MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 2827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021902	GGCGC	2	10	4242	4251	0 %	0 %	60 %	40 %	528816722
2	NC_021902	CTGAT	2	10	4258	4267	20 %	40 %	20 %	20 %	528816722
3	NC_021902	GGCCA	2	10	4454	4463	20 %	0 %	40 %	40 %	528816723
4	NC_021902	AGCAG	2	10	4708	4717	40 %	0 %	40 %	20 %	528816723
5	NC_021902	CGCTG	2	10	6153	6162	0 %	20 %	40 %	40 %	528816725
6	NC_021902	GTGAA	2	10	6404	6413	40 %	20 %	40 %	0 %	528816725
7	NC_021902	TGACT	2	10	8848	8857	20 %	40 %	20 %	20 %	528816728
8	NC_021902	GAAGC	2	10	9634	9643	40 %	0 %	40 %	20 %	528816729
9	NC_021902	CTTTT	2	10	10429	10438	0 %	80 %	0 %	20 %	528816730
10	NC_021902	TGAAA	2	10	12056	12065	60 %	20 %	20 %	0 %	528816731
11	NC_021902	AATCT	2	10	13278	13287	40 %	40 %	0 %	20 %	528816732
12	NC_021902	TGGCG	2	10	14776	14785	0 %	20 %	60 %	20 %	528816733
13	NC_021902	TTTGC	2	10	16776	16785	0 %	60 %	20 %	20 %	528816734
14	NC_021902	CGGCG	2	10	17522	17531	0 %	0 %	60 %	40 %	528816735
15	NC_021902	CCGGC	2	10	20470	20479	0 %	0 %	40 %	60 %	528816737
16	NC_021902	ACGCC	2	10	26809	26818	20 %	0 %	20 %	60 %	528816744
17	NC_021902	GCGCG	2	10	27429	27438	0 %	0 %	60 %	40 %	528816745
18	NC_021902	TGCTT	2	10	29780	29789	0 %	60 %	20 %	20 %	528816747
19	NC_021902	GGTGC	2	10	31724	31733	0 %	20 %	60 %	20 %	528816748
20	NC_021902	CTGGC	2	10	31797	31806	0 %	20 %	40 %	40 %	528816748
21	NC_021902	TTGCG	2	10	32677	32686	0 %	40 %	40 %	20 %	528816748
22	NC_021902	TTTAC	2	10	37110	37119	20 %	60 %	0 %	20 %	528816753
23	NC_021902	CTCTC	2	10	39232	39241	0 %	40 %	0 %	60 %	528816754
24	NC_021902	AGGAG	2	10	42754	42763	40 %	0 %	60 %	0 %	528816757
25	NC_021902	TGAAA	2	10	47331	47340	60 %	20 %	20 %	0 %	528816761
26	NC_021902	GAGCA	2	10	48262	48271	40 %	0 %	40 %	20 %	528816762
27	NC_021902	GTACC	2	10	51265	51274	20 %	20 %	20 %	40 %	528816764
28	NC_021902	TCGTT	2	10	51717	51726	0 %	60 %	20 %	20 %	528816764
29	NC_021902	ATGTG	2	10	54438	54447	20 %	40 %	40 %	0 %	528816767
30	NC_021902	CGATG	2	10	55012	55021	20 %	20 %	40 %	20 %	528816768
31	NC_021902	CGGCG	2	10	56330	56339	0 %	0 %	60 %	40 %	528816769
32	NC_021902	CGGTC	2	10	58241	58250	0 %	20 %	40 %	40 %	528816769
33	NC_021902	TGTTA	2	10	59168	59177	20 %	60 %	20 %	0 %	528816771
34	NC_021902	TCCTG	2	10	59979	59988	0 %	40 %	20 %	40 %	528816771
35	NC_021902	CGCGC	2	10	60954	60963	0 %	0 %	40 %	60 %	528816772
36	NC_021902	CGGCG	2	10	62182	62191	0 %	0 %	60 %	40 %	528816774
37	NC_021902	GCTCG	2	10	63943	63952	0 %	20 %	40 %	40 %	528816777
38	NC_021902	GCTGG	2	10	63970	63979	0 %	20 %	60 %	20 %	528816777
39	NC_021902	CGATG	2	10	67245	67254	20 %	20 %	40 %	20 %	528816780
40	NC_021902	GCCGT	2	10	67405	67414	0 %	20 %	40 %	40 %	528816780
41	NC_021902	TGAAA	2	10	71860	71869	60 %	20 %	20 %	0 %	528816786
42	NC_021902	TCATG	2	10	72622	72631	20 %	40 %	20 %	20 %	528816789
43	NC_021902	CGGAA	2	10	72880	72889	40 %	0 %	40 %	20 %	528816790
44	NC_021902	TACTG	2	10	74184	74193	20 %	40 %	20 %	20 %	528816791
45	NC_021902	TTCAG	2	10	75268	75277	20 %	40 %	20 %	20 %	528816792
46	NC_021902	TGGCG	2	10	76991	77000	0 %	20 %	60 %	20 %	528816793
47	NC_021902	CAGCG	2	10	78505	78514	20 %	0 %	40 %	40 %	528816794
48	NC_021902	GCGCG	2	10	78850	78859	0 %	0 %	60 %	40 %	528816794
49	NC_021902	CGGGC	2	10	81763	81772	0 %	0 %	60 %	40 %	528816796
50	NC_021902	ATTCC	2	10	81813	81822	20 %	40 %	0 %	40 %	528816796
51	NC_021902	CCCGG	2	10	81998	82007	0 %	0 %	40 %	60 %	528816796
52	NC_021902	GGCGC	2	10	82793	82802	0 %	0 %	60 %	40 %	528816796
53	NC_021902	CGGCG	2	10	86030	86039	0 %	0 %	60 %	40 %	528816800
54	NC_021902	TACGC	2	10	86282	86291	20 %	20 %	20 %	40 %	528816800
55	NC_021902	CGGCG	2	10	86711	86720	0 %	0 %	60 %	40 %	528816800
56	NC_021902	TTGCT	2	10	87148	87157	0 %	60 %	20 %	20 %	528816801
57	NC_021902	TGCCC	2	10	87781	87790	0 %	20 %	20 %	60 %	528816801
58	NC_021902	CCCTG	2	10	88942	88951	0 %	20 %	20 %	60 %	528816803
59	NC_021902	ATCTG	2	10	89116	89125	20 %	40 %	20 %	20 %	528816803
60	NC_021902	TGGCG	2	10	92658	92667	0 %	20 %	60 %	20 %	528816805
61	NC_021902	CTTAT	2	10	92729	92738	20 %	60 %	0 %	20 %	528816805
62	NC_021902	ATGGT	2	10	94796	94805	20 %	40 %	40 %	0 %	528816808
63	NC_021902	GTTTT	2	10	95971	95980	0 %	80 %	20 %	0 %	528816810
64	NC_021902	GATTG	2	10	96113	96122	20 %	40 %	40 %	0 %	528816810
65	NC_021902	GATCA	2	10	96161	96170	40 %	20 %	20 %	20 %	528816811
66	NC_021902	GCAAA	2	10	96203	96212	60 %	0 %	20 %	20 %	528816811
67	NC_021902	GGCGC	2	10	99805	99814	0 %	0 %	60 %	40 %	528816814
68	NC_021902	CGCGG	2	10	104561	104570	0 %	0 %	60 %	40 %	528816819
69	NC_021902	GGTCG	2	10	106848	106857	0 %	20 %	60 %	20 %	528816822
70	NC_021902	AGCGC	2	10	108497	108506	20 %	0 %	40 %	40 %	528816822
71	NC_021902	CGCGG	2	10	109313	109322	0 %	0 %	60 %	40 %	528816823
72	NC_021902	GCCGC	2	10	109663	109672	0 %	0 %	40 %	60 %	528816824
73	NC_021902	ATAAA	2	10	116974	116983	80 %	20 %	0 %	0 %	528816832
74	NC_021902	CTGGC	2	10	118346	118355	0 %	20 %	40 %	40 %	528816833
75	NC_021902	GTCAG	2	10	125315	125324	20 %	20 %	40 %	20 %	528816839
76	NC_021902	TCCCG	2	10	126310	126319	0 %	20 %	20 %	60 %	528816839
77	NC_021902	TATGG	2	10	129368	129377	20 %	40 %	40 %	0 %	528816843
78	NC_021902	GCCGC	2	10	130828	130837	0 %	0 %	40 %	60 %	528816844
79	NC_021902	AGTTC	2	10	131403	131412	20 %	40 %	20 %	20 %	528816844
80	NC_021902	AGGCG	2	10	132906	132915	20 %	0 %	60 %	20 %	528816844
81	NC_021902	ACACC	2	10	133182	133191	40 %	0 %	0 %	60 %	528816845
82	NC_021902	GATGG	2	10	134670	134679	20 %	20 %	60 %	0 %	528816845
83	NC_021902	TTTGA	2	10	136102	136111	20 %	60 %	20 %	0 %	528816846
84	NC_021902	CGGCG	2	10	137012	137021	0 %	0 %	60 %	40 %	528816847
85	NC_021902	TGCCT	2	10	138044	138053	0 %	40 %	20 %	40 %	528816848
86	NC_021902	ATTTA	2	10	138363	138372	40 %	60 %	0 %	0 %	528816848
87	NC_021902	GCGAC	2	10	138960	138969	20 %	0 %	40 %	40 %	528816849
88	NC_021902	CGCTT	2	10	140375	140384	0 %	40 %	20 %	40 %	528816849
89	NC_021902	TGCGC	2	10	140675	140684	0 %	20 %	40 %	40 %	528816849
90	NC_021902	TGATG	2	10	143013	143022	20 %	40 %	40 %	0 %	528816851
91	NC_021902	ACCCA	2	10	146900	146909	40 %	0 %	0 %	60 %	528816856
92	NC_021902	GTTGG	2	10	147806	147815	0 %	40 %	60 %	0 %	528816857
93	NC_021902	GGGAA	2	10	148444	148453	40 %	0 %	60 %	0 %	528816858
94	NC_021902	GCAGC	2	10	157855	157864	20 %	0 %	40 %	40 %	528816871
95	NC_021902	ACGGC	2	10	159256	159265	20 %	0 %	40 %	40 %	528816873
96	NC_021902	CTTTG	2	10	161807	161816	0 %	60 %	20 %	20 %	528816876
97	NC_021902	TTGAA	2	10	161940	161949	40 %	40 %	20 %	0 %	528816876
98	NC_021902	TACGC	2	10	164045	164054	20 %	20 %	20 %	40 %	528816878
99	NC_021902	TTTTA	2	10	164353	164362	20 %	80 %	0 %	0 %	528816878
100	NC_021902	ATGGT	2	10	166326	166335	20 %	40 %	40 %	0 %	528816880
101	NC_021902	AAATT	2	10	167102	167111	60 %	40 %	0 %	0 %	528816881
102	NC_021902	AAAGA	2	10	169437	169446	80 %	0 %	20 %	0 %	528816883
103	NC_021902	GCGTC	2	10	172263	172272	0 %	20 %	40 %	40 %	528816886
104	NC_021902	AAGCG	2	10	173655	173664	40 %	0 %	40 %	20 %	528816887
105	NC_021902	GGGGC	2	10	174932	174941	0 %	0 %	80 %	20 %	528816888
106	NC_021902	GCGTA	2	10	177085	177094	20 %	20 %	40 %	20 %	528816890
107	NC_021902	GCGCG	2	10	177149	177158	0 %	0 %	60 %	40 %	528816890
108	NC_021902	CGCTC	2	10	178431	178440	0 %	20 %	20 %	60 %	528816891
109	NC_021902	TCATC	2	10	178891	178900	20 %	40 %	0 %	40 %	528816891
110	NC_021902	GCACA	2	10	181709	181718	40 %	0 %	20 %	40 %	528816894
111	NC_021902	GTATT	2	10	183230	183239	20 %	60 %	20 %	0 %	528816896
112	NC_021902	CACGC	2	10	183484	183493	20 %	0 %	20 %	60 %	528816897
113	NC_021902	GCGCG	2	10	184035	184044	0 %	0 %	60 %	40 %	528816897
114	NC_021902	AGGCC	2	10	185446	185455	20 %	0 %	40 %	40 %	528816898
115	NC_021902	TGGCG	2	10	190446	190455	0 %	20 %	60 %	20 %	528816905
116	NC_021902	GCGAT	2	10	192353	192362	20 %	20 %	40 %	20 %	528816906
117	NC_021902	GCAGT	2	10	199306	199315	20 %	20 %	40 %	20 %	528816912
118	NC_021902	CCGTG	2	10	201351	201360	0 %	20 %	40 %	40 %	528816914
119	NC_021902	TCATG	2	10	201954	201963	20 %	40 %	20 %	20 %	528816914
120	NC_021902	CGGAA	2	10	207140	207149	40 %	0 %	40 %	20 %	528816917
121	NC_021902	GGATT	2	10	207367	207376	20 %	40 %	40 %	0 %	528816917
122	NC_021902	TATCG	2	10	210940	210949	20 %	40 %	20 %	20 %	528816920
123	NC_021902	ATGGC	2	10	212369	212378	20 %	20 %	40 %	20 %	528816920
124	NC_021902	GGGCC	2	10	216242	216251	0 %	0 %	60 %	40 %	528816925
125	NC_021902	CGGAA	2	10	219037	219046	40 %	0 %	40 %	20 %	528816927
126	NC_021902	GCGCC	2	10	219181	219190	0 %	0 %	40 %	60 %	528816927
127	NC_021902	CAAAA	2	10	219542	219551	80 %	0 %	0 %	20 %	528816927
128	NC_021902	CGTAA	2	10	220125	220134	40 %	20 %	20 %	20 %	528816928
129	NC_021902	TGATT	2	10	221492	221501	20 %	60 %	20 %	0 %	528816930
130	NC_021902	GCACC	2	10	223290	223299	20 %	0 %	20 %	60 %	528816932
131	NC_021902	GGTTG	2	10	225110	225119	0 %	40 %	60 %	0 %	528816934
132	NC_021902	ATCCC	2	10	225404	225413	20 %	20 %	0 %	60 %	528816934
133	NC_021902	AAATA	2	10	226963	226972	80 %	20 %	0 %	0 %	528816935
134	NC_021902	GGCGA	2	10	229740	229749	20 %	0 %	60 %	20 %	528816937
135	NC_021902	CTGGG	2	10	231536	231545	0 %	20 %	60 %	20 %	528816938
136	NC_021902	TCTGT	2	10	235231	235240	0 %	60 %	20 %	20 %	528816944
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142	NC_021902	CTGGT	2	10	245669	245678	0 %	40 %	40 %	20 %	528816955
143	NC_021902	CCGGC	2	10	245691	245700	0 %	0 %	40 %	60 %	528816955
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148	NC_021902	CCTTA	2	10	251541	251550	20 %	40 %	0 %	40 %	528816962
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245	NC_021902	AGAGC	2	10	414705	414714	40 %	0 %	40 %	20 %	528817104
246	NC_021902	ACGGT	2	10	416802	416811	20 %	20 %	40 %	20 %	528817107
247	NC_021902	GCAAA	2	10	423358	423367	60 %	0 %	20 %	20 %	528817111
248	NC_021902	GTCTG	2	10	423483	423492	0 %	40 %	40 %	20 %	528817111
249	NC_021902	CAGTT	2	10	428165	428174	20 %	40 %	20 %	20 %	528817117
250	NC_021902	CGGGC	2	10	428210	428219	0 %	0 %	60 %	40 %	528817117
251	NC_021902	ACCAA	2	10	432650	432659	60 %	0 %	0 %	40 %	528817122
252	NC_021902	GCGCT	2	10	434099	434108	0 %	20 %	40 %	40 %	528817124
253	NC_021902	AGCGT	2	10	435740	435749	20 %	20 %	40 %	20 %	528817125
254	NC_021902	AATTT	2	10	439927	439936	40 %	60 %	0 %	0 %	528817126
255	NC_021902	GCCCG	2	10	440606	440615	0 %	0 %	40 %	60 %	528817126
256	NC_021902	ACCAT	2	10	445195	445204	40 %	20 %	0 %	40 %	528817131
257	NC_021902	TTTCT	2	10	445247	445256	0 %	80 %	0 %	20 %	528817130
258	NC_021902	GGGCA	2	10	448010	448019	20 %	0 %	60 %	20 %	528817134
259	NC_021902	CGTTT	2	10	448199	448208	0 %	60 %	20 %	20 %	528817134
260	NC_021902	AGTGC	2	10	449756	449765	20 %	20 %	40 %	20 %	528817136
261	NC_021902	CATCC	2	10	452613	452622	20 %	20 %	0 %	60 %	528817138
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263	NC_021902	GCCAT	2	10	457053	457062	20 %	20 %	20 %	40 %	528817146
264	NC_021902	TCTGG	2	10	461970	461979	0 %	40 %	40 %	20 %	528817150
265	NC_021902	AGGCG	2	10	463531	463540	20 %	0 %	60 %	20 %	528817152
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