MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 3037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	528826862
2	NC_021905	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	528826865
3	NC_021905	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	528826866
4	NC_021905	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	528826869
5	NC_021905	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	528826870
6	NC_021905	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	528826870
7	NC_021905	TGGCG	2	10	8741	8750	0 %	20 %	60 %	20 %	528826873
8	NC_021905	CATCT	2	10	11703	11712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021905	GCCGG	2	10	11984	11993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021905	GCCGC	2	10	14253	14262	0 %	0 %	40 %	60 %	528826877
11	NC_021905	CGCGC	2	10	15142	15151	0 %	0 %	40 %	60 %	528826877
12	NC_021905	CATCG	2	10	16327	16336	20 %	20 %	20 %	40 %	528826879
13	NC_021905	CGGCA	2	10	16741	16750	20 %	0 %	40 %	40 %	528826879
14	NC_021905	TCGTT	2	10	17600	17609	0 %	60 %	20 %	20 %	528826881
15	NC_021905	CCATT	2	10	18452	18461	20 %	40 %	0 %	40 %	528826881
16	NC_021905	TCCGA	2	10	18915	18924	20 %	20 %	20 %	40 %	528826882
17	NC_021905	GGCGA	2	10	20049	20058	20 %	0 %	60 %	20 %	528826883
18	NC_021905	ATGGT	2	10	20395	20404	20 %	40 %	40 %	0 %	528826883
19	NC_021905	GGCCG	2	10	21454	21463	0 %	0 %	60 %	40 %	528826884
20	NC_021905	GCGAT	2	10	21709	21718	20 %	20 %	40 %	20 %	528826884
21	NC_021905	GGTGC	2	10	22353	22362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021905	GCTCC	2	10	23099	23108	0 %	20 %	20 %	60 %	528826886
23	NC_021905	ATTGG	2	10	24652	24661	20 %	40 %	40 %	0 %	528826886
24	NC_021905	TCCGC	2	10	27419	27428	0 %	20 %	20 %	60 %	528826887
25	NC_021905	CCGTC	2	10	27946	27955	0 %	20 %	20 %	60 %	528826887
26	NC_021905	GAACC	2	10	28394	28403	40 %	0 %	20 %	40 %	528826887
27	NC_021905	CGAGC	2	10	28787	28796	20 %	0 %	40 %	40 %	528826887
28	NC_021905	TTGCG	2	10	30045	30054	0 %	40 %	40 %	20 %	528826889
29	NC_021905	GCCGA	2	10	31121	31130	20 %	0 %	40 %	40 %	528826889
30	NC_021905	GGCTT	2	10	32360	32369	0 %	40 %	40 %	20 %	528826890
31	NC_021905	GCTGA	2	10	34239	34248	20 %	20 %	40 %	20 %	528826891
32	NC_021905	CTTCT	2	10	38228	38237	0 %	60 %	0 %	40 %	528826895
33	NC_021905	GCGTC	2	10	38645	38654	0 %	20 %	40 %	40 %	528826895
34	NC_021905	TGCCG	2	10	41356	41365	0 %	20 %	40 %	40 %	528826897
35	NC_021905	GAAGA	2	10	43632	43641	60 %	0 %	40 %	0 %	528826900
36	NC_021905	GCGAG	2	10	44989	44998	20 %	0 %	60 %	20 %	528826903
37	NC_021905	CCGGT	2	10	47119	47128	0 %	20 %	40 %	40 %	528826907
38	NC_021905	AAGCC	2	10	47407	47416	40 %	0 %	20 %	40 %	528826907
39	NC_021905	TCGTC	2	10	47835	47844	0 %	40 %	20 %	40 %	528826908
40	NC_021905	TGCGC	2	10	49051	49060	0 %	20 %	40 %	40 %	528826910
41	NC_021905	GTTTT	2	10	50369	50378	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021905	TGCGG	2	10	54691	54700	0 %	20 %	60 %	20 %	528826913
43	NC_021905	CGTGC	2	10	55322	55331	0 %	20 %	40 %	40 %	528826914
44	NC_021905	TTCTG	2	10	57128	57137	0 %	60 %	20 %	20 %	528826916
45	NC_021905	GATAT	2	10	61391	61400	40 %	40 %	20 %	0 %	528826919
46	NC_021905	GCCGT	2	10	61650	61659	0 %	20 %	40 %	40 %	528826919
47	NC_021905	CAGGG	2	10	61928	61937	20 %	0 %	60 %	20 %	528826919
48	NC_021905	GACGT	2	10	62573	62582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021905	TCGTG	2	10	63612	63621	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021905	GGGCT	2	10	63757	63766	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021905	CGCAA	2	10	64194	64203	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021905	GAAGA	2	10	64737	64746	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021905	AGCGG	2	10	66798	66807	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021905	AGAGG	2	10	67073	67082	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021905	AGCGC	2	10	70571	70580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021905	TTTTA	2	10	71193	71202	20 %	80 %	0 %	0 %	528826920
57	NC_021905	GGCTG	2	10	72173	72182	0 %	20 %	60 %	20 %	528826921
58	NC_021905	CGACC	2	10	73004	73013	20 %	0 %	20 %	60 %	528826922
59	NC_021905	GCCGG	2	10	73575	73584	0 %	0 %	60 %	40 %	528826922
60	NC_021905	GCGAT	2	10	73766	73775	20 %	20 %	40 %	20 %	528826923
61	NC_021905	CCGGT	2	10	74431	74440	0 %	20 %	40 %	40 %	528826923
62	NC_021905	GCCGC	2	10	75098	75107	0 %	0 %	40 %	60 %	528826924
63	NC_021905	GAAGG	2	10	75992	76001	40 %	0 %	60 %	0 %	528826924
64	NC_021905	GCGGG	2	10	76428	76437	0 %	0 %	80 %	20 %	528826924
65	NC_021905	TTGCC	2	10	78155	78164	0 %	40 %	20 %	40 %	528826927
66	NC_021905	GGATC	2	10	79891	79900	20 %	20 %	40 %	20 %	528826928
67	NC_021905	CATTC	2	10	81238	81247	20 %	40 %	0 %	40 %	528826929
68	NC_021905	TCAGG	2	10	81764	81773	20 %	20 %	40 %	20 %	528826929
69	NC_021905	TCGAT	2	10	81882	81891	20 %	40 %	20 %	20 %	528826929
70	NC_021905	CGGCC	2	10	82062	82071	0 %	0 %	40 %	60 %	528826929
71	NC_021905	GGCCC	2	10	88038	88047	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_021905	CGAGG	2	10	88139	88148	20 %	0 %	60 %	20 %	528826935
73	NC_021905	ATGCG	2	10	90369	90378	20 %	20 %	40 %	20 %	528826937
74	NC_021905	GTTCG	2	10	90934	90943	0 %	40 %	40 %	20 %	528826937
75	NC_021905	AGGAT	2	10	94515	94524	40 %	20 %	40 %	0 %	528826941
76	NC_021905	TGGCC	2	10	96600	96609	0 %	20 %	40 %	40 %	528826942
77	NC_021905	CTGCC	2	10	97905	97914	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021905	GGCAG	2	10	98051	98060	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021905	TCACG	2	10	98602	98611	20 %	20 %	20 %	40 %	528826943
80	NC_021905	CAGGC	2	10	99907	99916	20 %	0 %	40 %	40 %	528826944
81	NC_021905	CGACA	2	10	102319	102328	40 %	0 %	20 %	40 %	528826946
82	NC_021905	CCACG	2	10	105823	105832	20 %	0 %	20 %	60 %	528826949
83	NC_021905	CATGC	2	10	106132	106141	20 %	20 %	20 %	40 %	528826950
84	NC_021905	GCGAA	2	10	107156	107165	40 %	0 %	40 %	20 %	528826950
85	NC_021905	AAGCG	2	10	107777	107786	40 %	0 %	40 %	20 %	528826951
86	NC_021905	CGAAC	2	10	107798	107807	40 %	0 %	20 %	40 %	528826951
87	NC_021905	GCCAT	2	10	108742	108751	20 %	20 %	20 %	40 %	528826951
88	NC_021905	GCGCT	2	10	109945	109954	0 %	20 %	40 %	40 %	528826952
89	NC_021905	GCATG	2	10	111202	111211	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021905	AGCGC	2	10	112026	112035	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_021905	GCCGC	2	10	114329	114338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_021905	CGCGC	2	10	115528	115537	0 %	0 %	40 %	60 %	528826960
93	NC_021905	GAAGT	2	10	116207	116216	40 %	20 %	40 %	0 %	528826961
94	NC_021905	AAGAC	2	10	116376	116385	60 %	0 %	20 %	20 %	528826961
95	NC_021905	GCGCT	2	10	118061	118070	0 %	20 %	40 %	40 %	528826963
96	NC_021905	GCGCA	2	10	121854	121863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021905	GGATC	2	10	123240	123249	20 %	20 %	40 %	20 %	528826967
98	NC_021905	ATCGC	2	10	123468	123477	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021905	CGCGG	2	10	124795	124804	0 %	0 %	60 %	40 %	528826969
100	NC_021905	TGGTC	2	10	124852	124861	0 %	40 %	40 %	20 %	528826969
101	NC_021905	CCTTC	2	10	125220	125229	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_021905	CCGCG	2	10	125949	125958	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_021905	TGGCG	2	10	126447	126456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021905	CGGCG	2	10	127232	127241	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_021905	TTGGC	2	10	127387	127396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021905	CCTGC	2	10	127886	127895	0 %	20 %	20 %	60 %	528826970
107	NC_021905	GCGAG	2	10	129079	129088	20 %	0 %	60 %	20 %	528826971
108	NC_021905	CTTCG	2	10	132191	132200	0 %	40 %	20 %	40 %	528826973
109	NC_021905	GAGGG	2	10	134277	134286	20 %	0 %	80 %	0 %	528826975
110	NC_021905	GCCTT	2	10	136115	136124	0 %	40 %	20 %	40 %	528826978
111	NC_021905	CCGCG	2	10	140466	140475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_021905	GGCAG	2	10	142076	142085	20 %	0 %	60 %	20 %	528826985
113	NC_021905	AGCGC	2	10	142370	142379	20 %	0 %	40 %	40 %	528826986
114	NC_021905	TTGCC	2	10	142650	142659	0 %	40 %	20 %	40 %	528826986
115	NC_021905	GCCCG	2	10	143688	143697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_021905	AGGGG	2	10	144697	144706	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021905	CGCGC	2	10	147025	147034	0 %	0 %	40 %	60 %	528826991
118	NC_021905	CTTGC	2	10	148158	148167	0 %	40 %	20 %	40 %	528826992
119	NC_021905	CGAAG	2	10	148350	148359	40 %	0 %	40 %	20 %	528826992
120	NC_021905	TGGGT	2	10	148661	148670	0 %	40 %	60 %	0 %	528826993
121	NC_021905	GCGCG	2	10	149364	149373	0 %	0 %	60 %	40 %	528826994
122	NC_021905	ACGTA	2	10	150636	150645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021905	GCGGT	2	10	153228	153237	0 %	20 %	60 %	20 %	528826998
124	NC_021905	GTGGA	2	10	153282	153291	20 %	20 %	60 %	0 %	528826998
125	NC_021905	ACTTC	2	10	154261	154270	20 %	40 %	0 %	40 %	528826998
126	NC_021905	CCGAG	2	10	159049	159058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021905	CGCGA	2	10	163787	163796	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021905	CCTGC	2	10	164280	164289	0 %	20 %	20 %	60 %	528827004
129	NC_021905	GATGC	2	10	165184	165193	20 %	20 %	40 %	20 %	528827004
130	NC_021905	CATGG	2	10	165514	165523	20 %	20 %	40 %	20 %	528827004
131	NC_021905	CCGAA	2	10	166163	166172	40 %	0 %	20 %	40 %	528827004
132	NC_021905	CCCGA	2	10	168951	168960	20 %	0 %	20 %	60 %	528827005
133	NC_021905	CGTCA	2	10	170092	170101	20 %	20 %	20 %	40 %	528827007
134	NC_021905	CGCAG	2	10	171323	171332	20 %	0 %	40 %	40 %	528827008
135	NC_021905	TGGTC	2	10	173255	173264	0 %	40 %	40 %	20 %	528827010
136	NC_021905	CGGCG	2	10	181506	181515	0 %	0 %	60 %	40 %	528827019
137	NC_021905	TCGGC	2	10	181697	181706	0 %	20 %	40 %	40 %	528827019
138	NC_021905	CGCTC	3	15	182128	182142	0 %	20 %	20 %	60 %	528827020
139	NC_021905	CGGCG	2	10	186186	186195	0 %	0 %	60 %	40 %	528827024
140	NC_021905	GATGT	2	10	186852	186861	20 %	40 %	40 %	0 %	528827025
141	NC_021905	TTCGG	2	10	187431	187440	0 %	40 %	40 %	20 %	528827025
142	NC_021905	GGGAA	2	10	187503	187512	40 %	0 %	60 %	0 %	528827025
143	NC_021905	GACCG	2	10	188055	188064	20 %	0 %	40 %	40 %	528827027
144	NC_021905	ATGGC	2	10	189337	189346	20 %	20 %	40 %	20 %	528827028
145	NC_021905	CTTTC	2	10	189675	189684	0 %	60 %	0 %	40 %	528827028
146	NC_021905	TGGAC	2	10	191274	191283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021905	TGACA	2	10	193563	193572	40 %	20 %	20 %	20 %	528827031
148	NC_021905	AGGAG	2	10	200148	200157	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021905	TCGAT	2	10	200423	200432	20 %	40 %	20 %	20 %	528827037
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151	NC_021905	GAGCG	2	10	207699	207708	20 %	0 %	60 %	20 %	528827044
152	NC_021905	ATTCC	2	10	208266	208275	20 %	40 %	0 %	40 %	528827045
153	NC_021905	GATCG	2	10	208856	208865	20 %	20 %	40 %	20 %	528827045
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156	NC_021905	CATCC	2	10	212879	212888	20 %	20 %	0 %	60 %	528827050
157	NC_021905	CGCTG	2	10	216017	216026	0 %	20 %	40 %	40 %	528827054
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159	NC_021905	CCGAC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	20 %	60 %	528827056
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161	NC_021905	GCAGC	2	10	220070	220079	20 %	0 %	40 %	40 %	528827058
162	NC_021905	CCGAT	2	10	220327	220336	20 %	20 %	20 %	40 %	528827058
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165	NC_021905	CGGCC	2	10	224009	224018	0 %	0 %	40 %	60 %	528827061
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171	NC_021905	TGCGG	2	10	231152	231161	0 %	20 %	60 %	20 %	528827069
172	NC_021905	GCGAT	2	10	234171	234180	20 %	20 %	40 %	20 %	528827071
173	NC_021905	GCCGA	2	10	234204	234213	20 %	0 %	40 %	40 %	528827071
174	NC_021905	CGAAC	2	10	234897	234906	40 %	0 %	20 %	40 %	528827072
175	NC_021905	GCGCT	2	10	235215	235224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_021905	ACCGA	2	10	236993	237002	40 %	0 %	20 %	40 %	528827073
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178	NC_021905	CGGCG	2	10	239816	239825	0 %	0 %	60 %	40 %	528827075
179	NC_021905	TGCCG	2	10	240836	240845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
180	NC_021905	TGTCG	2	10	243168	243177	0 %	40 %	40 %	20 %	528827077
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182	NC_021905	TCCGC	2	10	245288	245297	0 %	20 %	20 %	60 %	528827079
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189	NC_021905	TGGCT	2	10	249103	249112	0 %	40 %	40 %	20 %	528827083
190	NC_021905	GCGCA	2	10	252512	252521	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_021905	CTGCG	2	10	255103	255112	0 %	20 %	40 %	40 %	528827087
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212	NC_021905	GCCTT	2	10	294048	294057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
213	NC_021905	GATGC	2	10	297237	297246	20 %	20 %	40 %	20 %	528827136
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216	NC_021905	GCATC	2	10	301071	301080	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
217	NC_021905	CGAGC	2	10	301923	301932	20 %	0 %	40 %	40 %	528827141
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229	NC_021905	GGCCG	2	10	313731	313740	0 %	0 %	60 %	40 %	528827152
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231	NC_021905	GCAAA	2	10	317906	317915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
232	NC_021905	CGGCG	2	10	317932	317941	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
233	NC_021905	CATGC	2	10	320435	320444	20 %	20 %	20 %	40 %	528827160
234	NC_021905	TCGTC	2	10	320503	320512	0 %	40 %	20 %	40 %	528827160
235	NC_021905	CGAAG	2	10	323726	323735	40 %	0 %	40 %	20 %	528827164
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238	NC_021905	TGCGC	2	10	327737	327746	0 %	20 %	40 %	40 %	528827168
239	NC_021905	CCTGC	2	10	329367	329376	0 %	20 %	20 %	60 %	528827169
240	NC_021905	AAGGC	2	10	330151	330160	40 %	0 %	40 %	20 %	528827170
241	NC_021905	CGAGC	2	10	330237	330246	20 %	0 %	40 %	40 %	528827170
242	NC_021905	CAGCC	2	10	332777	332786	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
243	NC_021905	CTTCA	2	10	333011	333020	20 %	40 %	0 %	40 %	528827173
244	NC_021905	AAGGC	2	10	333078	333087	40 %	0 %	40 %	20 %	528827173
245	NC_021905	TCGGC	2	10	334152	334161	0 %	20 %	40 %	40 %	528827174
246	NC_021905	TCGGC	2	10	337169	337178	0 %	20 %	40 %	40 %	528827178
247	NC_021905	GCTGC	2	10	338878	338887	0 %	20 %	40 %	40 %	528827179
248	NC_021905	TGGCC	2	10	339868	339877	0 %	20 %	40 %	40 %	528827179
249	NC_021905	ATACA	2	10	344086	344095	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_021905	GCGCC	2	10	345630	345639	0 %	0 %	40 %	60 %	528827182
251	NC_021905	GATCG	2	10	345922	345931	20 %	20 %	40 %	20 %	528827182
252	NC_021905	GCCCG	2	10	346069	346078	0 %	0 %	40 %	60 %	528827182
253	NC_021905	GCCAG	2	10	347047	347056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_021905	CCGGC	2	10	350390	350399	0 %	0 %	40 %	60 %	528827185
255	NC_021905	GAGGC	2	10	352053	352062	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
256	NC_021905	CCGGC	2	10	352887	352896	0 %	0 %	40 %	60 %	528827187
257	NC_021905	GATCG	2	10	354083	354092	20 %	20 %	40 %	20 %	528827188
258	NC_021905	CCATT	2	10	354217	354226	20 %	40 %	0 %	40 %	528827188
259	NC_021905	GATGA	2	10	355390	355399	40 %	20 %	40 %	0 %	528827190
260	NC_021905	GCGAG	2	10	361783	361792	20 %	0 %	60 %	20 %	528827195
261	NC_021905	TGCCT	2	10	362291	362300	0 %	40 %	20 %	40 %	528827195
262	NC_021905	TCAGC	2	10	362465	362474	20 %	20 %	20 %	40 %	528827196
263	NC_021905	TCCAT	2	10	363298	363307	20 %	40 %	0 %	40 %	528827196
264	NC_021905	GCCGC	2	10	365363	365372	0 %	0 %	40 %	60 %	528827198
265	NC_021905	CCGTG	2	10	367884	367893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
266	NC_021905	GCAGC	2	10	370922	370931	20 %	0 %	40 %	40 %	528827203
267	NC_021905	AGCCG	2	10	371089	371098	20 %	0 %	40 %	40 %	528827203
268	NC_021905	AGGCA	2	10	372314	372323	40 %	0 %	40 %	20 %	528827204
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394	NC_021905	GGCAG	2	10	562561	562570	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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397	NC_021905	GGGGC	2	10	569794	569803	0 %	0 %	80 %	20 %	528827394
398	NC_021905	CGGAT	2	10	570283	570292	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
399	NC_021905	AGATG	2	10	571063	571072	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
400	NC_021905	CCGAT	2	10	572248	572257	20 %	20 %	20 %	40 %	528827396
401	NC_021905	CGACA	2	10	573392	573401	40 %	0 %	20 %	40 %	528827397
402	NC_021905	GCCCC	2	10	574476	574485	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
403	NC_021905	CTGCC	2	10	576812	576821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
404	NC_021905	GCCGC	2	10	577563	577572	0 %	0 %	40 %	60 %	528827400
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