MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 1346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	CTTC	2	8	72	79	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021908	GGAA	2	8	124	131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021908	TTGC	2	8	221	228	0 %	50 %	25 %	25 %	528832487
4	NC_021908	GCTG	2	8	1051	1058	0 %	25 %	50 %	25 %	528832487
5	NC_021908	CGGC	2	8	1126	1133	0 %	0 %	50 %	50 %	528832487
6	NC_021908	CGCC	2	8	1204	1211	0 %	0 %	25 %	75 %	528832487
7	NC_021908	TCCG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	25 %	50 %	528832489
8	NC_021908	AGGC	2	8	2562	2569	25 %	0 %	50 %	25 %	528832489
9	NC_021908	GGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	50 %	50 %	528832490
10	NC_021908	CGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	25 %	25 %	528832490
11	NC_021908	CCGG	2	8	3983	3990	0 %	0 %	50 %	50 %	528832492
12	NC_021908	GGCA	2	8	4001	4008	25 %	0 %	50 %	25 %	528832492
13	NC_021908	AGGC	2	8	4296	4303	25 %	0 %	50 %	25 %	528832492
14	NC_021908	ACGC	2	8	5799	5806	25 %	0 %	25 %	50 %	528832493
15	NC_021908	GCCG	2	8	6537	6544	0 %	0 %	50 %	50 %	528832493
16	NC_021908	AGCC	2	8	7186	7193	25 %	0 %	25 %	50 %	528832494
17	NC_021908	GCTC	2	8	9236	9243	0 %	25 %	25 %	50 %	528832494
18	NC_021908	GCCG	2	8	9278	9285	0 %	0 %	50 %	50 %	528832494
19	NC_021908	GGCC	2	8	10128	10135	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
20	NC_021908	ACCG	2	8	10169	10176	25 %	0 %	25 %	50 %	528832495
21	NC_021908	CGGC	2	8	10537	10544	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
22	NC_021908	GCGG	2	8	10612	10619	0 %	0 %	75 %	25 %	528832495
23	NC_021908	GCGA	2	8	10836	10843	25 %	0 %	50 %	25 %	528832495
24	NC_021908	CCGG	2	8	11119	11126	0 %	0 %	50 %	50 %	528832495
25	NC_021908	CCGC	2	8	11353	11360	0 %	0 %	25 %	75 %	528832495
26	NC_021908	GCAC	2	8	11861	11868	25 %	0 %	25 %	50 %	528832496
27	NC_021908	CCGG	2	8	12032	12039	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
28	NC_021908	CGTT	2	8	12110	12117	0 %	50 %	25 %	25 %	528832496
29	NC_021908	TGGT	2	8	12260	12267	0 %	50 %	50 %	0 %	528832496
30	NC_021908	GCGG	2	8	12382	12389	0 %	0 %	75 %	25 %	528832496
31	NC_021908	CCGG	2	8	12486	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
32	NC_021908	GTCG	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	528832496
33	NC_021908	GCCG	2	8	12958	12965	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
34	NC_021908	GCCG	2	8	13495	13502	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
35	NC_021908	GCCA	2	8	13990	13997	25 %	0 %	25 %	50 %	528832496
36	NC_021908	TTCG	2	8	14926	14933	0 %	50 %	25 %	25 %	528832496
37	NC_021908	CGGC	2	8	15543	15550	0 %	0 %	50 %	50 %	528832496
38	NC_021908	GCGA	2	8	15686	15693	25 %	0 %	50 %	25 %	528832496
39	NC_021908	TCGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	528832496
40	NC_021908	CTGC	2	8	16132	16139	0 %	25 %	25 %	50 %	528832496
41	NC_021908	GGCG	2	8	16758	16765	0 %	0 %	75 %	25 %	528832496
42	NC_021908	GGTT	2	8	17303	17310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021908	CAGC	2	8	18094	18101	25 %	0 %	25 %	50 %	528832497
44	NC_021908	CCTG	3	12	18769	18780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021908	GGCA	2	8	18884	18891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021908	CGGC	2	8	19180	19187	0 %	0 %	50 %	50 %	528832499
47	NC_021908	CGTC	2	8	19501	19508	0 %	25 %	25 %	50 %	528832500
48	NC_021908	CTCC	2	8	19702	19709	0 %	25 %	0 %	75 %	528832500
49	NC_021908	AATT	2	8	20156	20163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021908	CTTC	2	8	20307	20314	0 %	50 %	0 %	50 %	528832501
51	NC_021908	CCCG	2	8	20853	20860	0 %	0 %	25 %	75 %	528832501
52	NC_021908	GGCT	2	8	21098	21105	0 %	25 %	50 %	25 %	528832501
53	NC_021908	TCGG	2	8	22743	22750	0 %	25 %	50 %	25 %	528832502
54	NC_021908	CGGC	2	8	22849	22856	0 %	0 %	50 %	50 %	528832502
55	NC_021908	TGCG	2	8	23123	23130	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
56	NC_021908	GGCC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	528832503
57	NC_021908	ATCC	2	8	23488	23495	25 %	25 %	0 %	50 %	528832503
58	NC_021908	CGGT	2	8	23573	23580	0 %	25 %	50 %	25 %	528832503
59	NC_021908	GGTA	2	8	24068	24075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021908	CGGT	2	8	24158	24165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021908	CCGG	2	8	24492	24499	0 %	0 %	50 %	50 %	528832504
62	NC_021908	GTTC	2	8	24657	24664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021908	GCAC	2	8	25285	25292	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
64	NC_021908	CCTG	2	8	25847	25854	0 %	25 %	25 %	50 %	528832505
65	NC_021908	CCGA	2	8	26074	26081	25 %	0 %	25 %	50 %	528832505
66	NC_021908	GCAT	2	8	26940	26947	25 %	25 %	25 %	25 %	528832506
67	NC_021908	ATCG	2	8	27038	27045	25 %	25 %	25 %	25 %	528832506
68	NC_021908	AGGA	2	8	27288	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	528832506
69	NC_021908	GGGT	2	8	28836	28843	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021908	CGAC	2	8	28953	28960	25 %	0 %	25 %	50 %	528832507
71	NC_021908	CCTT	2	8	29193	29200	0 %	50 %	0 %	50 %	528832507
72	NC_021908	CCTC	2	8	29636	29643	0 %	25 %	0 %	75 %	528832508
73	NC_021908	TTTG	2	8	30012	30019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021908	TCGA	2	8	30246	30253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021908	GCCG	2	8	30600	30607	0 %	0 %	50 %	50 %	528832509
76	NC_021908	GCTC	3	12	31168	31179	0 %	25 %	25 %	50 %	528832509
77	NC_021908	GCGA	2	8	31227	31234	25 %	0 %	50 %	25 %	528832509
78	NC_021908	GCCG	2	8	31365	31372	0 %	0 %	50 %	50 %	528832509
79	NC_021908	CGGC	2	8	33057	33064	0 %	0 %	50 %	50 %	528832510
80	NC_021908	GTCG	2	8	33478	33485	0 %	25 %	50 %	25 %	528832510
81	NC_021908	AAAG	2	8	34323	34330	75 %	0 %	25 %	0 %	528832511
82	NC_021908	CCGG	2	8	34869	34876	0 %	0 %	50 %	50 %	528832511
83	NC_021908	CTGT	2	8	35354	35361	0 %	50 %	25 %	25 %	528832512
84	NC_021908	GCGG	2	8	35590	35597	0 %	0 %	75 %	25 %	528832512
85	NC_021908	CGCC	2	8	36034	36041	0 %	0 %	25 %	75 %	528832513
86	NC_021908	CCAG	2	8	36046	36053	25 %	0 %	25 %	50 %	528832513
87	NC_021908	GGCC	2	8	36118	36125	0 %	0 %	50 %	50 %	528832513
88	NC_021908	CGGC	2	8	36624	36631	0 %	0 %	50 %	50 %	528832514
89	NC_021908	CGTG	2	8	36666	36673	0 %	25 %	50 %	25 %	528832514
90	NC_021908	CGGC	2	8	37571	37578	0 %	0 %	50 %	50 %	528832515
91	NC_021908	AGCC	2	8	38278	38285	25 %	0 %	25 %	50 %	528832515
92	NC_021908	TCTG	2	8	39006	39013	0 %	50 %	25 %	25 %	528832516
93	NC_021908	CGCT	2	8	40666	40673	0 %	25 %	25 %	50 %	528832517
94	NC_021908	CGGC	2	8	41387	41394	0 %	0 %	50 %	50 %	528832517
95	NC_021908	CTGG	2	8	41606	41613	0 %	25 %	50 %	25 %	528832517
96	NC_021908	GCAA	2	8	42270	42277	50 %	0 %	25 %	25 %	528832518
97	NC_021908	CGGC	2	8	42388	42395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021908	GCCG	3	12	42396	42407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021908	CGTG	2	8	42785	42792	0 %	25 %	50 %	25 %	528832519
100	NC_021908	GCCG	2	8	42860	42867	0 %	0 %	50 %	50 %	528832519
101	NC_021908	CCTT	2	8	43318	43325	0 %	50 %	0 %	50 %	528832520
102	NC_021908	ACCG	2	8	44097	44104	25 %	0 %	25 %	50 %	528832520
103	NC_021908	CCGG	2	8	44297	44304	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
104	NC_021908	GCCG	2	8	44337	44344	0 %	0 %	50 %	50 %	528832520
105	NC_021908	CGTC	2	8	44584	44591	0 %	25 %	25 %	50 %	528832520
106	NC_021908	GGCG	2	8	44726	44733	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
107	NC_021908	GGGC	2	8	45368	45375	0 %	0 %	75 %	25 %	528832520
108	NC_021908	GCGA	2	8	46065	46072	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
109	NC_021908	CGAG	2	8	46126	46133	25 %	0 %	50 %	25 %	528832521
110	NC_021908	GCCG	2	8	46870	46877	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
111	NC_021908	GCCG	3	12	46967	46978	0 %	0 %	50 %	50 %	528832521
112	NC_021908	CCGT	2	8	47399	47406	0 %	25 %	25 %	50 %	528832522
113	NC_021908	CGGC	2	8	47685	47692	0 %	0 %	50 %	50 %	528832522
114	NC_021908	GTCG	2	8	48313	48320	0 %	25 %	50 %	25 %	528832522
115	NC_021908	GGTG	2	8	48483	48490	0 %	25 %	75 %	0 %	528832523
116	NC_021908	TGGC	2	8	49424	49431	0 %	25 %	50 %	25 %	528832523
117	NC_021908	GGCG	2	8	49728	49735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021908	AGGA	2	8	49947	49954	50 %	0 %	50 %	0 %	528832524
119	NC_021908	AAAT	2	8	50181	50188	75 %	25 %	0 %	0 %	528832524
120	NC_021908	CCAT	2	8	50230	50237	25 %	25 %	0 %	50 %	528832524
121	NC_021908	TGCG	2	8	50386	50393	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
122	NC_021908	CGGT	2	8	50430	50437	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
123	NC_021908	CGGT	2	8	50562	50569	0 %	25 %	50 %	25 %	528832524
124	NC_021908	AAGA	2	8	50756	50763	75 %	0 %	25 %	0 %	528832524
125	NC_021908	GCCG	2	8	51313	51320	0 %	0 %	50 %	50 %	528832525
126	NC_021908	GCCG	2	8	51322	51329	0 %	0 %	50 %	50 %	528832525
127	NC_021908	GATC	2	8	52176	52183	25 %	25 %	25 %	25 %	528832526
128	NC_021908	ATGC	2	8	52240	52247	25 %	25 %	25 %	25 %	528832526
129	NC_021908	CTGC	2	8	52993	53000	0 %	25 %	25 %	50 %	528832526
130	NC_021908	CGGC	2	8	53052	53059	0 %	0 %	50 %	50 %	528832526
131	NC_021908	GCTG	2	8	53613	53620	0 %	25 %	50 %	25 %	528832526
132	NC_021908	GCGG	3	12	53691	53702	0 %	0 %	75 %	25 %	528832526
133	NC_021908	GCAG	2	8	53720	53727	25 %	0 %	50 %	25 %	528832526
134	NC_021908	CTGC	2	8	53769	53776	0 %	25 %	25 %	50 %	528832526
135	NC_021908	GCGG	2	8	54011	54018	0 %	0 %	75 %	25 %	528832527
136	NC_021908	GCCG	2	8	55436	55443	0 %	0 %	50 %	50 %	528832527
137	NC_021908	GTCG	2	8	56772	56779	0 %	25 %	50 %	25 %	528832528
138	NC_021908	CGGC	2	8	56885	56892	0 %	0 %	50 %	50 %	528832528
139	NC_021908	GGCC	2	8	56981	56988	0 %	0 %	50 %	50 %	528832528
140	NC_021908	CGAT	2	8	58676	58683	25 %	25 %	25 %	25 %	528832529
141	NC_021908	CGAC	2	8	59063	59070	25 %	0 %	25 %	50 %	528832529
142	NC_021908	GCGG	2	8	59387	59394	0 %	0 %	75 %	25 %	528832530
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