MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 3222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021906	CTT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021906	TTC	2	6	86	91	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021906	CGA	2	6	149	154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021906	GAA	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021906	GTC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830927
6	NC_021906	GCA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830927
7	NC_021906	CGA	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830927
8	NC_021906	TCG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830927
9	NC_021906	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830927
10	NC_021906	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830927
11	NC_021906	ATT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021906	ACA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830928
13	NC_021906	GGT	2	6	929	934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830928
14	NC_021906	TCG	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830928
15	NC_021906	CTG	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830928
16	NC_021906	TGC	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830928
17	NC_021906	TGG	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830929
18	NC_021906	CTG	3	9	1378	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
19	NC_021906	GGC	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830929
20	NC_021906	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
21	NC_021906	GAT	3	9	1561	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830929
22	NC_021906	CAT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830929
23	NC_021906	CTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830929
24	NC_021906	GCT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
25	NC_021906	CAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830929
26	NC_021906	GGT	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830929
27	NC_021906	CGG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830929
28	NC_021906	CGG	2	6	1914	1919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830929
29	NC_021906	GCC	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830929
30	NC_021906	GGC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830929
31	NC_021906	CGC	3	9	2136	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830929
32	NC_021906	TCG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
33	NC_021906	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830929
34	NC_021906	TCC	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830929
35	NC_021906	CGT	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
36	NC_021906	GCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830929
37	NC_021906	GCG	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830929
38	NC_021906	GAA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830929
39	NC_021906	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
40	NC_021906	GAA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830929
41	NC_021906	CGT	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830929
42	NC_021906	GCT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830930
43	NC_021906	AGC	3	9	3211	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830930
44	NC_021906	CAG	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830930
45	NC_021906	CAG	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830930
46	NC_021906	CGG	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830930
47	NC_021906	CGC	2	6	3740	3745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830930
48	NC_021906	CAG	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830930
49	NC_021906	CGC	2	6	3774	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830930
50	NC_021906	GGC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830930
51	NC_021906	TTC	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830930
52	NC_021906	ATC	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830930
53	NC_021906	ACC	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830930
54	NC_021906	ACC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830930
55	NC_021906	GAG	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830930
56	NC_021906	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528830930
57	NC_021906	AGG	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021906	CAG	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021906	ACG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021906	CGG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021906	TGG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021906	CGC	2	6	4614	4619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021906	GAG	2	6	4643	4648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021906	GGT	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021906	GGC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021906	GGA	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830931
67	NC_021906	TCC	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830931
68	NC_021906	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830931
69	NC_021906	GTC	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830931
70	NC_021906	CGT	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830931
71	NC_021906	TTC	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830931
72	NC_021906	CCT	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021906	AAC	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021906	CAC	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830932
75	NC_021906	GCC	2	6	5587	5592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830932
76	NC_021906	GCT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830932
77	NC_021906	GGT	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830932
78	NC_021906	CCG	2	6	5787	5792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830932
79	NC_021906	GCC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830932
80	NC_021906	ATC	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830932
81	NC_021906	CGG	2	6	5996	6001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830932
82	NC_021906	GTC	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830932
83	NC_021906	CGC	2	6	6070	6075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830932
84	NC_021906	TGC	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830932
85	NC_021906	GAT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830932
86	NC_021906	CGA	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830932
87	NC_021906	ATT	2	6	6165	6170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830932
88	NC_021906	CTG	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830932
89	NC_021906	GAT	2	6	6272	6277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830933
90	NC_021906	CCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830933
91	NC_021906	GAC	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830933
92	NC_021906	GTC	2	6	6419	6424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830933
93	NC_021906	CGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830933
94	NC_021906	CGT	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830933
95	NC_021906	GCG	2	6	6674	6679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830933
96	NC_021906	GTC	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830933
97	NC_021906	GGA	3	9	6736	6744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830933
98	NC_021906	CAT	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830933
99	NC_021906	CGG	2	6	6903	6908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830933
100	NC_021906	CGA	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830933
101	NC_021906	CCG	2	6	6950	6955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830933
102	NC_021906	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830933
103	NC_021906	TGC	2	6	7003	7008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830933
104	NC_021906	CCG	2	6	7243	7248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830933
105	NC_021906	GAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830933
106	NC_021906	CGA	2	6	7303	7308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830933
107	NC_021906	CGC	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021906	GCA	2	6	7556	7561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830934
109	NC_021906	ATC	2	6	7585	7590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830934
110	NC_021906	GGC	2	6	7611	7616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830934
111	NC_021906	TCC	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830934
112	NC_021906	TGG	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830934
113	NC_021906	ATC	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830934
114	NC_021906	TCG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830934
115	NC_021906	GCC	2	6	8026	8031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830934
116	NC_021906	GAT	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830934
117	NC_021906	TCG	3	9	8053	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830934
118	NC_021906	TCT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830934
119	NC_021906	AAC	3	9	8278	8286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830935
120	NC_021906	TCG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830935
121	NC_021906	GCC	2	6	8365	8370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830935
122	NC_021906	GCG	2	6	8396	8401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830935
123	NC_021906	GCT	2	6	8449	8454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830935
124	NC_021906	TAT	2	6	8455	8460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830935
125	NC_021906	ACT	2	6	8468	8473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830935
126	NC_021906	CGA	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
127	NC_021906	ACA	2	6	8525	8530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830935
128	NC_021906	TCG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830935
129	NC_021906	CGA	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
130	NC_021906	CGC	2	6	8640	8645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830935
131	NC_021906	CAG	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
132	NC_021906	CGA	2	6	8726	8731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
133	NC_021906	GCC	2	6	8734	8739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830935
134	NC_021906	GCA	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
135	NC_021906	GGC	2	6	8853	8858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830935
136	NC_021906	CGC	2	6	8868	8873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830935
137	NC_021906	CGA	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830935
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139	NC_021906	GCC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830935
140	NC_021906	GCT	2	6	9276	9281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830935
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154	NC_021906	TCA	2	6	10019	10024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830936
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164	NC_021906	CAT	2	6	10539	10544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830936
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173	NC_021906	ATC	2	6	11067	11072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_021906	CCT	2	6	11086	11091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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243	NC_021906	ATC	2	6	14727	14732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830941
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246	NC_021906	CCG	2	6	14946	14951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_021906	GCC	2	6	14982	14987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_021906	GCA	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021906	TAC	2	6	15027	15032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830942
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252	NC_021906	CGT	2	6	15146	15151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830942
253	NC_021906	CGG	2	6	15260	15265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_021906	GCC	2	6	15468	15473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_021906	GAA	2	6	15515	15520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830943
256	NC_021906	GGC	2	6	15572	15577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830943
257	NC_021906	GCC	2	6	15582	15587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830943
258	NC_021906	CGG	3	9	15662	15670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830943
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263	NC_021906	CGG	2	6	16062	16067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_021906	ATT	2	6	16080	16085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021906	CGA	2	6	16102	16107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021906	CGC	2	6	16189	16194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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272	NC_021906	TCT	2	6	16627	16632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_021906	CGA	2	6	16802	16807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830945
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282	NC_021906	GGC	2	6	17658	17663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830946
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381	NC_021906	CGG	2	6	23360	23365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830951
382	NC_021906	TGA	2	6	23375	23380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830951
383	NC_021906	CGT	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830951
384	NC_021906	ACT	2	6	23390	23395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830951
385	NC_021906	TTC	2	6	23425	23430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830951
386	NC_021906	CTG	2	6	23500	23505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830951
387	NC_021906	TCA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830951
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389	NC_021906	CGT	2	6	23634	23639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830951
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391	NC_021906	TGC	2	6	23795	23800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830951
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393	NC_021906	TGC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830951
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412	NC_021906	CGA	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830952
413	NC_021906	CTT	2	6	24713	24718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830952
414	NC_021906	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830952
415	NC_021906	CTT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830952
416	NC_021906	CTG	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830952
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420	NC_021906	CAT	2	6	24917	24922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830952
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423	NC_021906	CGC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830953
424	NC_021906	TGC	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830953
425	NC_021906	ACC	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830953
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427	NC_021906	TGG	2	6	25230	25235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830953
428	NC_021906	GCC	2	6	25321	25326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_021906	GGA	2	6	25356	25361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_021906	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830954
431	NC_021906	GAC	3	9	25383	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
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433	NC_021906	TCG	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
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442	NC_021906	CGA	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
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449	NC_021906	GAA	2	6	26634	26639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
450	NC_021906	CGG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830954
451	NC_021906	TGG	2	6	26809	26814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830954
452	NC_021906	TCC	2	6	26833	26838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830954
453	NC_021906	TGC	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
454	NC_021906	GAA	2	6	26988	26993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
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466	NC_021906	CTG	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
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487	NC_021906	GAC	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
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493	NC_021906	GCG	2	6	28758	28763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_021906	GAT	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830956
495	NC_021906	ACC	2	6	28886	28891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830956
496	NC_021906	GAA	2	6	28974	28979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830956
497	NC_021906	GCC	2	6	28995	29000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830956
498	NC_021906	GCG	2	6	29013	29018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830956
499	NC_021906	TCA	2	6	29084	29089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830956
500	NC_021906	CCG	2	6	29117	29122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830956

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