MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021906	CGGC	2	8	156	163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021906	GGCC	2	8	4539	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021906	GGAA	2	8	6211	6218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021906	CGAC	2	8	11048	11055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021906	GAAA	2	8	11075	11082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021906	GCGA	2	8	15275	15282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021906	GCAT	2	8	17600	17607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021906	GCAC	2	8	17628	17635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021906	CTTT	2	8	18626	18633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021906	AACA	2	8	19451	19458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021906	CCGG	2	8	27098	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021906	ATCT	2	8	27166	27173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021906	GCGA	2	8	27210	27217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021906	GATC	2	8	28764	28771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021906	GGAC	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021906	GGTC	2	8	42327	42334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021906	CCGA	2	8	45942	45949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021906	GAAG	2	8	49388	49395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021906	CGGA	2	8	55563	55570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021906	GAAT	2	8	70226	70233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021906	AGGT	2	8	70328	70335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021906	GTCC	2	8	70631	70638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021906	AAAC	2	8	73776	73783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021906	TGCC	2	8	73815	73822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021906	GGTT	2	8	75676	75683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021906	ATTG	2	8	92084	92091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021906	TCGC	2	8	92119	92126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021906	CAGA	2	8	107715	107722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021906	GGCG	2	8	108017	108024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021906	TCGT	2	8	112216	112223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021906	GTCG	2	8	112227	112234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021906	CATG	2	8	120884	120891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021906	GCAT	2	8	120907	120914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021906	CTTC	2	8	125458	125465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021906	AGTC	2	8	126824	126831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021906	AGCC	2	8	130049	130056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021906	TTTC	2	8	131666	131673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021906	GATC	2	8	139630	139637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021906	GAAG	2	8	151440	151447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021906	GTCG	2	8	151968	151975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021906	GGCC	2	8	152273	152280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021906	GATC	2	8	152534	152541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021906	AGCC	2	8	155735	155742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021906	AGTT	2	8	155762	155769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021906	CGTC	2	8	156896	156903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021906	GGCG	2	8	162774	162781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021906	TTGC	2	8	165629	165636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021906	CTGC	2	8	172175	172182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021906	CTGA	2	8	174872	174879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021906	AGAA	2	8	175050	175057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021906	TCCA	2	8	177260	177267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021906	CCGG	2	8	177358	177365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021906	CGGC	2	8	177421	177428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.