MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ101

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021903	TAA	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021903	TTA	2	6	181	186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021903	TTA	2	6	196	201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021903	TCA	2	6	240	245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021903	GGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021903	ATC	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021903	AAT	2	6	452	457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021903	TCT	2	6	618	623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021903	ATC	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021903	TCA	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021903	AAT	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021903	AGA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021903	ATT	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021903	AAG	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021903	ATT	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021903	CCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
17	NC_021903	GTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
18	NC_021903	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821547
19	NC_021903	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
20	NC_021903	TTG	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
21	NC_021903	TCT	2	6	1412	1417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
22	NC_021903	ACC	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
23	NC_021903	ATT	2	6	1789	1794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
24	NC_021903	TTC	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821548
25	NC_021903	TAG	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821548
26	NC_021903	GTT	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821548
27	NC_021903	ACT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
28	NC_021903	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
29	NC_021903	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
30	NC_021903	ATT	2	6	2359	2364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
31	NC_021903	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
32	NC_021903	CCT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021903	AAT	2	6	2560	2565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021903	CAC	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021903	TAA	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021903	CTT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021903	AAG	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021903	CTG	3	9	3278	3286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021903	TGC	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021903	GCG	2	6	3315	3320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021903	TCC	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021903	CGG	2	6	3483	3488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021903	GGA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021903	AGG	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021903	CCA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
46	NC_021903	GAA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821549
47	NC_021903	GCC	2	6	3763	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
48	NC_021903	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821549
49	NC_021903	CTT	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
50	NC_021903	GGC	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
51	NC_021903	CTG	3	9	3937	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
52	NC_021903	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
53	NC_021903	GTG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
54	NC_021903	ACC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
55	NC_021903	TGA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
56	NC_021903	TGG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
57	NC_021903	TGG	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
58	NC_021903	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
59	NC_021903	AAC	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821549
60	NC_021903	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
61	NC_021903	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
62	NC_021903	ATC	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
63	NC_021903	TGA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
64	NC_021903	ATG	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
65	NC_021903	GCG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
66	NC_021903	CGA	3	9	4878	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
67	NC_021903	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
68	NC_021903	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
69	NC_021903	GTC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
70	NC_021903	CGA	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
71	NC_021903	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
72	NC_021903	CAT	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
73	NC_021903	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
74	NC_021903	ACC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
75	NC_021903	TGA	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
76	NC_021903	AGC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
77	NC_021903	AGC	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
78	NC_021903	GCT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
79	NC_021903	CGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
80	NC_021903	GAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
81	NC_021903	CAC	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
82	NC_021903	ACC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
83	NC_021903	GCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
84	NC_021903	TGA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
85	NC_021903	GGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
86	NC_021903	CAC	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
87	NC_021903	ATG	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
88	NC_021903	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
89	NC_021903	TGC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
90	NC_021903	CGG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
91	NC_021903	CAT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
92	NC_021903	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
93	NC_021903	TGC	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
94	NC_021903	ATC	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
95	NC_021903	CTA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
96	NC_021903	AAG	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021903	TCT	2	6	6918	6923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021903	CAA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021903	CAT	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821551
100	NC_021903	AAC	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821551
101	NC_021903	AGA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821551
102	NC_021903	AAT	2	6	7364	7369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021903	CTG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821552
104	NC_021903	GTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
105	NC_021903	TGC	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
106	NC_021903	TGC	2	6	7834	7839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
107	NC_021903	GTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
108	NC_021903	GTC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
109	NC_021903	TTG	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
110	NC_021903	TGA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821553
111	NC_021903	GTT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
112	NC_021903	TTG	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
113	NC_021903	TGT	2	6	8188	8193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
114	NC_021903	GTC	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
115	NC_021903	GCT	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
116	NC_021903	CTT	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821553
117	NC_021903	TGG	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821553
118	NC_021903	GTT	2	6	8791	8796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
119	NC_021903	ACC	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821554
120	NC_021903	ATG	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
121	NC_021903	TGA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
122	NC_021903	GCA	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821554
123	NC_021903	CTT	2	6	8975	8980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821554
124	NC_021903	GTC	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821554
125	NC_021903	TGA	2	6	9203	9208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821555
126	NC_021903	CCT	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528821555
127	NC_021903	CAT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821555
128	NC_021903	CAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021903	GCA	2	6	9551	9556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021903	CTG	2	6	9571	9576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021903	CTT	2	6	9688	9693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821556
132	NC_021903	CAT	2	6	9703	9708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821556
133	NC_021903	ATT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821556
134	NC_021903	ACT	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821556
135	NC_021903	CTT	2	6	9837	9842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821556
136	NC_021903	TCC	2	6	9908	9913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021903	TGA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821557
138	NC_021903	AGC	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821557
139	NC_021903	GCA	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821557
140	NC_021903	CTG	2	6	10543	10548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821558
141	NC_021903	CAG	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821558
142	NC_021903	TCA	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821558
143	NC_021903	TTC	2	6	10687	10692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021903	TTA	2	6	10704	10709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021903	TAA	2	6	10723	10728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021903	ATA	2	6	10803	10808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021903	AGG	2	6	10879	10884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021903	TTA	2	6	11088	11093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821559
149	NC_021903	AAT	2	6	11210	11215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
150	NC_021903	GAA	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821559
151	NC_021903	ATA	2	6	11277	11282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
152	NC_021903	AGA	2	6	11401	11406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821559
153	NC_021903	TAA	2	6	11425	11430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
154	NC_021903	AAT	2	6	11534	11539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
155	NC_021903	TGA	2	6	11553	11558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
156	NC_021903	TTG	2	6	11609	11614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
157	NC_021903	GAA	2	6	11652	11657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
158	NC_021903	ATT	2	6	11658	11663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821560
159	NC_021903	CTG	2	6	11672	11677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821560
160	NC_021903	AGA	3	9	11703	11711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
161	NC_021903	ATG	2	6	11750	11755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
162	NC_021903	GTT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
163	NC_021903	ACA	2	6	11860	11865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
164	NC_021903	GAT	2	6	11935	11940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
165	NC_021903	TAG	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
166	NC_021903	TTG	2	6	12166	12171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
167	NC_021903	AAG	2	6	12208	12213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
168	NC_021903	TAA	2	6	12261	12266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
169	NC_021903	AGA	2	6	12282	12287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
170	NC_021903	AAC	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
171	NC_021903	AGA	2	6	12351	12356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
172	NC_021903	ATA	2	6	12479	12484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
173	NC_021903	TGA	2	6	12576	12581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
174	NC_021903	AGA	2	6	12753	12758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
175	NC_021903	CAA	2	6	12772	12777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
176	NC_021903	TTA	2	6	12861	12866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821560
177	NC_021903	TAA	2	6	13349	13354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821561
178	NC_021903	TCA	2	6	13471	13476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821561
179	NC_021903	CTT	2	6	13570	13575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821561
180	NC_021903	TTG	2	6	13610	13615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821561
181	NC_021903	ATA	2	6	13639	13644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021903	AAC	2	6	13783	13788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821562
183	NC_021903	TTC	2	6	13824	13829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821562
184	NC_021903	AAC	2	6	13904	13909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821562
185	NC_021903	ACC	2	6	13983	13988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821562
186	NC_021903	ATA	2	6	14006	14011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821562
187	NC_021903	ATT	2	6	14022	14027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821562
188	NC_021903	TCA	2	6	14053	14058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821562
189	NC_021903	ACA	2	6	14173	14178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821562
190	NC_021903	ACA	2	6	14185	14190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821562
191	NC_021903	ATT	2	6	14316	14321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821562
192	NC_021903	ATT	3	9	14509	14517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021903	TAG	2	6	14521	14526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021903	TAT	2	6	14533	14538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021903	ATT	2	6	14596	14601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_021903	CTT	2	6	14609	14614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_021903	CCA	2	6	14647	14652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
198	NC_021903	ACT	2	6	14695	14700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_021903	CTG	2	6	14747	14752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_021903	TAC	2	6	15067	15072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_021903	TAT	2	6	15075	15080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.