MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	T	6	6	6001	6006	0 %	100 %	0 %	0 %	528831105
2	NC_021907	T	6	6	10632	10637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021907	A	6	6	33699	33704	100 %	0 %	0 %	0 %	528831138
4	NC_021907	T	7	7	37924	37930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021907	C	6	6	43482	43487	0 %	0 %	0 %	100 %	528831145
6	NC_021907	C	7	7	49030	49036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_021907	G	6	6	50000	50005	0 %	0 %	100 %	0 %	528831151
8	NC_021907	C	6	6	57785	57790	0 %	0 %	0 %	100 %	528831156
9	NC_021907	G	6	6	57821	57826	0 %	0 %	100 %	0 %	528831156
10	NC_021907	A	6	6	73910	73915	100 %	0 %	0 %	0 %	528831171
11	NC_021907	C	6	6	76038	76043	0 %	0 %	0 %	100 %	528831172
12	NC_021907	T	7	7	76572	76578	0 %	100 %	0 %	0 %	528831173
13	NC_021907	C	6	6	79713	79718	0 %	0 %	0 %	100 %	528831176
14	NC_021907	T	6	6	80968	80973	0 %	100 %	0 %	0 %	528831177
15	NC_021907	C	6	6	88397	88402	0 %	0 %	0 %	100 %	528831182
16	NC_021907	T	6	6	91568	91573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021907	T	6	6	93392	93397	0 %	100 %	0 %	0 %	528831186
18	NC_021907	G	6	6	96911	96916	0 %	0 %	100 %	0 %	528831189
19	NC_021907	G	6	6	97262	97267	0 %	0 %	100 %	0 %	528831189
20	NC_021907	G	6	6	107334	107339	0 %	0 %	100 %	0 %	528831199
21	NC_021907	A	6	6	108351	108356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021907	A	6	6	108559	108564	100 %	0 %	0 %	0 %	528831201
23	NC_021907	T	6	6	114309	114314	0 %	100 %	0 %	0 %	528831202
24	NC_021907	T	6	6	116824	116829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021907	T	6	6	120494	120499	0 %	100 %	0 %	0 %	528831205
26	NC_021907	T	6	6	121458	121463	0 %	100 %	0 %	0 %	528831207
27	NC_021907	A	7	7	121906	121912	100 %	0 %	0 %	0 %	528831207
28	NC_021907	T	6	6	124648	124653	0 %	100 %	0 %	0 %	528831210
29	NC_021907	A	6	6	126085	126090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021907	G	6	6	130625	130630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021907	A	6	6	142745	142750	100 %	0 %	0 %	0 %	528831229
32	NC_021907	C	6	6	142880	142885	0 %	0 %	0 %	100 %	528831229
33	NC_021907	T	6	6	144602	144607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021907	C	6	6	161343	161348	0 %	0 %	0 %	100 %	528831245
35	NC_021907	T	9	9	163883	163891	0 %	100 %	0 %	0 %	528831247
36	NC_021907	G	6	6	166540	166545	0 %	0 %	100 %	0 %	528831249
37	NC_021907	T	6	6	177752	177757	0 %	100 %	0 %	0 %	528831261
38	NC_021907	A	6	6	178513	178518	100 %	0 %	0 %	0 %	528831262
39	NC_021907	T	6	6	181409	181414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021907	A	6	6	186047	186052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021907	A	6	6	191164	191169	100 %	0 %	0 %	0 %	528831275
42	NC_021907	T	6	6	197964	197969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021907	G	6	6	210450	210455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021907	A	7	7	211629	211635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021907	A	6	6	217786	217791	100 %	0 %	0 %	0 %	528831297
46	NC_021907	T	6	6	225177	225182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021907	A	6	6	225737	225742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021907	G	6	6	232943	232948	0 %	0 %	100 %	0 %	528831314
49	NC_021907	A	6	6	239831	239836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021907	T	6	6	245892	245897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021907	A	6	6	247209	247214	100 %	0 %	0 %	0 %	528831327
52	NC_021907	A	8	8	247498	247505	100 %	0 %	0 %	0 %	528831327
53	NC_021907	T	6	6	248867	248872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021907	C	6	6	249758	249763	0 %	0 %	0 %	100 %	528831329
55	NC_021907	A	6	6	251240	251245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.