MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	CGGCA	2	10	3493	3502	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021908	TCAAC	2	10	17288	17297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021908	GTATC	2	10	41805	41814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021908	CGGGA	2	10	45926	45935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021908	CCCCT	2	10	57703	57712	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_021908	TCAGT	2	10	72994	73003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021908	GGCAG	2	10	84131	84140	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021908	ACAGG	2	10	94882	94891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021908	GCGCG	2	10	146096	146105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021908	CCAGT	2	10	152770	152779	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021908	CGGCT	2	10	163037	163046	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021908	AATTC	2	10	163155	163164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021908	CCTTT	2	10	163563	163572	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021908	CGCGC	2	10	192066	192075	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_021908	GCATC	2	10	193941	193950	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021908	CGTGT	2	10	199794	199803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021908	GCGCC	2	10	216629	216638	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_021908	CGTAT	2	10	219483	219492	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021908	GAGAA	2	10	219882	219891	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021908	GCGAC	2	10	220721	220730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021908	AGGAC	2	10	224953	224962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021908	ACTTG	2	10	228462	228471	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021908	ACGAC	2	10	237131	237140	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021908	ATGTA	2	10	237252	237261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021908	CGCGA	2	10	262113	262122	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021908	GAAGC	2	10	278185	278194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021908	ACTGG	2	10	291966	291975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021908	ACGCC	2	10	308938	308947	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_021908	ATTAC	2	10	340690	340699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021908	GCTGC	2	10	389413	389422	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021908	ATGCG	2	10	407248	407257	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021908	GGCGC	2	10	407315	407324	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021908	TCACA	2	10	411446	411455	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021908	CCCCT	2	10	418134	418143	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_021908	TTTCG	2	10	420083	420092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021908	CATAT	2	10	424324	424333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021908	AAAGC	2	10	449978	449987	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021908	ACTTT	2	10	456072	456081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021908	TCACT	2	10	461259	461268	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021908	TCCCT	2	10	474835	474844	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_021908	GCCTC	2	10	483682	483691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.