MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 4076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	GAC	3	9	147	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831099
2	NC_021907	ATA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528831099
3	NC_021907	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831099
4	NC_021907	CCG	2	6	314	319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831099
5	NC_021907	GGC	2	6	336	341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831099
6	NC_021907	GAA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831099
7	NC_021907	TTC	2	6	536	541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831100
8	NC_021907	GAC	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831100
9	NC_021907	GAT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831100
10	NC_021907	CCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831101
11	NC_021907	CAT	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831101
12	NC_021907	TCT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831101
13	NC_021907	CGG	2	6	1129	1134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831101
14	NC_021907	TGC	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831101
15	NC_021907	GGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831101
16	NC_021907	ACG	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831101
17	NC_021907	CCG	2	6	1379	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831101
18	NC_021907	GGC	2	6	1532	1537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831101
19	NC_021907	GAG	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831101
20	NC_021907	GAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831101
21	NC_021907	TGC	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831101
22	NC_021907	CGC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831101
23	NC_021907	GCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831101
24	NC_021907	CGC	2	6	1867	1872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831101
25	NC_021907	TCG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831101
26	NC_021907	CAT	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831102
27	NC_021907	GGC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831102
28	NC_021907	TTC	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831102
29	NC_021907	ACG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831102
30	NC_021907	GCC	2	6	2168	2173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831102
31	NC_021907	TCG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831102
32	NC_021907	TCA	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831102
33	NC_021907	GCG	2	6	2268	2273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831102
34	NC_021907	GAC	3	9	2414	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831102
35	NC_021907	CGT	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831102
36	NC_021907	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831102
37	NC_021907	TCG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831102
38	NC_021907	GAG	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831102
39	NC_021907	GAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831102
40	NC_021907	CTC	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831102
41	NC_021907	CTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831102
42	NC_021907	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831102
43	NC_021907	CCA	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831102
44	NC_021907	CGC	2	6	2988	2993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831102
45	NC_021907	CGG	2	6	3012	3017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831102
46	NC_021907	CGA	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831102
47	NC_021907	ATC	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831102
48	NC_021907	GCC	2	6	3059	3064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831102
49	NC_021907	CGC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831102
50	NC_021907	ATC	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831102
51	NC_021907	GCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831103
52	NC_021907	TGA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831103
53	NC_021907	ATC	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831103
54	NC_021907	TCC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831103
55	NC_021907	TCG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
56	NC_021907	GAG	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831103
57	NC_021907	CAG	2	6	3595	3600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831103
58	NC_021907	CTG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
59	NC_021907	GCC	3	9	3656	3664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831103
60	NC_021907	CCG	2	6	3720	3725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831103
61	NC_021907	GAT	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831103
62	NC_021907	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831103
63	NC_021907	TCA	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831103
64	NC_021907	TCG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
65	NC_021907	TCA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831103
66	NC_021907	CGT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
67	NC_021907	GAG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831103
68	NC_021907	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
69	NC_021907	GCG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831103
70	NC_021907	TGC	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
71	NC_021907	TCG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831103
72	NC_021907	ACG	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831103
73	NC_021907	ATC	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831103
74	NC_021907	CGG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831103
75	NC_021907	GAC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831103
76	NC_021907	TGA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831103
77	NC_021907	TCC	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831104
78	NC_021907	CGC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831104
79	NC_021907	CTG	3	9	4672	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831104
80	NC_021907	CGG	3	9	4701	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831104
81	NC_021907	ACG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831104
82	NC_021907	GCC	2	6	4775	4780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831104
83	NC_021907	TGG	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831104
84	NC_021907	GGC	2	6	4821	4826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831104
85	NC_021907	GAC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831104
86	NC_021907	CCG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831104
87	NC_021907	GGC	2	6	5007	5012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831104
88	NC_021907	GAC	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
89	NC_021907	CAG	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
90	NC_021907	CGT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
91	NC_021907	CAT	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831105
92	NC_021907	TTC	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831105
93	NC_021907	TCG	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
94	NC_021907	GCC	2	6	5341	5346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
95	NC_021907	CGC	2	6	5399	5404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
96	NC_021907	GCT	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
97	NC_021907	TGC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
98	NC_021907	CTG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
99	NC_021907	GCC	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
100	NC_021907	TTC	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831105
101	NC_021907	CGG	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831105
102	NC_021907	GCC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
103	NC_021907	CGC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
104	NC_021907	GCT	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
105	NC_021907	ATC	2	6	5905	5910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831105
106	NC_021907	CGC	2	6	5981	5986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
107	NC_021907	CGT	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
108	NC_021907	ATG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831105
109	NC_021907	CGA	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
110	NC_021907	CCG	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
111	NC_021907	GCT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
112	NC_021907	CGA	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
113	NC_021907	TCG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
114	NC_021907	CGC	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
115	NC_021907	GTG	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831105
116	NC_021907	GCT	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
117	NC_021907	CAG	2	6	6556	6561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
118	NC_021907	TGC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
119	NC_021907	CGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
120	NC_021907	TCG	2	6	6644	6649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
121	NC_021907	TCA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831105
122	NC_021907	ACG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831105
123	NC_021907	CGT	2	6	6747	6752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831105
124	NC_021907	CCG	2	6	6787	6792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831105
125	NC_021907	GCA	2	6	7026	7031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831106
126	NC_021907	TCG	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831106
127	NC_021907	GGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831106
128	NC_021907	TCA	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831106
129	NC_021907	ACG	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831106
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132	NC_021907	GCG	2	6	7691	7696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831106
133	NC_021907	GGC	2	6	7749	7754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831106
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255	NC_021907	CGA	3	9	15112	15120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831118
256	NC_021907	GAA	2	6	15188	15193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831118
257	NC_021907	CGG	2	6	15305	15310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831119
258	NC_021907	CGC	2	6	15410	15415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831119
259	NC_021907	AGC	2	6	15454	15459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831119
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279	NC_021907	GCG	2	6	16575	16580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831120
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283	NC_021907	GCT	2	6	16805	16810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831120
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361	NC_021907	CAA	2	6	22232	22237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831125
362	NC_021907	ACG	2	6	22297	22302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831125
363	NC_021907	AAG	2	6	22344	22349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831125
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373	NC_021907	CGT	2	6	22995	23000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831126
374	NC_021907	CAT	2	6	23004	23009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831126
375	NC_021907	CCT	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831126
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377	NC_021907	CGG	2	6	23079	23084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831126
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