MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 2528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021899	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527328295
2	NC_021899	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527328296
3	NC_021899	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527328296
4	NC_021899	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527328297
5	NC_021899	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527328297
6	NC_021899	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527328298
7	NC_021899	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527328298
8	NC_021899	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527328298
9	NC_021899	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527328298
10	NC_021899	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527328299
11	NC_021899	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527328299
12	NC_021899	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527328299
13	NC_021899	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527328300
14	NC_021899	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527328300
15	NC_021899	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527328301
16	NC_021899	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527328301
17	NC_021899	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527328302
18	NC_021899	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527328303
19	NC_021899	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527328303
20	NC_021899	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527328303
21	NC_021899	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527328303
22	NC_021899	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527328304
23	NC_021899	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527328304
24	NC_021899	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527328304
25	NC_021899	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527328305
26	NC_021899	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527328305
27	NC_021899	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527328305
28	NC_021899	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527328305
29	NC_021899	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527328306
30	NC_021899	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527328307
31	NC_021899	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527328307
32	NC_021899	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527328308
33	NC_021899	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527328308
34	NC_021899	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527328308
35	NC_021899	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527328309
36	NC_021899	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527328309
37	NC_021899	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527328310
38	NC_021899	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527328310
39	NC_021899	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527328310
40	NC_021899	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527328310
41	NC_021899	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527328310
42	NC_021899	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527328312
43	NC_021899	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527328315
44	NC_021899	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527328315
45	NC_021899	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527328315
46	NC_021899	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527328315
47	NC_021899	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527328315
48	NC_021899	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527328315
49	NC_021899	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527328315
50	NC_021899	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527328315
51	NC_021899	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527328316
52	NC_021899	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527328316
53	NC_021899	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527328316
54	NC_021899	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527328316
55	NC_021899	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527328316
56	NC_021899	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527328317
57	NC_021899	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527328317
58	NC_021899	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527328317
59	NC_021899	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527328317
60	NC_021899	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527328318
61	NC_021899	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527328318
62	NC_021899	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527328320
63	NC_021899	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527328320
64	NC_021899	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527328320
65	NC_021899	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527328320
66	NC_021899	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527328321
67	NC_021899	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527328321
68	NC_021899	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527328321
69	NC_021899	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527328323
70	NC_021899	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527328326
71	NC_021899	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527328326
72	NC_021899	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527328327
73	NC_021899	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527328327
74	NC_021899	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527328328
75	NC_021899	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527328328
76	NC_021899	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527328328
77	NC_021899	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527328328
78	NC_021899	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527328329
79	NC_021899	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527328329
80	NC_021899	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527328329
81	NC_021899	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527328329
82	NC_021899	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527328329
83	NC_021899	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527328330
84	NC_021899	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527328330
85	NC_021899	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527328330
86	NC_021899	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527328330
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89	NC_021899	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527328332
90	NC_021899	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527328334
91	NC_021899	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527328334
92	NC_021899	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527328336
93	NC_021899	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527328336
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95	NC_021899	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527328337
96	NC_021899	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527328337
97	NC_021899	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527328337
98	NC_021899	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527328337
99	NC_021899	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527328337
100	NC_021899	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527328338
101	NC_021899	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527328338
102	NC_021899	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527328338
103	NC_021899	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527328338
104	NC_021899	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527328338
105	NC_021899	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527328338
106	NC_021899	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527328338
107	NC_021899	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527328338
108	NC_021899	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527328339
109	NC_021899	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527328339
110	NC_021899	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527328340
111	NC_021899	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527328340
112	NC_021899	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527328342
113	NC_021899	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527328342
114	NC_021899	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527328342
115	NC_021899	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527328344
116	NC_021899	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527328344
117	NC_021899	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527328345
118	NC_021899	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527328345
119	NC_021899	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527328345
120	NC_021899	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527328345
121	NC_021899	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527328345
122	NC_021899	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527328345
123	NC_021899	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527328346
124	NC_021899	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527328346
125	NC_021899	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527328346
126	NC_021899	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527328346
127	NC_021899	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527328346
128	NC_021899	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527328346
129	NC_021899	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527328347
130	NC_021899	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527328347
131	NC_021899	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527328347
132	NC_021899	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527328348
133	NC_021899	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527328348
134	NC_021899	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527328349
135	NC_021899	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527328349
136	NC_021899	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527328349
137	NC_021899	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527328349
138	NC_021899	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527328349
139	NC_021899	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527328349
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