MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	C	6	6	22663	22668	0 %	0 %	0 %	100 %	528832502
2	NC_021908	T	6	6	30305	30310	0 %	100 %	0 %	0 %	528832509
3	NC_021908	G	6	6	31523	31528	0 %	0 %	100 %	0 %	528832509
4	NC_021908	C	6	6	33956	33961	0 %	0 %	0 %	100 %	528832511
5	NC_021908	G	6	6	51844	51849	0 %	0 %	100 %	0 %	528832525
6	NC_021908	A	6	6	64603	64608	100 %	0 %	0 %	0 %	528832534
7	NC_021908	A	6	6	79393	79398	100 %	0 %	0 %	0 %	528832553
8	NC_021908	T	8	8	80853	80860	0 %	100 %	0 %	0 %	528832555
9	NC_021908	G	6	6	88359	88364	0 %	0 %	100 %	0 %	528832560
10	NC_021908	C	6	6	110611	110616	0 %	0 %	0 %	100 %	528832581
11	NC_021908	C	6	6	114579	114584	0 %	0 %	0 %	100 %	528832585
12	NC_021908	G	6	6	116795	116800	0 %	0 %	100 %	0 %	528832586
13	NC_021908	C	6	6	117219	117224	0 %	0 %	0 %	100 %	528832587
14	NC_021908	A	6	6	128944	128949	100 %	0 %	0 %	0 %	528832597
15	NC_021908	T	6	6	136194	136199	0 %	100 %	0 %	0 %	528832604
16	NC_021908	C	6	6	136228	136233	0 %	0 %	0 %	100 %	528832604
17	NC_021908	T	6	6	142562	142567	0 %	100 %	0 %	0 %	528832607
18	NC_021908	T	7	7	142957	142963	0 %	100 %	0 %	0 %	528832607
19	NC_021908	T	6	6	148967	148972	0 %	100 %	0 %	0 %	528832611
20	NC_021908	T	6	6	153018	153023	0 %	100 %	0 %	0 %	528832616
21	NC_021908	A	6	6	153740	153745	100 %	0 %	0 %	0 %	528832616
22	NC_021908	A	6	6	156701	156706	100 %	0 %	0 %	0 %	528832618
23	NC_021908	G	6	6	158062	158067	0 %	0 %	100 %	0 %	528832618
24	NC_021908	C	6	6	186555	186560	0 %	0 %	0 %	100 %	528832645
25	NC_021908	A	7	7	187036	187042	100 %	0 %	0 %	0 %	528832645
26	NC_021908	C	6	6	188024	188029	0 %	0 %	0 %	100 %	528832646
27	NC_021908	C	6	6	189915	189920	0 %	0 %	0 %	100 %	528832647
28	NC_021908	G	6	6	190711	190716	0 %	0 %	100 %	0 %	528832647
29	NC_021908	T	6	6	196259	196264	0 %	100 %	0 %	0 %	528832655
30	NC_021908	A	6	6	198756	198761	100 %	0 %	0 %	0 %	528832657
31	NC_021908	A	7	7	202923	202929	100 %	0 %	0 %	0 %	528832660
32	NC_021908	T	7	7	219995	220001	0 %	100 %	0 %	0 %	528832677
33	NC_021908	T	6	6	225404	225409	0 %	100 %	0 %	0 %	528832679
34	NC_021908	A	7	7	226875	226881	100 %	0 %	0 %	0 %	528832680
35	NC_021908	A	6	6	237519	237524	100 %	0 %	0 %	0 %	528832689
36	NC_021908	T	7	7	237783	237789	0 %	100 %	0 %	0 %	528832689
37	NC_021908	T	6	6	238760	238765	0 %	100 %	0 %	0 %	528832690
38	NC_021908	A	6	6	245125	245130	100 %	0 %	0 %	0 %	528832696
39	NC_021908	G	6	6	247118	247123	0 %	0 %	100 %	0 %	528832698
40	NC_021908	A	6	6	249895	249900	100 %	0 %	0 %	0 %	528832700
41	NC_021908	T	6	6	271053	271058	0 %	100 %	0 %	0 %	528832724
42	NC_021908	A	6	6	273594	273599	100 %	0 %	0 %	0 %	528832727
43	NC_021908	A	6	6	281199	281204	100 %	0 %	0 %	0 %	528832737
44	NC_021908	T	6	6	283206	283211	0 %	100 %	0 %	0 %	528832738
45	NC_021908	C	6	6	287464	287469	0 %	0 %	0 %	100 %	528832743
46	NC_021908	A	6	6	288315	288320	100 %	0 %	0 %	0 %	528832743
47	NC_021908	T	6	6	295143	295148	0 %	100 %	0 %	0 %	528832748
48	NC_021908	T	6	6	301876	301881	0 %	100 %	0 %	0 %	528832755
49	NC_021908	T	6	6	313938	313943	0 %	100 %	0 %	0 %	528832766
50	NC_021908	C	6	6	314515	314520	0 %	0 %	0 %	100 %	528832767
51	NC_021908	A	6	6	315778	315783	100 %	0 %	0 %	0 %	528832769
52	NC_021908	T	8	8	320333	320340	0 %	100 %	0 %	0 %	528832774
53	NC_021908	G	6	6	322626	322631	0 %	0 %	100 %	0 %	528832776
54	NC_021908	C	7	7	334688	334694	0 %	0 %	0 %	100 %	528832787
55	NC_021908	C	6	6	340834	340839	0 %	0 %	0 %	100 %	528832795
56	NC_021908	A	6	6	340907	340912	100 %	0 %	0 %	0 %	528832795
57	NC_021908	A	7	7	346404	346410	100 %	0 %	0 %	0 %	528832799
58	NC_021908	A	6	6	355270	355275	100 %	0 %	0 %	0 %	528832809
59	NC_021908	T	6	6	358171	358176	0 %	100 %	0 %	0 %	528832812
60	NC_021908	G	6	6	367598	367603	0 %	0 %	100 %	0 %	528832822
61	NC_021908	T	6	6	375479	375484	0 %	100 %	0 %	0 %	528832830
62	NC_021908	T	6	6	376245	376250	0 %	100 %	0 %	0 %	528832831
63	NC_021908	G	6	6	376960	376965	0 %	0 %	100 %	0 %	528832832
64	NC_021908	G	6	6	394463	394468	0 %	0 %	100 %	0 %	528832848
65	NC_021908	A	6	6	397103	397108	100 %	0 %	0 %	0 %	528832851
66	NC_021908	A	6	6	402335	402340	100 %	0 %	0 %	0 %	528832855
67	NC_021908	A	6	6	403357	403362	100 %	0 %	0 %	0 %	528832856
68	NC_021908	A	6	6	407992	407997	100 %	0 %	0 %	0 %	528832860
69	NC_021908	A	6	6	415846	415851	100 %	0 %	0 %	0 %	528832867
70	NC_021908	T	6	6	421304	421309	0 %	100 %	0 %	0 %	528832874
71	NC_021908	T	6	6	443864	443869	0 %	100 %	0 %	0 %	528832896
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74	NC_021908	A	6	6	473446	473451	100 %	0 %	0 %	0 %	528832922
75	NC_021908	T	6	6	473593	473598	0 %	100 %	0 %	0 %	528832922
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77	NC_021908	A	6	6	475340	475345	100 %	0 %	0 %	0 %	528832924
78	NC_021908	A	6	6	480447	480452	100 %	0 %	0 %	0 %	528832928
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80	NC_021908	T	6	6	496342	496347	0 %	100 %	0 %	0 %	528832944
81	NC_021908	C	7	7	503971	503977	0 %	0 %	0 %	100 %	528832952
82	NC_021908	T	6	6	506469	506474	0 %	100 %	0 %	0 %	528832956
83	NC_021908	A	6	6	511567	511572	100 %	0 %	0 %	0 %	528832960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.