MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ101

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021903	ATTT	2	8	383	390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021903	CTTT	2	8	564	571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021903	TTTG	2	8	578	585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021903	AATG	2	8	783	790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021903	ATTT	2	8	827	834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021903	TTAA	2	8	918	925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021903	TAAT	2	8	982	989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021903	TTTC	2	8	1249	1256	0 %	75 %	0 %	25 %	528821547
9	NC_021903	TGAT	2	8	1278	1285	25 %	50 %	25 %	0 %	528821547
10	NC_021903	AGCA	2	8	1642	1649	50 %	0 %	25 %	25 %	528821548
11	NC_021903	TAAA	2	8	1944	1951	75 %	25 %	0 %	0 %	528821548
12	NC_021903	TAAA	2	8	2589	2596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021903	AGTT	2	8	3064	3071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021903	TGCT	2	8	3103	3110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021903	TTAT	2	8	3121	3128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021903	GCCA	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	528821549
17	NC_021903	AAAC	2	8	4207	4214	75 %	0 %	0 %	25 %	528821549
18	NC_021903	ATCG	2	8	4954	4961	25 %	25 %	25 %	25 %	528821549
19	NC_021903	CCGC	2	8	5411	5418	0 %	0 %	25 %	75 %	528821549
20	NC_021903	GCCG	2	8	5758	5765	0 %	0 %	50 %	50 %	528821549
21	NC_021903	TGGG	2	8	6068	6075	0 %	25 %	75 %	0 %	528821549
22	NC_021903	CGCC	2	8	6418	6425	0 %	0 %	25 %	75 %	528821549
23	NC_021903	AATT	2	8	7051	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	528821551
24	NC_021903	CAGC	2	8	7558	7565	25 %	0 %	25 %	50 %	528821552
25	NC_021903	TTTG	2	8	7726	7733	0 %	75 %	25 %	0 %	528821553
26	NC_021903	CTGA	2	8	7751	7758	25 %	25 %	25 %	25 %	528821553
27	NC_021903	GTTG	2	8	7870	7877	0 %	50 %	50 %	0 %	528821553
28	NC_021903	GTTC	2	8	8020	8027	0 %	50 %	25 %	25 %	528821553
29	NC_021903	TGGT	2	8	8035	8042	0 %	50 %	50 %	0 %	528821553
30	NC_021903	TCAC	2	8	9048	9055	25 %	25 %	0 %	50 %	528821554
31	NC_021903	TTTG	2	8	9067	9074	0 %	75 %	25 %	0 %	528821554
32	NC_021903	GTTC	2	8	9127	9134	0 %	50 %	25 %	25 %	528821554
33	NC_021903	GCAA	2	8	9241	9248	50 %	0 %	25 %	25 %	528821555
34	NC_021903	ACAT	2	8	9942	9949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021903	TGAT	2	8	10050	10057	25 %	50 %	25 %	0 %	528821557
36	NC_021903	TGAA	2	8	11493	11500	50 %	25 %	25 %	0 %	528821559
37	NC_021903	TGAA	2	8	11738	11745	50 %	25 %	25 %	0 %	528821560
38	NC_021903	AAAT	2	8	11765	11772	75 %	25 %	0 %	0 %	528821560
39	NC_021903	GATA	2	8	11844	11851	50 %	25 %	25 %	0 %	528821560
40	NC_021903	TAAG	2	8	13085	13092	50 %	25 %	25 %	0 %	528821561
41	NC_021903	TAAT	2	8	13209	13216	50 %	50 %	0 %	0 %	528821561
42	NC_021903	CTAG	2	8	14032	14039	25 %	25 %	25 %	25 %	528821562
43	NC_021903	ACAT	2	8	14085	14092	50 %	25 %	0 %	25 %	528821562
44	NC_021903	TAAT	2	8	14105	14112	50 %	50 %	0 %	0 %	528821562
45	NC_021903	CCAC	2	8	14136	14143	25 %	0 %	0 %	75 %	528821562
46	NC_021903	ACTT	2	8	14243	14250	25 %	50 %	0 %	25 %	528821562
47	NC_021903	TAAT	2	8	14288	14295	50 %	50 %	0 %	0 %	528821562
48	NC_021903	GAAC	2	8	14349	14356	50 %	0 %	25 %	25 %	528821562
49	NC_021903	TTTG	2	8	14738	14745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021903	TGTT	2	8	14794	14801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.