MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 67178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	CCG	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
2	NC_021905	CGA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
3	NC_021905	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
4	NC_021905	TGA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826862
5	NC_021905	GAC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
6	NC_021905	GAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826862
7	NC_021905	GTC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826862
8	NC_021905	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826862
9	NC_021905	CAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826862
10	NC_021905	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826862
11	NC_021905	GAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826862
12	NC_021905	GGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826862
13	NC_021905	CGC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826862
14	NC_021905	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826862
15	NC_021905	TTG	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826862
16	NC_021905	TCG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826863
17	NC_021905	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826863
18	NC_021905	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826863
19	NC_021905	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826863
20	NC_021905	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528826863
21	NC_021905	GAT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826863
22	NC_021905	CCT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826864
23	NC_021905	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826864
24	NC_021905	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
25	NC_021905	CGG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
26	NC_021905	CGT	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
27	NC_021905	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826864
28	NC_021905	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
29	NC_021905	TGC	3	9	2669	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
30	NC_021905	CGT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826864
31	NC_021905	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826865
32	NC_021905	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826865
33	NC_021905	GCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826865
34	NC_021905	GTC	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826865
35	NC_021905	ATC	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826865
36	NC_021905	ATC	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826866
37	NC_021905	ACC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826866
38	NC_021905	ATC	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826866
39	NC_021905	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
40	NC_021905	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826866
41	NC_021905	CGA	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826866
42	NC_021905	CTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826866
43	NC_021905	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826866
44	NC_021905	CGG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
45	NC_021905	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826866
46	NC_021905	TTC	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826867
47	NC_021905	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826867
48	NC_021905	GCG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826867
49	NC_021905	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826867
50	NC_021905	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826867
51	NC_021905	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826867
52	NC_021905	TCG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826867
53	NC_021905	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826867
54	NC_021905	TGT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826867
55	NC_021905	TCC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826868
56	NC_021905	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826868
57	NC_021905	GAC	3	9	4883	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
58	NC_021905	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826868
59	NC_021905	GAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826868
60	NC_021905	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
61	NC_021905	CAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
62	NC_021905	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
63	NC_021905	CGA	3	9	5170	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
64	NC_021905	GCA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826868
65	NC_021905	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826869
66	NC_021905	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528826869
67	NC_021905	TGG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826869
68	NC_021905	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
69	NC_021905	TCT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826869
70	NC_021905	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826869
71	NC_021905	CGA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826869
72	NC_021905	GCG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
73	NC_021905	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826869
74	NC_021905	TCG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826869
75	NC_021905	GAT	3	9	6137	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
76	NC_021905	ATG	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
77	NC_021905	CGG	2	6	6179	6184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
78	NC_021905	GGA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826870
79	NC_021905	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
80	NC_021905	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
81	NC_021905	GCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
82	NC_021905	GAC	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826870
83	NC_021905	CGC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
84	NC_021905	TCT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
85	NC_021905	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
86	NC_021905	CTG	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
87	NC_021905	TTC	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
88	NC_021905	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826870
89	NC_021905	GCC	2	6	6902	6907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
90	NC_021905	CTT	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826870
91	NC_021905	GAT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826870
92	NC_021905	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826870
93	NC_021905	GCC	3	9	7169	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826870
94	NC_021905	GCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826871
95	NC_021905	CGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826871
96	NC_021905	CAT	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826871
97	NC_021905	GTC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826871
98	NC_021905	CTC	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826871
99	NC_021905	GCC	2	6	7690	7695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826871
100	NC_021905	CAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826871
101	NC_021905	CGG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826871
102	NC_021905	CTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826872
103	NC_021905	CAT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826872
104	NC_021905	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826872
105	NC_021905	GTC	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826872
106	NC_021905	GCC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826872
107	NC_021905	CGG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826872
108	NC_021905	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826872
109	NC_021905	CGA	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
110	NC_021905	GTC	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
111	NC_021905	CGA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
112	NC_021905	GCG	2	6	8551	8556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
113	NC_021905	TCA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826873
114	NC_021905	GGC	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
115	NC_021905	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
116	NC_021905	CGT	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
117	NC_021905	CCG	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826873
118	NC_021905	AGC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826873
119	NC_021905	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826873
120	NC_021905	CGG	2	6	8963	8968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
121	NC_021905	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826873
122	NC_021905	TCG	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
123	NC_021905	TGG	2	6	9075	9080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826873
124	NC_021905	CAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826873
125	NC_021905	CGG	2	6	9137	9142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
126	NC_021905	GGT	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826873
127	NC_021905	TCG	2	6	9303	9308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
128	NC_021905	GTC	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
129	NC_021905	GAG	2	6	9390	9395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826873
130	NC_021905	TCG	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
131	NC_021905	GTC	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826873
132	NC_021905	GGC	2	6	9437	9442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826873
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138	NC_021905	GGA	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826873
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252	NC_021905	TGA	2	6	18676	18681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826881
253	NC_021905	GCG	2	6	18826	18831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
254	NC_021905	CAT	2	6	18857	18862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
255	NC_021905	CAT	2	6	18890	18895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
256	NC_021905	GGC	2	6	18972	18977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
257	NC_021905	GAA	2	6	18986	18991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826882
258	NC_021905	GGC	2	6	19004	19009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
259	NC_021905	TGA	2	6	19045	19050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826882
260	NC_021905	GAT	2	6	19098	19103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826882
261	NC_021905	CGC	2	6	19109	19114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826882
262	NC_021905	TCG	3	9	19132	19140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826882
263	NC_021905	GCC	2	6	19145	19150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826882
264	NC_021905	GAC	2	6	19158	19163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826882
265	NC_021905	ACC	2	6	19221	19226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826882
266	NC_021905	CTA	2	6	19274	19279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826882
267	NC_021905	AGC	2	6	19354	19359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826882
268	NC_021905	CGG	2	6	19399	19404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
269	NC_021905	GGC	2	6	19422	19427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826882
270	NC_021905	CGT	3	9	19439	19447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826882
271	NC_021905	CAA	2	6	19474	19479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826882
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273	NC_021905	CAA	2	6	19757	19762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826883
274	NC_021905	GAA	2	6	19898	19903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826883
275	NC_021905	GCC	2	6	19927	19932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826883
276	NC_021905	AGG	2	6	19945	19950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826883
277	NC_021905	CGT	2	6	20000	20005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826883
278	NC_021905	CGG	2	6	20024	20029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826883
279	NC_021905	CGC	2	6	20042	20047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826883
280	NC_021905	CGG	2	6	20120	20125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826883
281	NC_021905	GTC	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826883
282	NC_021905	CGA	2	6	20236	20241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826883
283	NC_021905	CCT	2	6	20257	20262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826883
284	NC_021905	CTG	2	6	20385	20390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826883
285	NC_021905	TGG	2	6	20410	20415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826883
286	NC_021905	ACG	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826883
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288	NC_021905	GGT	2	6	20711	20716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826884
289	NC_021905	CGG	2	6	20780	20785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826884
290	NC_021905	CGC	2	6	20809	20814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826884
291	NC_021905	TCG	2	6	20872	20877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826884
292	NC_021905	ATG	2	6	20878	20883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826884
293	NC_021905	CGG	2	6	20959	20964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826884
294	NC_021905	TGC	2	6	20999	21004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826884
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297	NC_021905	CCA	2	6	21040	21045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826884
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312	NC_021905	TCG	2	6	21850	21855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826884
313	NC_021905	CGC	2	6	22060	22065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826885
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326	NC_021905	GCA	2	6	22867	22872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826886
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499	NC_021905	CTG	2	6	33094	33099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826890
500	NC_021905	GGC	2	6	33150	33155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826890

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