MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 2555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	528826862
2	NC_021905	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	528826865
3	NC_021905	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	528826866
4	NC_021905	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	528826869
5	NC_021905	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	528826870
6	NC_021905	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	528826870
7	NC_021905	TGGCG	2	10	8741	8750	0 %	20 %	60 %	20 %	528826873
8	NC_021905	GCCGC	2	10	14253	14262	0 %	0 %	40 %	60 %	528826877
9	NC_021905	CGCGC	2	10	15142	15151	0 %	0 %	40 %	60 %	528826877
10	NC_021905	CATCG	2	10	16327	16336	20 %	20 %	20 %	40 %	528826879
11	NC_021905	CGGCA	2	10	16741	16750	20 %	0 %	40 %	40 %	528826879
12	NC_021905	TCGTT	2	10	17600	17609	0 %	60 %	20 %	20 %	528826881
13	NC_021905	CCATT	2	10	18452	18461	20 %	40 %	0 %	40 %	528826881
14	NC_021905	TCCGA	2	10	18915	18924	20 %	20 %	20 %	40 %	528826882
15	NC_021905	GGCGA	2	10	20049	20058	20 %	0 %	60 %	20 %	528826883
16	NC_021905	ATGGT	2	10	20395	20404	20 %	40 %	40 %	0 %	528826883
17	NC_021905	GGCCG	2	10	21454	21463	0 %	0 %	60 %	40 %	528826884
18	NC_021905	GCGAT	2	10	21709	21718	20 %	20 %	40 %	20 %	528826884
19	NC_021905	GCTCC	2	10	23099	23108	0 %	20 %	20 %	60 %	528826886
20	NC_021905	ATTGG	2	10	24652	24661	20 %	40 %	40 %	0 %	528826886
21	NC_021905	TCCGC	2	10	27419	27428	0 %	20 %	20 %	60 %	528826887
22	NC_021905	CCGTC	2	10	27946	27955	0 %	20 %	20 %	60 %	528826887
23	NC_021905	GAACC	2	10	28394	28403	40 %	0 %	20 %	40 %	528826887
24	NC_021905	CGAGC	2	10	28787	28796	20 %	0 %	40 %	40 %	528826887
25	NC_021905	TTGCG	2	10	30045	30054	0 %	40 %	40 %	20 %	528826889
26	NC_021905	GCCGA	2	10	31121	31130	20 %	0 %	40 %	40 %	528826889
27	NC_021905	GGCTT	2	10	32360	32369	0 %	40 %	40 %	20 %	528826890
28	NC_021905	GCTGA	2	10	34239	34248	20 %	20 %	40 %	20 %	528826891
29	NC_021905	CTTCT	2	10	38228	38237	0 %	60 %	0 %	40 %	528826895
30	NC_021905	GCGTC	2	10	38645	38654	0 %	20 %	40 %	40 %	528826895
31	NC_021905	TGCCG	2	10	41356	41365	0 %	20 %	40 %	40 %	528826897
32	NC_021905	GAAGA	2	10	43632	43641	60 %	0 %	40 %	0 %	528826900
33	NC_021905	GCGAG	2	10	44989	44998	20 %	0 %	60 %	20 %	528826903
34	NC_021905	CCGGT	2	10	47119	47128	0 %	20 %	40 %	40 %	528826907
35	NC_021905	AAGCC	2	10	47407	47416	40 %	0 %	20 %	40 %	528826907
36	NC_021905	TCGTC	2	10	47835	47844	0 %	40 %	20 %	40 %	528826908
37	NC_021905	TGCGC	2	10	49051	49060	0 %	20 %	40 %	40 %	528826910
38	NC_021905	TGCGG	2	10	54691	54700	0 %	20 %	60 %	20 %	528826913
39	NC_021905	CGTGC	2	10	55322	55331	0 %	20 %	40 %	40 %	528826914
40	NC_021905	TTCTG	2	10	57128	57137	0 %	60 %	20 %	20 %	528826916
41	NC_021905	GATAT	2	10	61391	61400	40 %	40 %	20 %	0 %	528826919
42	NC_021905	GCCGT	2	10	61650	61659	0 %	20 %	40 %	40 %	528826919
43	NC_021905	CAGGG	2	10	61928	61937	20 %	0 %	60 %	20 %	528826919
44	NC_021905	TTTTA	2	10	71193	71202	20 %	80 %	0 %	0 %	528826920
45	NC_021905	GGCTG	2	10	72173	72182	0 %	20 %	60 %	20 %	528826921
46	NC_021905	CGACC	2	10	73004	73013	20 %	0 %	20 %	60 %	528826922
47	NC_021905	GCCGG	2	10	73575	73584	0 %	0 %	60 %	40 %	528826922
48	NC_021905	GCGAT	2	10	73766	73775	20 %	20 %	40 %	20 %	528826923
49	NC_021905	CCGGT	2	10	74431	74440	0 %	20 %	40 %	40 %	528826923
50	NC_021905	GCCGC	2	10	75098	75107	0 %	0 %	40 %	60 %	528826924
51	NC_021905	GAAGG	2	10	75992	76001	40 %	0 %	60 %	0 %	528826924
52	NC_021905	GCGGG	2	10	76428	76437	0 %	0 %	80 %	20 %	528826924
53	NC_021905	TTGCC	2	10	78155	78164	0 %	40 %	20 %	40 %	528826927
54	NC_021905	GGATC	2	10	79891	79900	20 %	20 %	40 %	20 %	528826928
55	NC_021905	CATTC	2	10	81238	81247	20 %	40 %	0 %	40 %	528826929
56	NC_021905	TCAGG	2	10	81764	81773	20 %	20 %	40 %	20 %	528826929
57	NC_021905	TCGAT	2	10	81882	81891	20 %	40 %	20 %	20 %	528826929
58	NC_021905	CGGCC	2	10	82062	82071	0 %	0 %	40 %	60 %	528826929
59	NC_021905	CGAGG	2	10	88139	88148	20 %	0 %	60 %	20 %	528826935
60	NC_021905	ATGCG	2	10	90369	90378	20 %	20 %	40 %	20 %	528826937
61	NC_021905	GTTCG	2	10	90934	90943	0 %	40 %	40 %	20 %	528826937
62	NC_021905	AGGAT	2	10	94515	94524	40 %	20 %	40 %	0 %	528826941
63	NC_021905	TGGCC	2	10	96600	96609	0 %	20 %	40 %	40 %	528826942
64	NC_021905	TCACG	2	10	98602	98611	20 %	20 %	20 %	40 %	528826943
65	NC_021905	CAGGC	2	10	99907	99916	20 %	0 %	40 %	40 %	528826944
66	NC_021905	CGACA	2	10	102319	102328	40 %	0 %	20 %	40 %	528826946
67	NC_021905	CCACG	2	10	105823	105832	20 %	0 %	20 %	60 %	528826949
68	NC_021905	CATGC	2	10	106132	106141	20 %	20 %	20 %	40 %	528826950
69	NC_021905	GCGAA	2	10	107156	107165	40 %	0 %	40 %	20 %	528826950
70	NC_021905	AAGCG	2	10	107777	107786	40 %	0 %	40 %	20 %	528826951
71	NC_021905	CGAAC	2	10	107798	107807	40 %	0 %	20 %	40 %	528826951
72	NC_021905	GCCAT	2	10	108742	108751	20 %	20 %	20 %	40 %	528826951
73	NC_021905	GCGCT	2	10	109945	109954	0 %	20 %	40 %	40 %	528826952
74	NC_021905	CGCGC	2	10	115528	115537	0 %	0 %	40 %	60 %	528826960
75	NC_021905	GAAGT	2	10	116207	116216	40 %	20 %	40 %	0 %	528826961
76	NC_021905	AAGAC	2	10	116376	116385	60 %	0 %	20 %	20 %	528826961
77	NC_021905	GCGCT	2	10	118061	118070	0 %	20 %	40 %	40 %	528826963
78	NC_021905	GGATC	2	10	123240	123249	20 %	20 %	40 %	20 %	528826967
79	NC_021905	CGCGG	2	10	124795	124804	0 %	0 %	60 %	40 %	528826969
80	NC_021905	TGGTC	2	10	124852	124861	0 %	40 %	40 %	20 %	528826969
81	NC_021905	CCTGC	2	10	127886	127895	0 %	20 %	20 %	60 %	528826970
82	NC_021905	GCGAG	2	10	129079	129088	20 %	0 %	60 %	20 %	528826971
83	NC_021905	CTTCG	2	10	132191	132200	0 %	40 %	20 %	40 %	528826973
84	NC_021905	GAGGG	2	10	134277	134286	20 %	0 %	80 %	0 %	528826975
85	NC_021905	GCCTT	2	10	136115	136124	0 %	40 %	20 %	40 %	528826978
86	NC_021905	GGCAG	2	10	142076	142085	20 %	0 %	60 %	20 %	528826985
87	NC_021905	AGCGC	2	10	142370	142379	20 %	0 %	40 %	40 %	528826986
88	NC_021905	TTGCC	2	10	142650	142659	0 %	40 %	20 %	40 %	528826986
89	NC_021905	CGCGC	2	10	147025	147034	0 %	0 %	40 %	60 %	528826991
90	NC_021905	CTTGC	2	10	148158	148167	0 %	40 %	20 %	40 %	528826992
91	NC_021905	CGAAG	2	10	148350	148359	40 %	0 %	40 %	20 %	528826992
92	NC_021905	TGGGT	2	10	148661	148670	0 %	40 %	60 %	0 %	528826993
93	NC_021905	GCGCG	2	10	149364	149373	0 %	0 %	60 %	40 %	528826994
94	NC_021905	GCGGT	2	10	153228	153237	0 %	20 %	60 %	20 %	528826998
95	NC_021905	GTGGA	2	10	153282	153291	20 %	20 %	60 %	0 %	528826998
96	NC_021905	ACTTC	2	10	154261	154270	20 %	40 %	0 %	40 %	528826998
97	NC_021905	CCTGC	2	10	164280	164289	0 %	20 %	20 %	60 %	528827004
98	NC_021905	GATGC	2	10	165184	165193	20 %	20 %	40 %	20 %	528827004
99	NC_021905	CATGG	2	10	165514	165523	20 %	20 %	40 %	20 %	528827004
100	NC_021905	CCGAA	2	10	166163	166172	40 %	0 %	20 %	40 %	528827004
101	NC_021905	CCCGA	2	10	168951	168960	20 %	0 %	20 %	60 %	528827005
102	NC_021905	CGTCA	2	10	170092	170101	20 %	20 %	20 %	40 %	528827007
103	NC_021905	CGCAG	2	10	171323	171332	20 %	0 %	40 %	40 %	528827008
104	NC_021905	TGGTC	2	10	173255	173264	0 %	40 %	40 %	20 %	528827010
105	NC_021905	CGGCG	2	10	181506	181515	0 %	0 %	60 %	40 %	528827019
106	NC_021905	TCGGC	2	10	181697	181706	0 %	20 %	40 %	40 %	528827019
107	NC_021905	CGCTC	3	15	182128	182142	0 %	20 %	20 %	60 %	528827020
108	NC_021905	CGGCG	2	10	186186	186195	0 %	0 %	60 %	40 %	528827024
109	NC_021905	GATGT	2	10	186852	186861	20 %	40 %	40 %	0 %	528827025
110	NC_021905	TTCGG	2	10	187431	187440	0 %	40 %	40 %	20 %	528827025
111	NC_021905	GGGAA	2	10	187503	187512	40 %	0 %	60 %	0 %	528827025
112	NC_021905	GACCG	2	10	188055	188064	20 %	0 %	40 %	40 %	528827027
113	NC_021905	ATGGC	2	10	189337	189346	20 %	20 %	40 %	20 %	528827028
114	NC_021905	CTTTC	2	10	189675	189684	0 %	60 %	0 %	40 %	528827028
115	NC_021905	TGACA	2	10	193563	193572	40 %	20 %	20 %	20 %	528827031
116	NC_021905	TCGAT	2	10	200423	200432	20 %	40 %	20 %	20 %	528827037
117	NC_021905	GCCGA	2	10	205932	205941	20 %	0 %	40 %	40 %	528827042
118	NC_021905	GAGCG	2	10	207699	207708	20 %	0 %	60 %	20 %	528827044
119	NC_021905	ATTCC	2	10	208266	208275	20 %	40 %	0 %	40 %	528827045
120	NC_021905	GATCG	2	10	208856	208865	20 %	20 %	40 %	20 %	528827045
121	NC_021905	GCGAA	2	10	210727	210736	40 %	0 %	40 %	20 %	528827048
122	NC_021905	CGGCC	2	10	211501	211510	0 %	0 %	40 %	60 %	528827049
123	NC_021905	CATCC	2	10	212879	212888	20 %	20 %	0 %	60 %	528827050
124	NC_021905	CGCTG	2	10	216017	216026	0 %	20 %	40 %	40 %	528827054
125	NC_021905	TGGCC	2	10	216357	216366	0 %	20 %	40 %	40 %	528827055
126	NC_021905	CCGAC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	20 %	60 %	528827056
127	NC_021905	AGCCG	2	10	219725	219734	20 %	0 %	40 %	40 %	528827058
128	NC_021905	GCAGC	2	10	220070	220079	20 %	0 %	40 %	40 %	528827058
129	NC_021905	CCGAT	2	10	220327	220336	20 %	20 %	20 %	40 %	528827058
130	NC_021905	ATCGA	2	10	221687	221696	40 %	20 %	20 %	20 %	528827059
131	NC_021905	CGATG	2	10	222001	222010	20 %	20 %	40 %	20 %	528827059
132	NC_021905	CGGCC	2	10	224009	224018	0 %	0 %	40 %	60 %	528827061
133	NC_021905	GCGCC	2	10	226455	226464	0 %	0 %	40 %	60 %	528827064
134	NC_021905	TGGCG	2	10	227422	227431	0 %	20 %	60 %	20 %	528827065
135	NC_021905	GCCGG	2	10	228022	228031	0 %	0 %	60 %	40 %	528827066
136	NC_021905	CTCGC	2	10	229992	230001	0 %	20 %	20 %	60 %	528827068
137	NC_021905	CGAGC	2	10	230540	230549	20 %	0 %	40 %	40 %	528827068
138	NC_021905	TGCGG	2	10	231152	231161	0 %	20 %	60 %	20 %	528827069
139	NC_021905	GCGAT	2	10	234171	234180	20 %	20 %	40 %	20 %	528827071
140	NC_021905	GCCGA	2	10	234204	234213	20 %	0 %	40 %	40 %	528827071
141	NC_021905	CGAAC	2	10	234897	234906	40 %	0 %	20 %	40 %	528827072
142	NC_021905	ACCGA	2	10	236993	237002	40 %	0 %	20 %	40 %	528827073
143	NC_021905	ATCTC	2	10	238086	238095	20 %	40 %	0 %	40 %	528827073
144	NC_021905	CGGCG	2	10	239816	239825	0 %	0 %	60 %	40 %	528827075
145	NC_021905	TGTCG	2	10	243168	243177	0 %	40 %	40 %	20 %	528827077
146	NC_021905	GCCTC	2	10	244224	244233	0 %	20 %	20 %	60 %	528827078
147	NC_021905	TCCGC	2	10	245288	245297	0 %	20 %	20 %	60 %	528827079
148	NC_021905	CGGTG	2	10	245311	245320	0 %	20 %	60 %	20 %	528827079
149	NC_021905	AAGGT	2	10	247239	247248	40 %	20 %	40 %	0 %	528827081
150	NC_021905	AGCGC	2	10	247815	247824	20 %	0 %	40 %	40 %	528827082
151	NC_021905	GTCCC	2	10	247954	247963	0 %	20 %	20 %	60 %	528827082
152	NC_021905	GCAAA	2	10	248421	248430	60 %	0 %	20 %	20 %	528827083
153	NC_021905	TGACC	2	10	248474	248483	20 %	20 %	20 %	40 %	528827083
154	NC_021905	TGGCT	2	10	249103	249112	0 %	40 %	40 %	20 %	528827083
155	NC_021905	CTGCG	2	10	255103	255112	0 %	20 %	40 %	40 %	528827087
156	NC_021905	CGGGC	2	10	257978	257987	0 %	0 %	60 %	40 %	528827091
157	NC_021905	GGTGC	2	10	258670	258679	0 %	20 %	60 %	20 %	528827092
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161	NC_021905	GGTCT	2	10	264272	264281	0 %	40 %	40 %	20 %	528827098
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164	NC_021905	GGCTC	2	10	269294	269303	0 %	20 %	40 %	40 %	528827104
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166	NC_021905	TCGGG	2	10	269747	269756	0 %	20 %	60 %	20 %	528827104
167	NC_021905	ATCGA	2	10	273614	273623	40 %	20 %	20 %	20 %	528827109
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169	NC_021905	TGCCG	2	10	278672	278681	0 %	20 %	40 %	40 %	528827114
170	NC_021905	GAGCT	2	10	281172	281181	20 %	20 %	40 %	20 %	528827117
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173	NC_021905	TTCTT	2	10	283812	283821	0 %	80 %	0 %	20 %	528827120
174	NC_021905	GTGGC	2	10	288527	288536	0 %	20 %	60 %	20 %	528827125
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178	NC_021905	TGACG	2	10	302060	302069	20 %	20 %	40 %	20 %	528827142
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201	NC_021905	AAGGC	2	10	333078	333087	40 %	0 %	40 %	20 %	528827173
202	NC_021905	TCGGC	2	10	334152	334161	0 %	20 %	40 %	40 %	528827174
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211	NC_021905	GATCG	2	10	354083	354092	20 %	20 %	40 %	20 %	528827188
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246	NC_021905	GCCAG	2	10	407290	407299	20 %	0 %	40 %	40 %	528827237
247	NC_021905	CGGCT	2	10	409272	409281	0 %	20 %	40 %	40 %	528827239
248	NC_021905	TGCCG	2	10	412387	412396	0 %	20 %	40 %	40 %	528827244
249	NC_021905	CCGAC	2	10	414602	414611	20 %	0 %	20 %	60 %	528827247
250	NC_021905	GGCGC	2	10	415791	415800	0 %	0 %	60 %	40 %	528827248
251	NC_021905	ACCGA	2	10	420257	420266	40 %	0 %	20 %	40 %	528827252
252	NC_021905	TGACG	2	10	422765	422774	20 %	20 %	40 %	20 %	528827254
253	NC_021905	GCCGC	2	10	425790	425799	0 %	0 %	40 %	60 %	528827256
254	NC_021905	GCTCG	2	10	427659	427668	0 %	20 %	40 %	40 %	528827259
255	NC_021905	TCCGC	2	10	428317	428326	0 %	20 %	20 %	60 %	528827260
256	NC_021905	ACGAG	2	10	428840	428849	40 %	0 %	40 %	20 %	528827261
257	NC_021905	GCCTT	2	10	431268	431277	0 %	40 %	20 %	40 %	528827263
258	NC_021905	ATGGA	2	10	431502	431511	40 %	20 %	40 %	0 %	528827264
259	NC_021905	TGATG	2	10	433878	433887	20 %	40 %	40 %	0 %	528827266
260	NC_021905	GCGCC	2	10	436083	436092	0 %	0 %	40 %	60 %	528827268
261	NC_021905	GCGGG	2	10	437336	437345	0 %	0 %	80 %	20 %	528827269
262	NC_021905	CGATC	2	10	437885	437894	20 %	20 %	20 %	40 %	528827270
263	NC_021905	TCGAT	2	10	441690	441699	20 %	40 %	20 %	20 %	528827273
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