MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus lutetiensis 033

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021900	AAGTGT	2	12	21183	21194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021900	ACTAAT	2	12	21212	21223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021900	AAATAT	2	12	91997	92008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021900	AAAATA	2	12	96053	96064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021900	ATTCTT	2	12	139100	139111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021900	TGAAAA	2	12	181885	181896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021900	GCTGAT	2	12	189158	189169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021900	AAGTGT	2	12	216743	216754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021900	ACTAAT	2	12	216772	216783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021900	AAGTGT	2	12	276304	276315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021900	ACTAAT	2	12	276333	276344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021900	TTCGGG	2	12	277239	277250	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021900	AAGTGT	2	12	283803	283814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021900	ACTAAT	2	12	283832	283843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021900	TTTTTA	2	12	285390	285401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021900	TTTTTA	2	12	293115	293126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021900	AAGTGT	2	12	339945	339956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021900	ACTAAT	2	12	339974	339985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021900	AAAGAA	2	12	360068	360079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021900	TTTTGA	2	12	376110	376121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021900	CGCAAA	2	12	376145	376156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021900	TCAAAA	2	12	419323	419334	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021900	TTTGGT	2	12	419355	419366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021900	ATCATA	2	12	444499	444510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021900	AAGTGT	2	12	453923	453934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021900	ACTAAT	2	12	453952	453963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021900	ACAGCT	2	12	488927	488938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021900	GCCCCC	2	12	504927	504938	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_021900	ATTTTG	2	12	517688	517699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021900	ATTCAG	2	12	579394	579405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021900	TTTTTG	2	12	590668	590679	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021900	TTATAA	2	12	607400	607411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021900	TTTTTA	2	12	613020	613031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021900	AAAAAT	2	12	676488	676499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021900	TTCGGG	2	12	767411	767422	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021900	CTTTTT	2	12	769055	769066	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021900	AAAACA	2	12	793163	793174	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021900	AGTGTC	2	12	805069	805080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021900	AAAATC	2	12	805859	805870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021900	AGCCTC	2	12	824287	824298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021900	AAAGAT	2	12	843645	843656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021900	CAGAAG	2	12	844195	844206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021900	TTGGTT	2	12	853853	853864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021900	GACAAC	2	12	862322	862333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021900	ATAAAT	2	12	868055	868066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021900	AATGAA	2	12	878250	878261	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021900	TTAAAA	2	12	883519	883530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021900	TCAAGT	2	12	891033	891044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021900	CTTTTT	2	12	926046	926057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021900	TTTATT	2	12	952306	952317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021900	ACCTCA	2	12	966856	966867	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021900	TACTTA	2	12	967050	967061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021900	TACTTA	2	12	967126	967137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021900	TTTTTC	2	12	1019291	1019302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021900	AAAAAT	2	12	1078402	1078413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021900	TGAATG	2	12	1085503	1085514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021900	CTTTTT	2	12	1131291	1131302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021900	TTAGCT	2	12	1145910	1145921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021900	ATCTCT	2	12	1159670	1159681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021900	AAAAAG	2	12	1172510	1172521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021900	ATTGAC	2	12	1272502	1272513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021900	TCGCAA	2	12	1315580	1315591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021900	TTTATA	2	12	1324298	1324309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021900	TCAATT	2	12	1378149	1378160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021900	ATGTTT	2	12	1378256	1378267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021900	TTTAAA	2	12	1388893	1388904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021900	GCTTTC	2	12	1483090	1483101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021900	ATCGTA	2	12	1486109	1486120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021900	TCTCCT	2	12	1486126	1486137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021900	TTGATA	2	12	1496778	1496789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021900	TTTTAT	2	12	1522821	1522832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021900	AAAGAT	2	12	1524254	1524265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021900	TCGTTA	2	12	1525453	1525464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021900	GTTTTA	2	12	1549941	1549952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021900	TACAAA	2	12	1610100	1610111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021900	AAAAGA	2	12	1612450	1612461	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021900	TAAAAA	2	12	1645141	1645152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021900	AAGCTT	2	12	1670903	1670914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021900	TACATT	2	12	1682754	1682765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021900	TCCCTC	2	12	1688833	1688844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021900	TGATAA	2	12	1696073	1696084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021900	TATAAA	2	12	1720293	1720304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021900	AATATC	2	12	1771241	1771252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021900	AATTTA	2	12	1773165	1773176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021900	AATATA	2	12	1779076	1779087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021900	AATATT	2	12	1779097	1779108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021900	ATATTT	2	12	1785936	1785947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021900	AGTAAT	2	12	1833369	1833380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021900	GTTTTA	2	12	1839330	1839341	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021900	ACTAAA	2	12	1841759	1841770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021900	TTAATT	2	12	1873494	1873505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021900	TAGAAA	2	12	1878082	1878093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021900	TTCCTT	2	12	1892964	1892975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021900	CAATTT	2	12	1909713	1909724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021900	TACTTA	2	12	1912905	1912916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021900	TTTAAC	2	12	1925039	1925050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.