MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021906	GC	3	6	2776	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	528830929
2	NC_021906	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	528830929
3	NC_021906	AG	3	6	3137	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	528830930
4	NC_021906	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	528830930
5	NC_021906	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	528830930
6	NC_021906	TC	3	6	4518	4523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021906	GC	3	6	4618	4623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021906	CG	3	6	4973	4978	0 %	0 %	50 %	50 %	528830931
9	NC_021906	AG	3	6	5203	5208	50 %	0 %	50 %	0 %	528830931
10	NC_021906	TC	3	6	5496	5501	0 %	50 %	0 %	50 %	528830932
11	NC_021906	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	528830932
12	NC_021906	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	528830933
13	NC_021906	GC	3	6	7072	7077	0 %	0 %	50 %	50 %	528830933
14	NC_021906	GC	3	6	7475	7480	0 %	0 %	50 %	50 %	528830934
15	NC_021906	GC	3	6	7567	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	528830934
16	NC_021906	GA	4	8	8241	8248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021906	GC	4	8	8740	8747	0 %	0 %	50 %	50 %	528830935
18	NC_021906	CT	3	6	9013	9018	0 %	50 %	0 %	50 %	528830935
19	NC_021906	CG	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	528830936
20	NC_021906	GC	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	528830937
21	NC_021906	GC	3	6	11521	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	528830937
22	NC_021906	GA	3	6	11937	11942	50 %	0 %	50 %	0 %	528830937
23	NC_021906	CG	3	6	12075	12080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021906	CG	3	6	12103	12108	0 %	0 %	50 %	50 %	528830938
25	NC_021906	GC	3	6	13029	13034	0 %	0 %	50 %	50 %	528830939
26	NC_021906	GC	4	8	13388	13395	0 %	0 %	50 %	50 %	528830939
27	NC_021906	GC	3	6	14135	14140	0 %	0 %	50 %	50 %	528830939
28	NC_021906	GA	3	6	15504	15509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021906	CG	3	6	16074	16079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021906	GC	3	6	16617	16622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021906	GC	3	6	16871	16876	0 %	0 %	50 %	50 %	528830945
32	NC_021906	CG	3	6	16948	16953	0 %	0 %	50 %	50 %	528830945
33	NC_021906	GC	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	528830945
34	NC_021906	AG	3	6	17236	17241	50 %	0 %	50 %	0 %	528830945
35	NC_021906	CG	3	6	17392	17397	0 %	0 %	50 %	50 %	528830945
36	NC_021906	GC	3	6	18290	18295	0 %	0 %	50 %	50 %	528830946
37	NC_021906	GC	4	8	18403	18410	0 %	0 %	50 %	50 %	528830946
38	NC_021906	GC	3	6	19199	19204	0 %	0 %	50 %	50 %	528830947
39	NC_021906	CG	4	8	19618	19625	0 %	0 %	50 %	50 %	528830948
40	NC_021906	CG	3	6	20568	20573	0 %	0 %	50 %	50 %	528830948
41	NC_021906	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	528830949
42	NC_021906	GC	3	6	21994	21999	0 %	0 %	50 %	50 %	528830949
43	NC_021906	GC	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	528830950
44	NC_021906	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	528830952
45	NC_021906	AT	3	6	25717	25722	50 %	50 %	0 %	0 %	528830954
46	NC_021906	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	528830954
47	NC_021906	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	528830954
48	NC_021906	CG	3	6	27532	27537	0 %	0 %	50 %	50 %	528830955
49	NC_021906	GT	3	6	27715	27720	0 %	50 %	50 %	0 %	528830955
50	NC_021906	GC	3	6	28289	28294	0 %	0 %	50 %	50 %	528830955
51	NC_021906	GA	3	6	28861	28866	50 %	0 %	50 %	0 %	528830956
52	NC_021906	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	528830956
53	NC_021906	GC	3	6	29766	29771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021906	GC	3	6	30722	30727	0 %	0 %	50 %	50 %	528830957
55	NC_021906	GC	4	8	31316	31323	0 %	0 %	50 %	50 %	528830958
56	NC_021906	GC	3	6	31587	31592	0 %	0 %	50 %	50 %	528830958
57	NC_021906	GC	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	528830958
58	NC_021906	GC	3	6	32404	32409	0 %	0 %	50 %	50 %	528830960
59	NC_021906	CG	4	8	32592	32599	0 %	0 %	50 %	50 %	528830960
60	NC_021906	TC	3	6	32648	32653	0 %	50 %	0 %	50 %	528830960
61	NC_021906	AG	3	6	32681	32686	50 %	0 %	50 %	0 %	528830960
62	NC_021906	CG	3	6	32975	32980	0 %	0 %	50 %	50 %	528830960
63	NC_021906	CG	4	8	33628	33635	0 %	0 %	50 %	50 %	528830961
64	NC_021906	CG	3	6	33762	33767	0 %	0 %	50 %	50 %	528830961
65	NC_021906	GA	3	6	34691	34696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021906	GC	3	6	35180	35185	0 %	0 %	50 %	50 %	528830962
67	NC_021906	CG	3	6	35365	35370	0 %	0 %	50 %	50 %	528830962
68	NC_021906	CG	3	6	35697	35702	0 %	0 %	50 %	50 %	528830962
69	NC_021906	GC	3	6	36435	36440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021906	GC	4	8	36656	36663	0 %	0 %	50 %	50 %	528830963
71	NC_021906	CG	3	6	37462	37467	0 %	0 %	50 %	50 %	528830963
72	NC_021906	CG	3	6	37687	37692	0 %	0 %	50 %	50 %	528830964
73	NC_021906	GC	3	6	37979	37984	0 %	0 %	50 %	50 %	528830964
74	NC_021906	GC	3	6	38092	38097	0 %	0 %	50 %	50 %	528830964
75	NC_021906	GC	3	6	39069	39074	0 %	0 %	50 %	50 %	528830965
76	NC_021906	CG	3	6	39221	39226	0 %	0 %	50 %	50 %	528830965
77	NC_021906	CG	3	6	39534	39539	0 %	0 %	50 %	50 %	528830966
78	NC_021906	CG	4	8	40611	40618	0 %	0 %	50 %	50 %	528830967
79	NC_021906	CG	3	6	40883	40888	0 %	0 %	50 %	50 %	528830967
80	NC_021906	GC	3	6	40979	40984	0 %	0 %	50 %	50 %	528830967
81	NC_021906	GC	3	6	41750	41755	0 %	0 %	50 %	50 %	528830968
82	NC_021906	GC	3	6	41808	41813	0 %	0 %	50 %	50 %	528830968
83	NC_021906	CT	3	6	42128	42133	0 %	50 %	0 %	50 %	528830968
84	NC_021906	TG	3	6	43407	43412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021906	CG	3	6	44571	44576	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
86	NC_021906	CG	3	6	45311	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	528830971
87	NC_021906	GC	3	6	45537	45542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021906	CT	3	6	46426	46431	0 %	50 %	0 %	50 %	528830972
89	NC_021906	GA	3	6	48511	48516	50 %	0 %	50 %	0 %	528830974
90	NC_021906	GC	3	6	48709	48714	0 %	0 %	50 %	50 %	528830975
91	NC_021906	GC	3	6	52213	52218	0 %	0 %	50 %	50 %	528830979
92	NC_021906	GC	3	6	52369	52374	0 %	0 %	50 %	50 %	528830979
93	NC_021906	GC	3	6	52756	52761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021906	GT	3	6	53997	54002	0 %	50 %	50 %	0 %	528830983
95	NC_021906	CG	3	6	54453	54458	0 %	0 %	50 %	50 %	528830984
96	NC_021906	TC	4	8	54840	54847	0 %	50 %	0 %	50 %	528830984
97	NC_021906	GC	3	6	56538	56543	0 %	0 %	50 %	50 %	528830985
98	NC_021906	CA	3	6	56815	56820	50 %	0 %	0 %	50 %	528830986
99	NC_021906	CG	3	6	57216	57221	0 %	0 %	50 %	50 %	528830986
100	NC_021906	TC	3	6	57781	57786	0 %	50 %	0 %	50 %	528830986
101	NC_021906	CG	4	8	57955	57962	0 %	0 %	50 %	50 %	528830986
102	NC_021906	CG	3	6	58307	58312	0 %	0 %	50 %	50 %	528830986
103	NC_021906	GC	3	6	58543	58548	0 %	0 %	50 %	50 %	528830986
104	NC_021906	CG	3	6	58986	58991	0 %	0 %	50 %	50 %	528830987
105	NC_021906	TG	3	6	61442	61447	0 %	50 %	50 %	0 %	528830989
106	NC_021906	CG	3	6	61680	61685	0 %	0 %	50 %	50 %	528830989
107	NC_021906	CG	3	6	61731	61736	0 %	0 %	50 %	50 %	528830989
108	NC_021906	CG	4	8	61867	61874	0 %	0 %	50 %	50 %	528830989
109	NC_021906	GC	3	6	61943	61948	0 %	0 %	50 %	50 %	528830989
110	NC_021906	AC	3	6	61966	61971	50 %	0 %	0 %	50 %	528830989
111	NC_021906	GC	3	6	62022	62027	0 %	0 %	50 %	50 %	528830989
112	NC_021906	GC	4	8	62522	62529	0 %	0 %	50 %	50 %	528830990
113	NC_021906	GC	3	6	62668	62673	0 %	0 %	50 %	50 %	528830990
114	NC_021906	GC	3	6	63630	63635	0 %	0 %	50 %	50 %	528830991
115	NC_021906	CG	3	6	64030	64035	0 %	0 %	50 %	50 %	528830991
116	NC_021906	GA	3	6	64288	64293	50 %	0 %	50 %	0 %	528830992
117	NC_021906	TC	3	6	65326	65331	0 %	50 %	0 %	50 %	528830993
118	NC_021906	GC	4	8	65444	65451	0 %	0 %	50 %	50 %	528830993
119	NC_021906	GA	3	6	66106	66111	50 %	0 %	50 %	0 %	528830994
120	NC_021906	TA	3	6	66422	66427	50 %	50 %	0 %	0 %	528830995
121	NC_021906	GA	3	6	66972	66977	50 %	0 %	50 %	0 %	528830995
122	NC_021906	CG	3	6	67570	67575	0 %	0 %	50 %	50 %	528830996
123	NC_021906	CG	3	6	68101	68106	0 %	0 %	50 %	50 %	528830997
124	NC_021906	GA	3	6	68799	68804	50 %	0 %	50 %	0 %	528830997
125	NC_021906	CG	3	6	71770	71775	0 %	0 %	50 %	50 %	528830999
126	NC_021906	CG	3	6	71992	71997	0 %	0 %	50 %	50 %	528830999
127	NC_021906	GC	3	6	72201	72206	0 %	0 %	50 %	50 %	528830999
128	NC_021906	GC	3	6	73193	73198	0 %	0 %	50 %	50 %	528830999
129	NC_021906	CT	3	6	73283	73288	0 %	50 %	0 %	50 %	528830999
130	NC_021906	CG	3	6	73599	73604	0 %	0 %	50 %	50 %	528830999
131	NC_021906	CG	4	8	74698	74705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021906	CG	3	6	74858	74863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021906	TC	3	6	75053	75058	0 %	50 %	0 %	50 %	528831002
134	NC_021906	CG	3	6	76672	76677	0 %	0 %	50 %	50 %	528831003
135	NC_021906	CG	3	6	77055	77060	0 %	0 %	50 %	50 %	528831003
136	NC_021906	GC	3	6	77867	77872	0 %	0 %	50 %	50 %	528831004
137	NC_021906	CG	3	6	79231	79236	0 %	0 %	50 %	50 %	528831005
138	NC_021906	CG	3	6	79366	79371	0 %	0 %	50 %	50 %	528831005
139	NC_021906	CG	3	6	80388	80393	0 %	0 %	50 %	50 %	528831006
140	NC_021906	GC	3	6	81063	81068	0 %	0 %	50 %	50 %	528831006
141	NC_021906	CG	3	6	81631	81636	0 %	0 %	50 %	50 %	528831007
142	NC_021906	AT	3	6	81976	81981	50 %	50 %	0 %	0 %	528831007
143	NC_021906	CG	3	6	82020	82025	0 %	0 %	50 %	50 %	528831007
144	NC_021906	GC	3	6	82547	82552	0 %	0 %	50 %	50 %	528831008
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.