MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	ACGAA	2	10	30805	30814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021907	GGCGC	2	10	41216	41225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021907	TTGAA	2	10	44356	44365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021907	GCCCG	2	10	47536	47545	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_021907	GGGGC	2	10	70185	70194	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021907	ACCCG	2	10	83035	83044	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021907	CGGCG	2	10	109164	109173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021907	AGATC	2	10	117813	117822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021907	CGCGG	2	10	130704	130713	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021907	GCACG	2	10	133291	133300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021907	CCCTC	2	10	177225	177234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_021907	TTCAG	2	10	186083	186092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021907	GCTCG	2	10	197028	197037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021907	TCGTG	2	10	197070	197079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021907	GATCG	2	10	207877	207886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021907	GGCGC	2	10	210019	210028	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021907	GCTTT	2	10	216981	216990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021907	CAGGA	2	10	217035	217044	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021907	CCATG	2	10	225963	225972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021907	CATCT	2	10	237349	237358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021907	CCCTC	2	10	239865	239874	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
22	NC_021907	CAGCT	2	10	248264	248273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.