MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	TACC	2	8	1327	1334	25 %	25 %	0 %	50 %	528831101
2	NC_021907	CGAT	2	8	2253	2260	25 %	25 %	25 %	25 %	528831102
3	NC_021907	CGGC	2	8	3225	3232	0 %	0 %	50 %	50 %	528831102
4	NC_021907	GCGA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	50 %	25 %	528831103
5	NC_021907	CATG	2	8	3613	3620	25 %	25 %	25 %	25 %	528831103
6	NC_021907	ATCA	2	8	4217	4224	50 %	25 %	0 %	25 %	528831103
7	NC_021907	CACC	2	8	4974	4981	25 %	0 %	0 %	75 %	528831104
8	NC_021907	GTCG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	528831105
9	NC_021907	ATCA	2	8	6241	6248	50 %	25 %	0 %	25 %	528831105
10	NC_021907	ACCA	2	8	7486	7493	50 %	0 %	0 %	50 %	528831106
11	NC_021907	CCCG	2	8	7860	7867	0 %	0 %	25 %	75 %	528831106
12	NC_021907	GACG	2	8	7900	7907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021907	TGGC	2	8	8017	8024	0 %	25 %	50 %	25 %	528831107
14	NC_021907	ACCA	2	8	8502	8509	50 %	0 %	0 %	50 %	528831107
15	NC_021907	CGCA	2	8	8644	8651	25 %	0 %	25 %	50 %	528831107
16	NC_021907	GATC	2	8	8721	8728	25 %	25 %	25 %	25 %	528831107
17	NC_021907	CTTT	2	8	9103	9110	0 %	75 %	0 %	25 %	528831108
18	NC_021907	GCCG	3	12	9251	9262	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
19	NC_021907	CGGC	2	8	9486	9493	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
20	NC_021907	GCCG	2	8	9497	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
21	NC_021907	CGAC	2	8	10604	10611	25 %	0 %	25 %	50 %	528831109
22	NC_021907	GATC	2	8	11015	11022	25 %	25 %	25 %	25 %	528831110
23	NC_021907	ATGA	2	8	11320	11327	50 %	25 %	25 %	0 %	528831111
24	NC_021907	TTGC	2	8	12539	12546	0 %	50 %	25 %	25 %	528831115
25	NC_021907	TCTG	2	8	13059	13066	0 %	50 %	25 %	25 %	528831116
26	NC_021907	GGCC	2	8	13291	13298	0 %	0 %	50 %	50 %	528831116
27	NC_021907	TTGC	2	8	13567	13574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021907	CGAA	2	8	13905	13912	50 %	0 %	25 %	25 %	528831117
29	NC_021907	AAGA	2	8	14018	14025	75 %	0 %	25 %	0 %	528831117
30	NC_021907	GATC	2	8	14516	14523	25 %	25 %	25 %	25 %	528831118
31	NC_021907	TCGA	2	8	14637	14644	25 %	25 %	25 %	25 %	528831118
32	NC_021907	GACC	2	8	14854	14861	25 %	0 %	25 %	50 %	528831118
33	NC_021907	GGAA	2	8	15051	15058	50 %	0 %	50 %	0 %	528831118
34	NC_021907	GCAA	2	8	16270	16277	50 %	0 %	25 %	25 %	528831119
35	NC_021907	GTGA	2	8	16450	16457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021907	GCCG	3	12	16664	16675	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
37	NC_021907	GGTC	2	8	17278	17285	0 %	25 %	50 %	25 %	528831120
38	NC_021907	GGCC	2	8	17317	17324	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
39	NC_021907	CTGG	2	8	17573	17580	0 %	25 %	50 %	25 %	528831120
40	NC_021907	GCGG	2	8	18626	18633	0 %	0 %	75 %	25 %	528831121
41	NC_021907	GGGC	2	8	19088	19095	0 %	0 %	75 %	25 %	528831122
42	NC_021907	CGGT	2	8	19181	19188	0 %	25 %	50 %	25 %	528831122
43	NC_021907	GCCG	2	8	19443	19450	0 %	0 %	50 %	50 %	528831122
44	NC_021907	GGGC	2	8	19485	19492	0 %	0 %	75 %	25 %	528831122
45	NC_021907	GATC	2	8	19602	19609	25 %	25 %	25 %	25 %	528831123
46	NC_021907	CGGC	2	8	19767	19774	0 %	0 %	50 %	50 %	528831123
47	NC_021907	CTGC	2	8	19823	19830	0 %	25 %	25 %	50 %	528831123
48	NC_021907	GCAA	2	8	20011	20018	50 %	0 %	25 %	25 %	528831123
49	NC_021907	AAGG	2	8	20069	20076	50 %	0 %	50 %	0 %	528831123
50	NC_021907	GCAA	2	8	20911	20918	50 %	0 %	25 %	25 %	528831124
51	NC_021907	CCGA	2	8	21043	21050	25 %	0 %	25 %	50 %	528831124
52	NC_021907	GCCA	2	8	21399	21406	25 %	0 %	25 %	50 %	528831125
53	NC_021907	GCAT	2	8	21466	21473	25 %	25 %	25 %	25 %	528831125
54	NC_021907	CAGC	2	8	22854	22861	25 %	0 %	25 %	50 %	528831126
55	NC_021907	AGGC	2	8	22976	22983	25 %	0 %	50 %	25 %	528831126
56	NC_021907	TCGA	2	8	23422	23429	25 %	25 %	25 %	25 %	528831126
57	NC_021907	CGAC	2	8	24421	24428	25 %	0 %	25 %	50 %	528831128
58	NC_021907	TGCC	2	8	24766	24773	0 %	25 %	25 %	50 %	528831128
59	NC_021907	GATC	2	8	25807	25814	25 %	25 %	25 %	25 %	528831129
60	NC_021907	CTGG	2	8	26389	26396	0 %	25 %	50 %	25 %	528831130
61	NC_021907	GTTC	2	8	26533	26540	0 %	50 %	25 %	25 %	528831130
62	NC_021907	TCGA	2	8	26739	26746	25 %	25 %	25 %	25 %	528831130
63	NC_021907	GGTG	2	8	27319	27326	0 %	25 %	75 %	0 %	528831131
64	NC_021907	CACG	2	8	27616	27623	25 %	0 %	25 %	50 %	528831131
65	NC_021907	GCCG	2	8	28565	28572	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
66	NC_021907	AAAC	2	8	31417	31424	75 %	0 %	0 %	25 %	528831135
67	NC_021907	TCGG	2	8	31445	31452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021907	CTCC	2	8	31506	31513	0 %	25 %	0 %	75 %	528831136
69	NC_021907	GCGA	2	8	32159	32166	25 %	0 %	50 %	25 %	528831136
70	NC_021907	GGCA	2	8	34452	34459	25 %	0 %	50 %	25 %	528831139
71	NC_021907	GCTG	2	8	34571	34578	0 %	25 %	50 %	25 %	528831139
72	NC_021907	GGGC	2	8	34595	34602	0 %	0 %	75 %	25 %	528831139
73	NC_021907	GAAC	2	8	34937	34944	50 %	0 %	25 %	25 %	528831139
74	NC_021907	AGCC	2	8	35999	36006	25 %	0 %	25 %	50 %	528831140
75	NC_021907	CGGC	2	8	36234	36241	0 %	0 %	50 %	50 %	528831140
76	NC_021907	TGGA	2	8	36475	36482	25 %	25 %	50 %	0 %	528831140
77	NC_021907	AGGA	2	8	36737	36744	50 %	0 %	50 %	0 %	528831140
78	NC_021907	CAGC	2	8	36757	36764	25 %	0 %	25 %	50 %	528831140
79	NC_021907	AAAT	2	8	37382	37389	75 %	25 %	0 %	0 %	528831140
80	NC_021907	GCGA	2	8	37977	37984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021907	TCGA	2	8	38021	38028	25 %	25 %	25 %	25 %	528831141
82	NC_021907	CTTC	2	8	38269	38276	0 %	50 %	0 %	50 %	528831141
83	NC_021907	CGGT	2	8	38478	38485	0 %	25 %	50 %	25 %	528831141
84	NC_021907	TTGC	2	8	38564	38571	0 %	50 %	25 %	25 %	528831141
85	NC_021907	GGCG	2	8	39618	39625	0 %	0 %	75 %	25 %	528831142
86	NC_021907	CGAA	2	8	40151	40158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021907	CGAT	2	8	40403	40410	25 %	25 %	25 %	25 %	528831143
88	NC_021907	CGTC	2	8	40809	40816	0 %	25 %	25 %	50 %	528831143
89	NC_021907	CCGG	2	8	40848	40855	0 %	0 %	50 %	50 %	528831143
90	NC_021907	GAGG	2	8	40874	40881	25 %	0 %	75 %	0 %	528831143
91	NC_021907	CCGC	2	8	41127	41134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_021907	TCGC	2	8	41564	41571	0 %	25 %	25 %	50 %	528831144
93	NC_021907	GGCG	2	8	41711	41718	0 %	0 %	75 %	25 %	528831144
94	NC_021907	TCAT	2	8	42322	42329	25 %	50 %	0 %	25 %	528831144
95	NC_021907	ATCT	2	8	42435	42442	25 %	50 %	0 %	25 %	528831144
96	NC_021907	GGTC	2	8	43374	43381	0 %	25 %	50 %	25 %	528831145
97	NC_021907	GGCC	2	8	43863	43870	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
98	NC_021907	AGAA	2	8	44256	44263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021907	CGTC	2	8	44545	44552	0 %	25 %	25 %	50 %	528831146
100	NC_021907	GTCC	2	8	44695	44702	0 %	25 %	25 %	50 %	528831146
101	NC_021907	CTGG	2	8	44783	44790	0 %	25 %	50 %	25 %	528831146
102	NC_021907	CGGT	2	8	44845	44852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021907	GACA	2	8	45414	45421	50 %	0 %	25 %	25 %	528831147
104	NC_021907	CTGT	2	8	45646	45653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021907	GCAT	2	8	45742	45749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021907	GTCC	2	8	47111	47118	0 %	25 %	25 %	50 %	528831148
107	NC_021907	GCAG	2	8	47610	47617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021907	TCTG	2	8	47949	47956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021907	TGGA	2	8	48923	48930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021907	GAAC	2	8	49114	49121	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
111	NC_021907	CGGC	2	8	49138	49145	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
112	NC_021907	AAGC	2	8	49486	49493	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
113	NC_021907	CCGC	2	8	49596	49603	0 %	0 %	25 %	75 %	528831150
114	NC_021907	CGGG	3	12	50215	50226	0 %	0 %	75 %	25 %	528831151
115	NC_021907	CTGC	2	8	50270	50277	0 %	25 %	25 %	50 %	528831151
116	NC_021907	CGGT	2	8	50595	50602	0 %	25 %	50 %	25 %	528831151
117	NC_021907	GGCA	2	8	51466	51473	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
118	NC_021907	CGGC	2	8	51586	51593	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
119	NC_021907	GAAG	2	8	51679	51686	50 %	0 %	50 %	0 %	528831152
120	NC_021907	CGAT	2	8	51958	51965	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
121	NC_021907	TTGC	2	8	52415	52422	0 %	50 %	25 %	25 %	528831152
122	NC_021907	CGAG	2	8	52867	52874	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
123	NC_021907	ATCG	2	8	53027	53034	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
124	NC_021907	GGCG	2	8	53056	53063	0 %	0 %	75 %	25 %	528831152
125	NC_021907	GACA	2	8	53183	53190	50 %	0 %	25 %	25 %	528831152
126	NC_021907	CGAC	2	8	53575	53582	25 %	0 %	25 %	50 %	528831152
127	NC_021907	CGGA	2	8	54559	54566	25 %	0 %	50 %	25 %	528831153
128	NC_021907	CCAC	2	8	55195	55202	25 %	0 %	0 %	75 %	528831153
129	NC_021907	AGGA	2	8	55659	55666	50 %	0 %	50 %	0 %	528831154
130	NC_021907	CGAC	2	8	55971	55978	25 %	0 %	25 %	50 %	528831154
131	NC_021907	GTCC	2	8	56239	56246	0 %	25 %	25 %	50 %	528831154
132	NC_021907	CCGG	2	8	56620	56627	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
133	NC_021907	CCGG	2	8	57071	57078	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
134	NC_021907	CGGG	2	8	57351	57358	0 %	0 %	75 %	25 %	528831155
135	NC_021907	CAGG	2	8	57444	57451	25 %	0 %	50 %	25 %	528831155
136	NC_021907	GACG	2	8	57656	57663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021907	AGCC	2	8	58091	58098	25 %	0 %	25 %	50 %	528831156
138	NC_021907	CTCG	2	8	58157	58164	0 %	25 %	25 %	50 %	528831156
139	NC_021907	TCGC	2	8	58926	58933	0 %	25 %	25 %	50 %	528831156
140	NC_021907	TGAT	2	8	59307	59314	25 %	50 %	25 %	0 %	528831157
141	NC_021907	GGAT	2	8	59331	59338	25 %	25 %	50 %	0 %	528831157
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