MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021899	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527328297
2	NC_021899	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527328298
3	NC_021899	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527328298
4	NC_021899	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527328298
5	NC_021899	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527328298
6	NC_021899	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527328299
7	NC_021899	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527328302
8	NC_021899	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527328303
9	NC_021899	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527328304
10	NC_021899	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527328305
11	NC_021899	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527328305
12	NC_021899	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527328306
13	NC_021899	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527328307
14	NC_021899	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527328307
15	NC_021899	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527328309
16	NC_021899	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527328310
17	NC_021899	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527328310
18	NC_021899	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527328310
19	NC_021899	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527328313
20	NC_021899	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527328315
21	NC_021899	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527328315
22	NC_021899	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527328315
23	NC_021899	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527328316
24	NC_021899	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527328317
25	NC_021899	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527328317
26	NC_021899	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527328319
27	NC_021899	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527328319
28	NC_021899	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527328320
29	NC_021899	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527328321
30	NC_021899	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527328322
31	NC_021899	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527328328
32	NC_021899	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527328328
33	NC_021899	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527328329
34	NC_021899	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527328330
35	NC_021899	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527328332
36	NC_021899	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527328332
37	NC_021899	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527328336
38	NC_021899	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527328338
39	NC_021899	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527328338
40	NC_021899	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527328341
41	NC_021899	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527328342
42	NC_021899	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527328345
43	NC_021899	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527328346
44	NC_021899	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527328347
45	NC_021899	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527328349
46	NC_021899	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527328352
47	NC_021899	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527328353
48	NC_021899	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527328353
49	NC_021899	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527328355
50	NC_021899	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527328355
51	NC_021899	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527328357
52	NC_021899	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527328358
53	NC_021899	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527328358
54	NC_021899	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527328358
55	NC_021899	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527328358
56	NC_021899	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527328358
57	NC_021899	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527328360
58	NC_021899	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527328360
59	NC_021899	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527328361
60	NC_021899	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527328362
61	NC_021899	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527328366
62	NC_021899	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527328366
63	NC_021899	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527328368
64	NC_021899	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527328368
65	NC_021899	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527328370
66	NC_021899	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527328371
67	NC_021899	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527328372
68	NC_021899	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527328375
69	NC_021899	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527328376
70	NC_021899	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527328377
71	NC_021899	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527328379
72	NC_021899	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527328380
73	NC_021899	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527328380
74	NC_021899	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527328382
75	NC_021899	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527328382
76	NC_021899	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527328382
77	NC_021899	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527328382
78	NC_021899	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527328382
79	NC_021899	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527328383
80	NC_021899	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527328384
81	NC_021899	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527328385
82	NC_021899	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527328387
83	NC_021899	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527328387
84	NC_021899	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527328387
85	NC_021899	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527328388
86	NC_021899	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527328388
87	NC_021899	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527328391
88	NC_021899	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527328393
89	NC_021899	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527328396
90	NC_021899	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527328396
91	NC_021899	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527328396
92	NC_021899	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527328397
93	NC_021899	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527328397
94	NC_021899	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527328400
95	NC_021899	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527328403
96	NC_021899	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527328403
97	NC_021899	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527328407
98	NC_021899	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527328410
99	NC_021899	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527328410
100	NC_021899	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527328412
101	NC_021899	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527328412
102	NC_021899	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527328414
103	NC_021899	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527328415
104	NC_021899	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527328416
105	NC_021899	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527328422
106	NC_021899	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527328423
107	NC_021899	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527328423
108	NC_021899	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527328424
109	NC_021899	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527328425
110	NC_021899	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527328427
111	NC_021899	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527328427
112	NC_021899	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527328429
113	NC_021899	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527328430
114	NC_021899	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527328431
115	NC_021899	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527328435
116	NC_021899	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527328435
117	NC_021899	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527328438
118	NC_021899	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527328442
119	NC_021899	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527328445
120	NC_021899	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527328445
121	NC_021899	TATGA	2	10	163885	163894	40 %	40 %	20 %	0 %	527328446
122	NC_021899	CAAAA	2	10	166964	166973	80 %	0 %	0 %	20 %	527328447
123	NC_021899	AAGAG	2	10	167797	167806	60 %	0 %	40 %	0 %	527328447
124	NC_021899	GATTG	2	10	168142	168151	20 %	40 %	40 %	0 %	527328447
125	NC_021899	GTTTT	2	10	174621	174630	0 %	80 %	20 %	0 %	527328451
126	NC_021899	TATTG	2	10	174644	174653	20 %	60 %	20 %	0 %	527328451
127	NC_021899	CAGCA	2	10	175003	175012	40 %	0 %	20 %	40 %	527328451
128	NC_021899	TAGGA	2	10	175308	175317	40 %	20 %	40 %	0 %	527328452
129	NC_021899	TGATT	2	10	177235	177244	20 %	60 %	20 %	0 %	527328453
130	NC_021899	TCAAT	2	10	177876	177885	40 %	40 %	0 %	20 %	527328453
131	NC_021899	TTTTC	2	10	177915	177924	0 %	80 %	0 %	20 %	527328453
132	NC_021899	AGAGT	2	10	180861	180870	40 %	20 %	40 %	0 %	527328454
133	NC_021899	TTGAA	2	10	181551	181560	40 %	40 %	20 %	0 %	527328455
134	NC_021899	TGAGT	2	10	182365	182374	20 %	40 %	40 %	0 %	527328455
135	NC_021899	TTGAG	2	10	183115	183124	20 %	40 %	40 %	0 %	527328456
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