MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021906	CGGC	2	8	156	163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021906	CAAT	2	8	621	628	50 %	25 %	0 %	25 %	528830927
3	NC_021906	TGAT	2	8	939	946	25 %	50 %	25 %	0 %	528830928
4	NC_021906	CTGG	2	8	1116	1123	0 %	25 %	50 %	25 %	528830929
5	NC_021906	TCCG	2	8	2071	2078	0 %	25 %	25 %	50 %	528830929
6	NC_021906	AAAT	2	8	2232	2239	75 %	25 %	0 %	0 %	528830929
7	NC_021906	AAGG	2	8	2452	2459	50 %	0 %	50 %	0 %	528830929
8	NC_021906	GGCG	2	8	2538	2545	0 %	0 %	75 %	25 %	528830929
9	NC_021906	CCAG	2	8	3626	3633	25 %	0 %	25 %	50 %	528830930
10	NC_021906	GATC	2	8	4195	4202	25 %	25 %	25 %	25 %	528830930
11	NC_021906	GGCC	2	8	4539	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021906	TGCC	2	8	5071	5078	0 %	25 %	25 %	50 %	528830931
13	NC_021906	GCCT	2	8	5084	5091	0 %	25 %	25 %	50 %	528830931
14	NC_021906	GGAA	2	8	6211	6218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021906	GCCG	2	8	6388	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	528830933
16	NC_021906	TCGC	2	8	6397	6404	0 %	25 %	25 %	50 %	528830933
17	NC_021906	CGAT	2	8	7645	7652	25 %	25 %	25 %	25 %	528830934
18	NC_021906	AGCG	2	8	7845	7852	25 %	0 %	50 %	25 %	528830934
19	NC_021906	CGGC	2	8	8073	8080	0 %	0 %	50 %	50 %	528830934
20	NC_021906	TCGC	2	8	8384	8391	0 %	25 %	25 %	50 %	528830935
21	NC_021906	TGCT	2	8	8414	8421	0 %	50 %	25 %	25 %	528830935
22	NC_021906	GGCC	2	8	8598	8605	0 %	0 %	50 %	50 %	528830935
23	NC_021906	CTCG	2	8	8706	8713	0 %	25 %	25 %	50 %	528830935
24	NC_021906	CAAG	2	8	8922	8929	50 %	0 %	25 %	25 %	528830935
25	NC_021906	GTCG	2	8	9108	9115	0 %	25 %	50 %	25 %	528830935
26	NC_021906	GCCA	2	8	9182	9189	25 %	0 %	25 %	50 %	528830935
27	NC_021906	TACC	2	8	9207	9214	25 %	25 %	0 %	50 %	528830935
28	NC_021906	GTCC	2	8	9387	9394	0 %	25 %	25 %	50 %	528830935
29	NC_021906	CGTG	2	8	10590	10597	0 %	25 %	50 %	25 %	528830936
30	NC_021906	CTCG	2	8	10728	10735	0 %	25 %	25 %	50 %	528830936
31	NC_021906	CGAC	2	8	11048	11055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021906	GAAA	2	8	11075	11082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021906	GGCC	2	8	11322	11329	0 %	0 %	50 %	50 %	528830937
34	NC_021906	CTGA	2	8	11977	11984	25 %	25 %	25 %	25 %	528830937
35	NC_021906	AGCA	2	8	12572	12579	50 %	0 %	25 %	25 %	528830939
36	NC_021906	GGGC	2	8	12882	12889	0 %	0 %	75 %	25 %	528830939
37	NC_021906	GTCG	2	8	13474	13481	0 %	25 %	50 %	25 %	528830939
38	NC_021906	CCAG	2	8	13492	13499	25 %	0 %	25 %	50 %	528830939
39	NC_021906	CAGG	2	8	13796	13803	25 %	0 %	50 %	25 %	528830939
40	NC_021906	ACCA	2	8	13958	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	528830939
41	NC_021906	TGTT	2	8	14028	14035	0 %	75 %	25 %	0 %	528830939
42	NC_021906	CATC	2	8	14098	14105	25 %	25 %	0 %	50 %	528830939
43	NC_021906	GCCG	2	8	14303	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	528830940
44	NC_021906	GGGC	2	8	14378	14385	0 %	0 %	75 %	25 %	528830941
45	NC_021906	GGCG	2	8	14639	14646	0 %	0 %	75 %	25 %	528830941
46	NC_021906	GCCT	2	8	14748	14755	0 %	25 %	25 %	50 %	528830941
47	NC_021906	CCGA	2	8	14874	14881	25 %	0 %	25 %	50 %	528830941
48	NC_021906	GCGA	2	8	15275	15282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021906	TCGC	2	8	15852	15859	0 %	25 %	25 %	50 %	528830943
50	NC_021906	CGGT	2	8	15892	15899	0 %	25 %	50 %	25 %	528830943
51	NC_021906	CGGC	2	8	15994	16001	0 %	0 %	50 %	50 %	528830943
52	NC_021906	CCGG	2	8	16748	16755	0 %	0 %	50 %	50 %	528830945
53	NC_021906	GACG	2	8	17244	17251	25 %	0 %	50 %	25 %	528830945
54	NC_021906	CAGC	2	8	17292	17299	25 %	0 %	25 %	50 %	528830945
55	NC_021906	GTGA	2	8	17454	17461	25 %	25 %	50 %	0 %	528830945
56	NC_021906	GCAT	2	8	17600	17607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021906	GCAC	2	8	17628	17635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021906	CTTC	2	8	17750	17757	0 %	50 %	0 %	50 %	528830946
59	NC_021906	CTGG	2	8	18462	18469	0 %	25 %	50 %	25 %	528830946
60	NC_021906	CTTT	2	8	18626	18633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021906	GACC	2	8	18672	18679	25 %	0 %	25 %	50 %	528830947
62	NC_021906	CGTG	2	8	19092	19099	0 %	25 %	50 %	25 %	528830947
63	NC_021906	AACA	2	8	19451	19458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021906	CGGC	2	8	19953	19960	0 %	0 %	50 %	50 %	528830948
65	NC_021906	CGCC	2	8	20818	20825	0 %	0 %	25 %	75 %	528830948
66	NC_021906	CCGA	2	8	21169	21176	25 %	0 %	25 %	50 %	528830949
67	NC_021906	CTCG	2	8	21828	21835	0 %	25 %	25 %	50 %	528830949
68	NC_021906	GATC	2	8	22596	22603	25 %	25 %	25 %	25 %	528830950
69	NC_021906	GCCG	2	8	22890	22897	0 %	0 %	50 %	50 %	528830950
70	NC_021906	CGGG	2	8	23088	23095	0 %	0 %	75 %	25 %	528830950
71	NC_021906	CGGC	2	8	23133	23140	0 %	0 %	50 %	50 %	528830950
72	NC_021906	TCCG	2	8	23235	23242	0 %	25 %	25 %	50 %	528830950
73	NC_021906	GCAG	2	8	24192	24199	25 %	0 %	50 %	25 %	528830952
74	NC_021906	CTGG	2	8	24206	24213	0 %	25 %	50 %	25 %	528830952
75	NC_021906	TTCC	2	8	24701	24708	0 %	50 %	0 %	50 %	528830952
76	NC_021906	TTCA	2	8	25188	25195	25 %	50 %	0 %	25 %	528830953
77	NC_021906	TCCA	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	528830954
78	NC_021906	AAGG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	50 %	0 %	528830954
79	NC_021906	ACCG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	528830954
80	NC_021906	CCGG	2	8	27098	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021906	ATCT	2	8	27166	27173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021906	GCGA	2	8	27210	27217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021906	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	528830955
84	NC_021906	GCTG	2	8	27662	27669	0 %	25 %	50 %	25 %	528830955
85	NC_021906	GATC	2	8	28764	28771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021906	GCAG	2	8	29501	29508	25 %	0 %	50 %	25 %	528830956
87	NC_021906	CGAG	2	8	30021	30028	25 %	0 %	50 %	25 %	528830957
88	NC_021906	GGCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	50 %	50 %	528830957
89	NC_021906	ATGG	2	8	30388	30395	25 %	25 %	50 %	0 %	528830957
90	NC_021906	GCGT	2	8	31917	31924	0 %	25 %	50 %	25 %	528830958
91	NC_021906	CGGC	2	8	32283	32290	0 %	0 %	50 %	50 %	528830959
92	NC_021906	CGGC	2	8	32620	32627	0 %	0 %	50 %	50 %	528830960
93	NC_021906	TCGG	2	8	32794	32801	0 %	25 %	50 %	25 %	528830960
94	NC_021906	CGGG	2	8	32804	32811	0 %	0 %	75 %	25 %	528830960
95	NC_021906	CGAA	2	8	33094	33101	50 %	0 %	25 %	25 %	528830960
96	NC_021906	TCCG	2	8	33231	33238	0 %	25 %	25 %	50 %	528830960
97	NC_021906	AGGC	2	8	33531	33538	25 %	0 %	50 %	25 %	528830960
98	NC_021906	CGCC	2	8	33942	33949	0 %	0 %	25 %	75 %	528830961
99	NC_021906	GCCG	2	8	33993	34000	0 %	0 %	50 %	50 %	528830961
100	NC_021906	TCGA	2	8	35538	35545	25 %	25 %	25 %	25 %	528830962
101	NC_021906	CCAG	2	8	35668	35675	25 %	0 %	25 %	50 %	528830962
102	NC_021906	GGAC	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021906	CCGT	2	8	36576	36583	0 %	25 %	25 %	50 %	528830963
104	NC_021906	TTCC	2	8	37100	37107	0 %	50 %	0 %	50 %	528830963
105	NC_021906	CCGC	2	8	37180	37187	0 %	0 %	25 %	75 %	528830963
106	NC_021906	CGGC	2	8	37334	37341	0 %	0 %	50 %	50 %	528830963
107	NC_021906	GATG	2	8	37968	37975	25 %	25 %	50 %	0 %	528830964
108	NC_021906	GTCG	2	8	39087	39094	0 %	25 %	50 %	25 %	528830965
109	NC_021906	GCCG	2	8	39311	39318	0 %	0 %	50 %	50 %	528830965
110	NC_021906	TGCC	2	8	39971	39978	0 %	25 %	25 %	50 %	528830966
111	NC_021906	GATG	2	8	40355	40362	25 %	25 %	50 %	0 %	528830966
112	NC_021906	CGGC	2	8	40518	40525	0 %	0 %	50 %	50 %	528830967
113	NC_021906	CGCC	2	8	41002	41009	0 %	0 %	25 %	75 %	528830967
114	NC_021906	GGCA	2	8	41791	41798	25 %	0 %	50 %	25 %	528830968
115	NC_021906	TCGA	2	8	42077	42084	25 %	25 %	25 %	25 %	528830968
116	NC_021906	GCAT	2	8	42111	42118	25 %	25 %	25 %	25 %	528830968
117	NC_021906	GGTC	2	8	42327	42334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021906	GCCG	2	8	42687	42694	0 %	0 %	50 %	50 %	528830969
119	NC_021906	TATT	2	8	42803	42810	25 %	75 %	0 %	0 %	528830970
120	NC_021906	TCGC	2	8	43184	43191	0 %	25 %	25 %	50 %	528830970
121	NC_021906	CCGG	2	8	43580	43587	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
122	NC_021906	GCAA	2	8	44047	44054	50 %	0 %	25 %	25 %	528830971
123	NC_021906	GATC	2	8	44298	44305	25 %	25 %	25 %	25 %	528830971
124	NC_021906	CAGC	2	8	44385	44392	25 %	0 %	25 %	50 %	528830971
125	NC_021906	TGTC	2	8	45237	45244	0 %	50 %	25 %	25 %	528830971
126	NC_021906	CGAT	2	8	45251	45258	25 %	25 %	25 %	25 %	528830971
127	NC_021906	CCGA	2	8	45942	45949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021906	ATGC	2	8	46647	46654	25 %	25 %	25 %	25 %	528830972
129	NC_021906	GTTC	2	8	46711	46718	0 %	50 %	25 %	25 %	528830972
130	NC_021906	GACG	2	8	48033	48040	25 %	0 %	50 %	25 %	528830973
131	NC_021906	ATGA	2	8	48058	48065	50 %	25 %	25 %	0 %	528830973
132	NC_021906	GCGA	2	8	48076	48083	25 %	0 %	50 %	25 %	528830973
133	NC_021906	TTGC	2	8	48169	48176	0 %	50 %	25 %	25 %	528830973
134	NC_021906	GACG	2	8	48309	48316	25 %	0 %	50 %	25 %	528830974
135	NC_021906	CCAT	2	8	48683	48690	25 %	25 %	0 %	50 %	528830975
136	NC_021906	ACCG	2	8	49106	49113	25 %	0 %	25 %	50 %	528830975
137	NC_021906	TGCT	2	8	49342	49349	0 %	50 %	25 %	25 %	528830975
138	NC_021906	GAAG	2	8	49388	49395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021906	GATT	2	8	49600	49607	25 %	50 %	25 %	0 %	528830976
140	NC_021906	GCGG	2	8	49708	49715	0 %	0 %	75 %	25 %	528830976
141	NC_021906	GCCG	2	8	49886	49893	0 %	0 %	50 %	50 %	528830976
142	NC_021906	CGGT	2	8	50056	50063	0 %	25 %	50 %	25 %	528830976
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