524
24NC_021908ATCGAG212505885059933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %528832524
25NC_021908GTGAAG212534895350033.33 %16.67 %50 %0 %528832526
26NC_021908GCGCTG21254324543350 %16.67 %50 %33.33 %528832527
27NC_021908CTTGCG21254411544220 %33.33 %33.33 %33.33 %528832527
28NC_021908CCAGAC212546835469433.33 %0 %16.67 %50 %528832527
29NC_021908CCGGGG21256024560350 %0 %66.67 %33.33 %528832528
30NC_021908GCCTGG21256338563490 %16.67 %50 %33.33 %528832528
31NC_021908TCGCCG21256593566040 %16.67 %33.33 %50 %528832528
32NC_021908CCACCT212578485785916.67 %16.67 %0 %66.67 %528832529
33NC_021908GTGCTG21258840588510 %33.33 %50 %16.67 %528832529
34NC_021908CTGCCG21260894609050 %16.67 %33.33 %50 %528832531
35NC_021908CCGGGC21263872638830 %0 %50 %50 %528832534
36NC_021908CGCCAG212640886409916.67 %0 %33.33 %50 %528832534
37NC_021908GAAAAT212645476455866.67 %16.67 %16.67 %0 %528832534
38NC_021908GAGGTC212649276493816.67 %16.67 %50 %16.67 %528832535
39NC_021908CGCCGG21265342653530 %0 %50 %50 %528832535
40NC_021908AGTGGC212686156862616.67 %16.67 %50 %16.67 %528832539
41NC_021908CGGTGA212708467085716.67 %16.67 %50 %16.67 %528832541
42NC_021908AGGAGC212742547426533.33 %0 %50 %16.67 %528832546
43NC_021908CGCCGA212762257623616.67 %0 %33.33 %50 %528832549
44NC_021908GTCGCC21280936809470 %16.67 %33.33 %50 %528832555
45NC_021908TCGATT212810748108516.67 %50 %16.67 %16.67 %528832555
46NC_021908GCAGGC212814798149016.67 %0 %50 %33.33 %528832556
47NC_021908GGCGGT21281875818860 %16.67 %66.67 %16.67 %528832556
48NC_021908GAAGGC212821108212133.33 %0 %50 %16.67 %528832556
49NC_021908GGCCTC21285221852320 %16.67 %33.33 %50 %528832558
50NC_021908GGGCGA212908929090316.67 %0 %66.67 %16.67 %528832563
51NC_021908CTCCGG21292734927450 %16.67 %33.33 %50 %528832566
52NC_021908GGCGCA212947079471816.67 %0 %50 %33.33 %528832567
53NC_021908GCCGAC212964679647816.67 %0 %33.33 %50 %528832570
54NC_021908GCAGGC212968689687916.67 %0 %50 %33.33 %528832570
55NC_021908GCTTCT21299763997740 %50 %16.67 %33.33 %528832572
56NC_021908GTCTCG21299837998480 %33.33 %33.33 %33.33 %528832573
57NC_021908ATGCCG21210263610264716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832575
58NC_021908TCCTGA21210632610633716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832578
59NC_021908CCATCG21210749410750516.67 %16.67 %16.67 %50 %528832579
60NC_021908TCCGGC2121075141075250 %16.67 %33.33 %50 %528832579
61NC_021908CCAGCG21210786410787516.67 %0 %33.33 %50 %528832579
62NC_021908CTATGT21210805910807016.67 %50 %16.67 %16.67 %528832579
63NC_021908TCCGGC2121083481083590 %16.67 %33.33 %50 %528832579
64NC_021908CCAGCG21210867710868816.67 %0 %33.33 %50 %528832579
65NC_021908CGTCAT21210887510888616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832579
66NC_021908TCGGCG2121093601093710 %16.67 %50 %33.33 %528832580
67NC_021908CGACCA21211097511098633.33 %0 %16.67 %50 %528832581
68NC_021908GAAGAT21212055612056750 %16.67 %33.33 %0 %528832590
69NC_021908GGCATC21212204612205716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832591
70NC_021908GAGAGC21212383112384233.33 %0 %50 %16.67 %528832593
71NC_021908CAGCTG21212577112578216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832594
72NC_021908GCAGGC21212612312613416.67 %0 %50 %33.33 %528832595
73NC_021908CGGCAA21212732612733733.33 %0 %33.33 %33.33 %528832595
74NC_021908CTCGGC2121274101274210 %16.67 %33.33 %50 %528832595
75NC_021908AGGGAT21213154513155633.33 %16.67 %50 %0 %528832599
76NC_021908GATGCC21213260713261816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832600
77NC_021908GGCGAT21213323013324116.67 %16.67 %50 %16.67 %528832601
78NC_021908CATGGC21213339213340316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832601
79NC_021908CGAGGC21213345413346516.67 %0 %50 %33.33 %528832601
80NC_021908AGCCCG21213362113363216.67 %0 %33.33 %50 %528832601
81NC_021908TGCCGA21213631913633016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832604
82NC_021908GCCGAG21213875013876116.67 %0 %50 %33.33 %528832605
83NC_021908CCGGCA21213997213998316.67 %0 %33.33 %50 %528832605
84NC_021908ATGCCG21214104314105416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832605
85NC_021908TGCCGA21214195514196616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832606
86NC_021908CGGGAT21214233414234516.67 %16.67 %50 %16.67 %528832607
87NC_021908GGCAAG21214458314459433.33 %0 %50 %16.67 %528832609
88NC_021908TGCCGA21214757014758116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832611
89NC_021908CGGCAG21215104515105616.67 %0 %50 %33.33 %528832613
90NC_021908CAGCGG21215339115340216.67 %0 %50 %33.33 %528832616
91NC_021908GACGCT21215349015350116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832616
92NC_021908CCGAAG21215363215364333.33 %0 %33.33 %33.33 %528832616
93NC_021908CACCGC21215486115487216.67 %0 %16.67 %66.67 %528832616
94NC_021908TCGATC21215635815636916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832617
95NC_021908CTTCTG2121566111566220 %50 %16.67 %33.33 %528832618
96NC_021908GCTTCG2121570521570630 %33.33 %33.33 %33.33 %528832618
97NC_021908GCCGAG21215738515739616.67 %0 %50 %33.33 %528832618
98NC_021908GTCACC21215807215808316.67 %16.67 %16.67 %50 %528832618
99NC_021908TGGCGC2121591731591840 %16.67 %50 %33.33 %528832619
100NC_021908AGGCCA21216190816191933.33 %0 %33.33 %33.33 %528832620
101NC_021908GCTGAT21217063317064416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %528832630
102NC_021908ATGGGG21217161717162816.67 %16.67 %66.67 %0 %528832631
103NC_021908CATCGC21217447417448516.67 %16.67 %16.67 %50 %528832633
104NC_021908CGCCTG2121754851754960 %16.67 %33.33 %50 %528832634
105NC_021908GACGGC21217645617646716.67 %0 %50 %33.33 %528832635
106NC_021908GGCGAA21217781017782133.33 %0 %50 %16.67 %528832636
107NC_021908CCGGCG2121786601786710 %0 %50 %50 %528832636
108NC_021908TCGCCG2121802171802280 %16.67 %33.33 %50 %528832638
109NC_021908GAGCAG21218438818439933.33 %0 %50 %16.67 %528832643
110NC_021908GTCATC21218568618569716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832644
111NC_021908CCGGAT21218649918651016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832645
112NC_021908CCGCGC2121889081889190 %0 %33.33 %66.67 %528832647
113NC_021908TCCTTC2121913771913880 %50 %0 %50 %528832648
114NC_021908TTGCCG2121932231932340 %33.33 %33.33 %33.33 %528832651
115NC_021908ATATCG21220264520265633.33 %33.33 %16.67 %16.67 %528832660
116NC_021908CTCGAT21220342420343516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832660
117NC_021908CCAGGC21220479220480316.67 %0 %33.33 %50 %528832662
118NC_021908CGGTAT21220683220684316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %528832663
119NC_021908GGAAGG21220819520820633.33 %0 %66.67 %0 %528832665
120NC_021908TAAAGG21220989820990950 %16.67 %33.33 %0 %528832667
121NC_021908CAGGAT21221040721041833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %528832668
122NC_021908TCCAGC21221083821084916.67 %16.67 %16.67 %50 %528832669
123NC_021908TGTTCC2122155732155840 %50 %16.67 %33.33 %528832674
124NC_021908TCGACA21221742321743433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832676
125NC_021908ATTGCC21222198422199516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832678
126NC_021908CATAAG21222296422297550 %16.67 %16.67 %16.67 %528832678
127NC_021908CCTTTC2122274162274270 %50 %0 %50 %528832681
128NC_021908GCGCGG2122274962275070 %0 %66.67 %33.33 %528832681
129NC_021908GCCGGA21222919522920616.67 %0 %50 %33.33 %528832682
130NC_021908CGATGC21222963422964516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832683
131NC_021908ATGACG21223042023043133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %528832684
132NC_021908TCTTGC2122330872330980 %50 %16.67 %33.33 %528832686
133NC_021908CAAAGA21223738423739566.67 %0 %16.67 %16.67 %528832689
134NC_021908CGCATG21223802323803416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832689
135NC_021908CCGAGG21224180324181416.67 %0 %50 %33.33 %528832692
136NC_021908ATCGCA21224484624485733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832695
137NC_021908TTGCGT2122535672535780 %50 %33.33 %16.67 %528832704
138NC_021908AGCGGA21225359625360733.33 %0 %50 %16.67 %528832704
139NC_021908GATGGC21225857725858816.67 %16.67 %50 %16.67 %528832710
140NC_021908GCAACG21225875825876933.33 %0 %33.33 %33.33 %528832710
141NC_021908ACCGCC21225884425885516.67 %0 %16.67 %66.67 %528832710
142NC_021908GCGCAG21226014026015116.67 %0 %50 %33.33 %528832712
143NC_021908GGTGCG2122650482650590 %16.67 %66.67 %16.67 %528832717
144NC_021908GGTCTC2122666252666360 %33.33 %33.33 %33.33 %528832719
145NC_021908AGCGGC21226911626912716.67 %0 %50 %33.33 %528832722
146NC_021908CCTTTC2122798732798840 %50 %0 %50 %528832735
147NC_021908CCTATC21228069428070516.67 %33.33 %0 %50 %528832736
148NC_021908ATCGCC21228199128200216.67 %16.67 %16.67 %50 %528832737
149NC_021908CCGATC21228314728315816.67 %16.67 %16.67 %50 %528832738
150NC_021908GCCGCT2122852062852170 %16.67 %33.33 %50 %528832740
151NC_021908AGACGA21228679328680450 %0 %33.33 %16.67 %528832742
152NC_021908GCATTC21228767428768516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832743
153NC_021908TGCGCA21229074629075716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832744
154NC_021908CCTCGA21229094729095816.67 %16.67 %16.67 %50 %528832744
155NC_021908AGGAAC21229342529343650 %0 %33.33 %16.67 %528832747
156NC_021908TTCGAT21229439029440116.67 %50 %16.67 %16.67 %528832748
157NC_021908GACACC21229911729912833.33 %0 %16.67 %50 %528832752
158NC_021908CCAGAG21230609230610333.33 %0 %33.33 %33.33 %528832757
159NC_021908TTGCCG2123061293061400 %33.33 %33.33 %33.33 %528832757
160NC_021908AGCGCC21230642530643616.67 %0 %33.33 %50 %528832758
161NC_021908ATGCCG21230660530661616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832758
162NC_021908ATAGAC21230749530750650 %16.67 %16.67 %16.67 %528832758
163NC_021908GCGATG21230762530763616.67 %16.67 %50 %16.67 %528832758
164NC_021908TCAAGA21230943730944850 %16.67 %16.67 %16.67 %528832762
165NC_021908GTCGGC2123111723111830 %16.67 %50 %33.33 %528832764
166NC_021908GACGGC21231238931240016.67 %0 %50 %33.33 %528832765
167NC_021908TTCTGC2123137213137320 %50 %16.67 %33.33 %528832766
168NC_021908AGGCCG21231484331485416.67 %0 %50 %33.33 %528832768
169NC_021908CCTGAC21231715831716916.67 %16.67 %16.67 %50 %528832770
170NC_021908GCGCGT2123183003183110 %16.67 %50 %33.33 %528832771
171NC_021908GGCTGG2123212923213030 %16.67 %66.67 %16.67 %528832775
172NC_021908TGCGGC2123263033263140 %16.67 %50 %33.33 %528832779
173NC_021908AGGCCG21232697732698816.67 %0 %50 %33.33 %528832781
174NC_021908TGAAGA21232775232776350 %16.67 %33.33 %0 %528832781
175NC_021908ATCGGC21232932932934016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832783
176NC_021908AGGCCG21233074833075916.67 %0 %50 %33.33 %528832784
177NC_021908CGTTCG2123323313323420 %33.33 %33.33 %33.33 %528832785
178NC_021908CGAGGA21233284533285633.33 %0 %50 %16.67 %528832786
179NC_021908GCCGAA21233382933384033.33 %0 %33.33 %33.33 %528832786
180NC_021908TCTCGA21233866333867416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832791
181NC_021908TCGCTG2123425993426100 %33.33 %33.33 %33.33 %528832796
182NC_021908CTTCGA21234360234361316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832796
183NC_021908ACGCTG21234689434690516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832799
184NC_021908AGCTGC21234731034732116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832801
185NC_021908CGAGGA21234748534749633.33 %0 %50 %16.67 %528832801
186NC_021908GACGCT21234956034957116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832803
187NC_021908TGCCGC2123518813518920 %16.67 %33.33 %50 %528832805
188NC_021908CCCGGC2123519663519770 %0 %33.33 %66.67 %528832805
189NC_021908CCATCA21235329535330633.33 %16.67 %0 %50 %528832806
190NC_021908TCGGCC2123549503549610 %16.67 %33.33 %50 %528832808
191NC_021908ATCGTC21235529335530416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832809
192NC_021908CCGGCG2123639873639980 %0 %50 %50 %528832819
193NC_021908CGCCGG2123668743668850 %0 %50 %50 %528832821
194NC_021908TCGCCA21236912536913616.67 %16.67 %16.67 %50 %528832824
195NC_021908CGGCGA21236934236935316.67 %0 %50 %33.33 %528832824
196NC_021908ATGCCG21237203637204716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832828
197NC_021908GCCGAG21237216137217216.67 %0 %50 %33.33 %528832828
198NC_021908CGATGG21237301037302116.67 %16.67 %50 %16.67 %528832829
199NC_021908CGGCGC2123736553736660 %0 %50 %50 %528832829
200NC_021908CGAGGC21237418037419116.67 %0 %50 %33.33 %528832830
201NC_021908GCCGTC2123743963744070 %16.67 %33.33 %50 %528832830
202NC_021908TAGCCG21237455637456716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832830
203NC_021908AGGTGA21237515737516833.33 %16.67 %50 %0 %528832830
204NC_021908AGGCAT21237669137670233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %528832832
205NC_021908GGTGCC2123785333785440 %16.67 %50 %33.33 %528832834
206NC_021908GTGCCG2123812493812600 %16.67 %50 %33.33 %528832837
207NC_021908CAGCGG21238722838723916.67 %0 %50 %33.33 %528832842
208NC_021908GGTCGA21238845438846516.67 %16.67 %50 %16.67 %528832843
209NC_021908GAGGCC21239006139007216.67 %0 %50 %33.33 %528832845
210NC_021908GTTCGC2123908503908610 %33.33 %33.33 %33.33 %528832846
211NC_021908GTCCTC2123908693908800 %33.33 %16.67 %50 %528832846
212NC_021908CGGCCT2123932123932230 %16.67 %33.33 %50 %528832848
213NC_021908CGCCAG21239480339481416.67 %0 %33.33 %50 %528832849
214NC_021908GAGGCC21240164040165116.67 %0 %50 %33.33 %528832855
215NC_021908CGAGCG21240372640373716.67 %0 %50 %33.33 %528832856
216NC_021908GCATCG21240946540947616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832861
217NC_021908GATCAC21241024941026033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832861
218NC_021908CACGAC21241326441327533.33 %0 %16.67 %50 %528832865
219NC_021908CGACCT21241445541446616.67 %16.67 %16.67 %50 %528832866
220NC_021908CTGGCG2124149604149710 %16.67 %50 %33.33 %528832866
221NC_021908GGGCAT21241628241629316.67 %16.67 %50 %16.67 %528832868
222NC_021908CCAGCG21241859541860616.67 %0 %33.33 %50 %528832870
223NC_021908ATCGAC21242059142060233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832872
224NC_021908CGCATG21242509542510616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832879
225NC_021908TGCCGG2124273004273110 %16.67 %50 %33.33 %528832881
226NC_021908TCGCCT2124313514313620 %33.33 %16.67 %50 %528832886
227NC_021908CGCCGA21243239643240716.67 %0 %33.33 %50 %528832886
228NC_021908GCCTTC2124328984329090 %33.33 %16.67 %50 %528832887
229NC_021908AGGCCG21243441943443016.67 %0 %50 %33.33 %528832888
230NC_021908CGACAG21243445743446833.33 %0 %33.33 %33.33 %528832888
231NC_021908TTCTGC2124365514365620 %50 %16.67 %33.33 %528832890
232NC_021908GCGGCC2124437334437440 %0 %50 %50 %528832896
233NC_021908CGGCAT21244466144467216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832896
234NC_021908CGCTCG2124457444457550 %16.67 %33.33 %50 %528832896
235NC_021908TTGTCC2124477574477680 %50 %16.67 %33.33 %528832898
236NC_021908CGTTGA21244812444813516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %528832899
237NC_021908TGAAGG21245103445104533.33 %16.67 %50 %0 %528832902
238NC_021908CGGCGC2124515024515130 %0 %50 %50 %528832903
239NC_021908GGCGCC2124543604543710 %0 %50 %50 %528832905
240NC_021908ATCGTC21246319646320716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %528832912
241NC_021908GCCGGA21246625946627016.67 %0 %50 %33.33 %528832915
242NC_021908GCTTGA21246865846866916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %528832918
243NC_021908AGCGCC21247036047037116.67 %0 %33.33 %50 %528832919
244NC_021908CCGGCT2124721024721130 %16.67 %33.33 %50 %528832921
245NC_021908CCGGTT2124737034737140 %33.33 %33.33 %33.33 %528832922
246NC_021908ACTTCA21247519447520533.33 %33.33 %0 %33.33 %528832924
247NC_021908TGGCCG2124786644786750 %16.67 %50 %33.33 %528832926
248NC_021908CCGCAT21247966547967616.67 %16.67 %16.67 %50 %528832927
249NC_021908AAGGAG21248042748043850 %0 %50 %0 %528832928
250NC_021908TTGCGT2124867254867360 %50 %33.33 %16.67 %528832936
251NC_021908CGGGAT21248771848772916.67 %16.67 %50 %16.67 %528832937
252NC_021908GCAGCC21248773148774216.67 %0 %33.33 %50 %528832937
253NC_021908GCGGAA21249458049459133.33 %0 %50 %16.67 %528832943
254NC_021908GGCGAT21249497549498616.67 %16.67 %50 %16.67 %528832943
255NC_021908CGGTCG2124951934952040 %16.67 %50 %33.33 %528832943
256NC_021908ATCAGC21249834749835833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832947
257NC_021908TCGCCT2124984354984460 %33.33 %16.67 %50 %528832947
258NC_021908CAGATC21249946249947333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %528832948
259NC_021908ACGCTG21249988849989916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832948
260NC_021908TCCGTT2125009655009760 %50 %16.67 %33.33 %528832949
261NC_021908GCCGCA21250164350165416.67 %0 %33.33 %50 %528832950
262NC_021908GCCGAT21250317350318416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %528832951
263NC_021908ATTCCT21250608250609316.67 %50 %0 %33.33 %528832955
264NC_021908GGTCAG21250629050630116.67 %16.67 %50 %16.67 %528832956
265NC_021908TCGCCG2125068945069050 %16.67 %33.33 %50 %528832956