MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 9779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021902	CCAT	2	8	183	190	25 %	25 %	0 %	50 %	528816717
2	NC_021902	TCGA	2	8	483	490	25 %	25 %	25 %	25 %	528816717
3	NC_021902	TCGC	2	8	1303	1310	0 %	25 %	25 %	50 %	528816717
4	NC_021902	CGAA	2	8	1396	1403	50 %	0 %	25 %	25 %	528816717
5	NC_021902	CAAA	2	8	2251	2258	75 %	0 %	0 %	25 %	528816718
6	NC_021902	AAGC	2	8	3559	3566	50 %	0 %	25 %	25 %	528816721
7	NC_021902	AGAA	2	8	4539	4546	75 %	0 %	25 %	0 %	528816723
8	NC_021902	CGAC	2	8	4611	4618	25 %	0 %	25 %	50 %	528816723
9	NC_021902	CAAA	2	8	4665	4672	75 %	0 %	0 %	25 %	528816723
10	NC_021902	GAAC	2	8	5034	5041	50 %	0 %	25 %	25 %	528816724
11	NC_021902	CGCT	2	8	5081	5088	0 %	25 %	25 %	50 %	528816724
12	NC_021902	CGGG	2	8	5374	5381	0 %	0 %	75 %	25 %	528816724
13	NC_021902	ATCG	2	8	5869	5876	25 %	25 %	25 %	25 %	528816725
14	NC_021902	GCAG	2	8	6456	6463	25 %	0 %	50 %	25 %	528816725
15	NC_021902	CGTT	2	8	6476	6483	0 %	50 %	25 %	25 %	528816725
16	NC_021902	CGAC	2	8	7297	7304	25 %	0 %	25 %	50 %	528816726
17	NC_021902	GGTA	2	8	8179	8186	25 %	25 %	50 %	0 %	528816728
18	NC_021902	TATC	2	8	9531	9538	25 %	50 %	0 %	25 %	528816729
19	NC_021902	TGGT	2	8	10184	10191	0 %	50 %	50 %	0 %	528816730
20	NC_021902	AGGA	2	8	11632	11639	50 %	0 %	50 %	0 %	528816731
21	NC_021902	ACGG	2	8	11679	11686	25 %	0 %	50 %	25 %	528816731
22	NC_021902	ACCT	2	8	12105	12112	25 %	25 %	0 %	50 %	528816731
23	NC_021902	CTGG	2	8	13640	13647	0 %	25 %	50 %	25 %	528816732
24	NC_021902	AGTA	2	8	14397	14404	50 %	25 %	25 %	0 %	528816732
25	NC_021902	AGCC	2	8	14670	14677	25 %	0 %	25 %	50 %	528816733
26	NC_021902	CCAG	2	8	14854	14861	25 %	0 %	25 %	50 %	528816733
27	NC_021902	CTCA	2	8	15119	15126	25 %	25 %	0 %	50 %	528816733
28	NC_021902	CAGC	2	8	15164	15171	25 %	0 %	25 %	50 %	528816733
29	NC_021902	TGTC	2	8	15373	15380	0 %	50 %	25 %	25 %	528816733
30	NC_021902	CCGA	2	8	16536	16543	25 %	0 %	25 %	50 %	528816734
31	NC_021902	TTAA	2	8	16947	16954	50 %	50 %	0 %	0 %	528816734
32	NC_021902	TGGC	2	8	16972	16979	0 %	25 %	50 %	25 %	528816734
33	NC_021902	CTGG	2	8	17814	17821	0 %	25 %	50 %	25 %	528816735
34	NC_021902	GGGA	2	8	17912	17919	25 %	0 %	75 %	0 %	528816735
35	NC_021902	TACC	2	8	18947	18954	25 %	25 %	0 %	50 %	528816736
36	NC_021902	AGAA	2	8	18955	18962	75 %	0 %	25 %	0 %	528816736
37	NC_021902	CTTC	2	8	19306	19313	0 %	50 %	0 %	50 %	528816736
38	NC_021902	ACCA	2	8	19608	19615	50 %	0 %	0 %	50 %	528816736
39	NC_021902	ATTA	2	8	19846	19853	50 %	50 %	0 %	0 %	528816736
40	NC_021902	GGCT	2	8	20301	20308	0 %	25 %	50 %	25 %	528816737
41	NC_021902	TACC	2	8	20738	20745	25 %	25 %	0 %	50 %	528816737
42	NC_021902	CGAA	2	8	20800	20807	50 %	0 %	25 %	25 %	528816737
43	NC_021902	TGTT	2	8	21357	21364	0 %	75 %	25 %	0 %	528816738
44	NC_021902	CCAA	2	8	21645	21652	50 %	0 %	0 %	50 %	528816738
45	NC_021902	GGGC	2	8	21750	21757	0 %	0 %	75 %	25 %	528816738
46	NC_021902	GCGT	2	8	22262	22269	0 %	25 %	50 %	25 %	528816739
47	NC_021902	TTGA	2	8	22609	22616	25 %	50 %	25 %	0 %	528816739
48	NC_021902	TGCG	2	8	22923	22930	0 %	25 %	50 %	25 %	528816740
49	NC_021902	GCGA	2	8	22956	22963	25 %	0 %	50 %	25 %	528816740
50	NC_021902	GATC	2	8	23610	23617	25 %	25 %	25 %	25 %	528816741
51	NC_021902	TGTT	2	8	25247	25254	0 %	75 %	25 %	0 %	528816742
52	NC_021902	GCTG	2	8	26127	26134	0 %	25 %	50 %	25 %	528816743
53	NC_021902	TCAT	2	8	26604	26611	25 %	50 %	0 %	25 %	528816744
54	NC_021902	GCAG	2	8	26988	26995	25 %	0 %	50 %	25 %	528816744
55	NC_021902	AATC	2	8	27689	27696	50 %	25 %	0 %	25 %	528816745
56	NC_021902	AACC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	0 %	50 %	528816746
57	NC_021902	AGCC	2	8	28798	28805	25 %	0 %	25 %	50 %	528816746
58	NC_021902	AGTG	2	8	29845	29852	25 %	25 %	50 %	0 %	528816747
59	NC_021902	CGTC	2	8	29978	29985	0 %	25 %	25 %	50 %	528816747
60	NC_021902	CGCT	2	8	30561	30568	0 %	25 %	25 %	50 %	528816747
61	NC_021902	CAAC	2	8	31695	31702	50 %	0 %	0 %	50 %	528816748
62	NC_021902	GTTC	2	8	32255	32262	0 %	50 %	25 %	25 %	528816748
63	NC_021902	GATA	2	8	32369	32376	50 %	25 %	25 %	0 %	528816748
64	NC_021902	ACAT	2	8	34495	34502	50 %	25 %	0 %	25 %	528816751
65	NC_021902	CCAA	2	8	34527	34534	50 %	0 %	0 %	50 %	528816751
66	NC_021902	TTGG	2	8	34947	34954	0 %	50 %	50 %	0 %	528816751
67	NC_021902	CGTG	2	8	35086	35093	0 %	25 %	50 %	25 %	528816751
68	NC_021902	CCGG	2	8	35139	35146	0 %	0 %	50 %	50 %	528816751
69	NC_021902	ACCA	2	8	35342	35349	50 %	0 %	0 %	50 %	528816751
70	NC_021902	GGCG	2	8	35378	35385	0 %	0 %	75 %	25 %	528816751
71	NC_021902	CTGC	2	8	35829	35836	0 %	25 %	25 %	50 %	528816752
72	NC_021902	CGAC	2	8	36010	36017	25 %	0 %	25 %	50 %	528816752
73	NC_021902	GCGT	2	8	36337	36344	0 %	25 %	50 %	25 %	528816752
74	NC_021902	CTAT	2	8	36871	36878	25 %	50 %	0 %	25 %	528816753
75	NC_021902	GGCG	2	8	37318	37325	0 %	0 %	75 %	25 %	528816753
76	NC_021902	AGAC	2	8	37426	37433	50 %	0 %	25 %	25 %	528816753
77	NC_021902	GCGG	2	8	37624	37631	0 %	0 %	75 %	25 %	528816753
78	NC_021902	GTAT	2	8	37919	37926	25 %	50 %	25 %	0 %	528816754
79	NC_021902	GAAC	2	8	38907	38914	50 %	0 %	25 %	25 %	528816754
80	NC_021902	CAGT	2	8	39780	39787	25 %	25 %	25 %	25 %	528816754
81	NC_021902	GGCG	2	8	40354	40361	0 %	0 %	75 %	25 %	528816755
82	NC_021902	GTTT	2	8	40697	40704	0 %	75 %	25 %	0 %	528816755
83	NC_021902	TGGT	2	8	41307	41314	0 %	50 %	50 %	0 %	528816756
84	NC_021902	GCAT	2	8	41822	41829	25 %	25 %	25 %	25 %	528816756
85	NC_021902	TGTT	2	8	41933	41940	0 %	75 %	25 %	0 %	528816756
86	NC_021902	AGCC	2	8	42352	42359	25 %	0 %	25 %	50 %	528816756
87	NC_021902	TAAT	2	8	42497	42504	50 %	50 %	0 %	0 %	528816757
88	NC_021902	AAAT	2	8	42598	42605	75 %	25 %	0 %	0 %	528816757
89	NC_021902	GCCA	2	8	42924	42931	25 %	0 %	25 %	50 %	528816757
90	NC_021902	AATA	2	8	43685	43692	75 %	25 %	0 %	0 %	528816757
91	NC_021902	ACAG	2	8	43702	43709	50 %	0 %	25 %	25 %	528816757
92	NC_021902	ATGG	2	8	44094	44101	25 %	25 %	50 %	0 %	528816758
93	NC_021902	CCGT	2	8	44198	44205	0 %	25 %	25 %	50 %	528816758
94	NC_021902	CCCG	2	8	44901	44908	0 %	0 %	25 %	75 %	528816758
95	NC_021902	TTCG	2	8	45318	45325	0 %	50 %	25 %	25 %	528816759
96	NC_021902	AGCG	2	8	45690	45697	25 %	0 %	50 %	25 %	528816759
97	NC_021902	TTTC	2	8	46866	46873	0 %	75 %	0 %	25 %	528816761
98	NC_021902	TGGG	2	8	47689	47696	0 %	25 %	75 %	0 %	528816762
99	NC_021902	TGAT	2	8	47792	47799	25 %	50 %	25 %	0 %	528816762
100	NC_021902	CTGC	3	12	48215	48226	0 %	25 %	25 %	50 %	528816762
101	NC_021902	TTCT	2	8	49384	49391	0 %	75 %	0 %	25 %	528816763
102	NC_021902	GGCT	2	8	49501	49508	0 %	25 %	50 %	25 %	528816763
103	NC_021902	TTCA	2	8	50240	50247	25 %	50 %	0 %	25 %	528816764
104	NC_021902	TTGC	2	8	50664	50671	0 %	50 %	25 %	25 %	528816764
105	NC_021902	AGCC	2	8	50780	50787	25 %	0 %	25 %	50 %	528816764
106	NC_021902	GCGG	2	8	51586	51593	0 %	0 %	75 %	25 %	528816764
107	NC_021902	TCAT	2	8	52050	52057	25 %	50 %	0 %	25 %	528816764
108	NC_021902	ATCA	2	8	52082	52089	50 %	25 %	0 %	25 %	528816764
109	NC_021902	GCCA	2	8	52425	52432	25 %	0 %	25 %	50 %	528816764
110	NC_021902	AGTG	2	8	52604	52611	25 %	25 %	50 %	0 %	528816765
111	NC_021902	GCCA	2	8	52629	52636	25 %	0 %	25 %	50 %	528816765
112	NC_021902	GTCA	2	8	52868	52875	25 %	25 %	25 %	25 %	528816766
113	NC_021902	GGGC	2	8	54078	54085	0 %	0 %	75 %	25 %	528816767
114	NC_021902	GAAA	2	8	55072	55079	75 %	0 %	25 %	0 %	528816768
115	NC_021902	CACG	2	8	56576	56583	25 %	0 %	25 %	50 %	528816769
116	NC_021902	GGCG	2	8	56840	56847	0 %	0 %	75 %	25 %	528816769
117	NC_021902	GCTG	2	8	56865	56872	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
118	NC_021902	ATGG	2	8	56909	56916	25 %	25 %	50 %	0 %	528816769
119	NC_021902	TGGC	2	8	56975	56982	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
120	NC_021902	GCTG	2	8	57517	57524	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
121	NC_021902	TGGC	2	8	58351	58358	0 %	25 %	50 %	25 %	528816770
122	NC_021902	CTGG	2	8	58425	58432	0 %	25 %	50 %	25 %	528816770
123	NC_021902	CCGA	2	8	58675	58682	25 %	0 %	25 %	50 %	528816770
124	NC_021902	GAAT	2	8	58754	58761	50 %	25 %	25 %	0 %	528816770
125	NC_021902	TCGT	2	8	58880	58887	0 %	50 %	25 %	25 %	528816770
126	NC_021902	GTAT	2	8	59193	59200	25 %	50 %	25 %	0 %	528816771
127	NC_021902	GCGG	2	8	59764	59771	0 %	0 %	75 %	25 %	528816771
128	NC_021902	AGCA	2	8	59897	59904	50 %	0 %	25 %	25 %	528816771
129	NC_021902	CGGC	2	8	61590	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	528816773
130	NC_021902	TGGC	2	8	61922	61929	0 %	25 %	50 %	25 %	528816774
131	NC_021902	CTGG	2	8	62649	62656	0 %	25 %	50 %	25 %	528816775
132	NC_021902	GCCC	2	8	63893	63900	0 %	0 %	25 %	75 %	528816777
133	NC_021902	TGGC	2	8	64028	64035	0 %	25 %	50 %	25 %	528816777
134	NC_021902	GCGG	2	8	64816	64823	0 %	0 %	75 %	25 %	528816777
135	NC_021902	GGGC	2	8	65137	65144	0 %	0 %	75 %	25 %	528816777
136	NC_021902	GGCG	2	8	66104	66111	0 %	0 %	75 %	25 %	528816779
137	NC_021902	TGAA	2	8	66361	66368	50 %	25 %	25 %	0 %	528816779
138	NC_021902	GGCT	2	8	66435	66442	0 %	25 %	50 %	25 %	528816779
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