MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 9105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	TCT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021908	TTG	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021908	CGG	2	6	231	236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
4	NC_021908	CGG	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
5	NC_021908	TCG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832487
6	NC_021908	TTC	2	6	311	316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832487
7	NC_021908	ACG	2	6	378	383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832487
8	NC_021908	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832487
9	NC_021908	CGA	3	9	577	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832487
10	NC_021908	GCC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832487
11	NC_021908	GAG	2	6	695	700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832487
12	NC_021908	CTG	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832487
13	NC_021908	CGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832487
14	NC_021908	GAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832487
15	NC_021908	TGC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832487
16	NC_021908	GCC	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832487
17	NC_021908	GCG	2	6	880	885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
18	NC_021908	CGG	2	6	898	903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
19	NC_021908	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
20	NC_021908	GCG	2	6	994	999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
21	NC_021908	CGG	3	9	1059	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
22	NC_021908	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832487
23	NC_021908	CGG	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
24	NC_021908	CGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832487
25	NC_021908	GCG	2	6	1230	1235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832487
26	NC_021908	ATC	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832487
27	NC_021908	CGA	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832488
28	NC_021908	GAC	2	6	1601	1606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832488
29	NC_021908	GAT	3	9	1673	1681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832488
30	NC_021908	CAT	2	6	1694	1699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832488
31	NC_021908	TCG	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832488
32	NC_021908	TGG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832488
33	NC_021908	GGC	2	6	1769	1774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832488
34	NC_021908	TGA	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832488
35	NC_021908	GAA	3	9	1913	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832488
36	NC_021908	GCG	2	6	1933	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832488
37	NC_021908	CAC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832488
38	NC_021908	GCG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832488
39	NC_021908	CGA	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832488
40	NC_021908	CGA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832488
41	NC_021908	GCA	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832488
42	NC_021908	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832488
43	NC_021908	GCC	2	6	2192	2197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832489
44	NC_021908	GGC	2	6	2263	2268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
45	NC_021908	TCG	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832489
46	NC_021908	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
47	NC_021908	CGG	2	6	2655	2660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
48	NC_021908	CGG	2	6	2714	2719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
49	NC_021908	GGC	2	6	2739	2744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
50	NC_021908	GGC	2	6	2812	2817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
51	NC_021908	GCG	2	6	2857	2862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832489
52	NC_021908	CGA	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832489
53	NC_021908	TCT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832490
54	NC_021908	TCC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832490
55	NC_021908	GAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832490
56	NC_021908	CTG	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832490
57	NC_021908	TCG	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832490
58	NC_021908	GGC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832490
59	NC_021908	CAG	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832490
60	NC_021908	GCC	2	6	3299	3304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832490
61	NC_021908	CTT	3	9	3317	3325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832490
62	NC_021908	CAT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832490
63	NC_021908	GCG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832490
64	NC_021908	GGC	2	6	3439	3444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832490
65	NC_021908	GGA	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021908	GCC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021908	AAG	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832491
68	NC_021908	CCA	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832491
69	NC_021908	AAG	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832491
70	NC_021908	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832491
71	NC_021908	CGA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832491
72	NC_021908	CCG	2	6	3884	3889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832491
73	NC_021908	GCC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832492
74	NC_021908	TTC	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832492
75	NC_021908	GCG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832492
76	NC_021908	CAG	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832492
77	NC_021908	CGA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
78	NC_021908	CGC	4	12	4407	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
79	NC_021908	ATC	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832493
80	NC_021908	CAG	3	9	4431	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
81	NC_021908	TCC	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832493
82	NC_021908	GCC	2	6	4547	4552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
83	NC_021908	CGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
84	NC_021908	CTT	2	6	4737	4742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832493
85	NC_021908	ATG	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832493
86	NC_021908	TCT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832493
87	NC_021908	CGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
88	NC_021908	CGC	2	6	5120	5125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
89	NC_021908	TTC	2	6	5127	5132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832493
90	NC_021908	GAT	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832493
91	NC_021908	CAG	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
92	NC_021908	CCG	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
93	NC_021908	CGA	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
94	NC_021908	GAT	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832493
95	NC_021908	CAG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
96	NC_021908	GAC	3	9	5511	5519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
97	NC_021908	GAA	2	6	5529	5534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832493
98	NC_021908	CGA	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
99	NC_021908	TTG	2	6	5665	5670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832493
100	NC_021908	GCC	2	6	5676	5681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
101	NC_021908	ATC	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832493
102	NC_021908	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
103	NC_021908	CCG	2	6	5871	5876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
104	NC_021908	CGA	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
105	NC_021908	CGA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
106	NC_021908	GCC	3	9	5983	5991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
107	NC_021908	CGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
108	NC_021908	GAA	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832493
109	NC_021908	GCC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832493
110	NC_021908	CAC	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832493
111	NC_021908	CAG	2	6	6279	6284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832493
112	NC_021908	GGA	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832493
113	NC_021908	TGA	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832493
114	NC_021908	ATC	3	9	6816	6824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832493
115	NC_021908	TGG	2	6	6844	6849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832493
116	NC_021908	CGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021908	CCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021908	TGC	2	6	7061	7066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832494
119	NC_021908	GCG	2	6	7210	7215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832494
120	NC_021908	GCC	3	9	7325	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832494
121	NC_021908	CGA	2	6	7352	7357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832494
122	NC_021908	GCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832494
123	NC_021908	CGC	3	9	7371	7379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832494
124	NC_021908	TCA	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832494
125	NC_021908	CAG	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832494
126	NC_021908	CGC	2	6	7560	7565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832494
127	NC_021908	GCA	2	6	7577	7582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832494
128	NC_021908	TCC	2	6	7771	7776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832494
129	NC_021908	ACA	2	6	7802	7807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832494
130	NC_021908	CGC	2	6	7949	7954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832494
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163	NC_021908	GCG	2	6	10231	10236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832495
164	NC_021908	CGG	2	6	10240	10245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832495
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255	NC_021908	GAC	3	9	14995	15003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832496
256	NC_021908	CGG	2	6	15024	15029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832496
257	NC_021908	ATC	2	6	15139	15144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832496
258	NC_021908	CCG	2	6	15254	15259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832496
259	NC_021908	CCG	2	6	15283	15288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832496
260	NC_021908	GGC	2	6	15306	15311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832496
261	NC_021908	GCG	2	6	15446	15451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832496
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263	NC_021908	GGC	2	6	15532	15537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832496
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280	NC_021908	CTG	2	6	16840	16845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832496
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287	NC_021908	CTC	2	6	17273	17278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_021908	TTC	2	6	17329	17334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_021908	CTT	2	6	22244	22249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832502
381	NC_021908	AGC	2	6	22251	22256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832502
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384	NC_021908	GCT	2	6	22484	22489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832502
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