MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 2377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021899	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021899	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021899	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021899	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527328297
5	NC_021899	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527328297
6	NC_021899	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527328297
7	NC_021899	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527328298
8	NC_021899	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527328299
9	NC_021899	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527328299
10	NC_021899	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527328299
11	NC_021899	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527328299
12	NC_021899	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527328299
13	NC_021899	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527328299
14	NC_021899	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021899	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527328302
16	NC_021899	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527328303
17	NC_021899	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527328303
18	NC_021899	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	527328303
19	NC_021899	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021899	GA	3	6	9869	9874	50 %	0 %	50 %	0 %	527328305
21	NC_021899	AG	3	6	10086	10091	50 %	0 %	50 %	0 %	527328305
22	NC_021899	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021899	AG	3	6	11312	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	527328306
24	NC_021899	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527328306
25	NC_021899	TG	3	6	12775	12780	0 %	50 %	50 %	0 %	527328307
26	NC_021899	AG	3	6	12924	12929	50 %	0 %	50 %	0 %	527328307
27	NC_021899	AG	4	8	13080	13087	50 %	0 %	50 %	0 %	527328307
28	NC_021899	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021899	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021899	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	527328308
31	NC_021899	CT	3	6	14698	14703	0 %	50 %	0 %	50 %	527328308
32	NC_021899	AG	3	6	15748	15753	50 %	0 %	50 %	0 %	527328309
33	NC_021899	TC	3	6	15788	15793	0 %	50 %	0 %	50 %	527328309
34	NC_021899	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	527328310
35	NC_021899	AG	3	6	16388	16393	50 %	0 %	50 %	0 %	527328310
36	NC_021899	GA	3	6	17172	17177	50 %	0 %	50 %	0 %	527328310
37	NC_021899	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021899	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021899	GA	3	6	17775	17780	50 %	0 %	50 %	0 %	527328311
40	NC_021899	TC	3	6	18225	18230	0 %	50 %	0 %	50 %	527328311
41	NC_021899	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021899	TC	3	6	18653	18658	0 %	50 %	0 %	50 %	527328312
43	NC_021899	GA	3	6	18668	18673	50 %	0 %	50 %	0 %	527328312
44	NC_021899	GA	3	6	18767	18772	50 %	0 %	50 %	0 %	527328312
45	NC_021899	AG	3	6	19233	19238	50 %	0 %	50 %	0 %	527328312
46	NC_021899	AG	4	8	19519	19526	50 %	0 %	50 %	0 %	527328312
47	NC_021899	GT	3	6	19782	19787	0 %	50 %	50 %	0 %	527328312
48	NC_021899	AG	3	6	20010	20015	50 %	0 %	50 %	0 %	527328313
49	NC_021899	TG	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	527328313
50	NC_021899	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	527328314
51	NC_021899	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021899	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021899	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021899	CT	4	8	21920	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	527328315
55	NC_021899	AT	3	6	22190	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	527328315
56	NC_021899	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	527328315
57	NC_021899	GA	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	527328315
58	NC_021899	GA	3	6	23925	23930	50 %	0 %	50 %	0 %	527328315
59	NC_021899	AG	3	6	24306	24311	50 %	0 %	50 %	0 %	527328315
60	NC_021899	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	527328316
61	NC_021899	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	527328316
62	NC_021899	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	527328316
63	NC_021899	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	527328316
64	NC_021899	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021899	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021899	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	527328317
67	NC_021899	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	527328317
68	NC_021899	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021899	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021899	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	527328319
71	NC_021899	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	527328319
72	NC_021899	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527328319
73	NC_021899	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527328319
74	NC_021899	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527328320
75	NC_021899	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	527328321
76	NC_021899	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527328321
77	NC_021899	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	527328321
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80	NC_021899	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	527328323
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87	NC_021899	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	527328327
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89	NC_021899	CT	3	6	36277	36282	0 %	50 %	0 %	50 %	527328328
90	NC_021899	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021899	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021899	GA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	50 %	0 %	527328329
93	NC_021899	CT	3	6	37019	37024	0 %	50 %	0 %	50 %	527328329
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95	NC_021899	AG	3	6	38076	38081	50 %	0 %	50 %	0 %	527328329
96	NC_021899	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	527328329
97	NC_021899	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021899	GA	3	6	39387	39392	50 %	0 %	50 %	0 %	527328330
99	NC_021899	AG	3	6	39524	39529	50 %	0 %	50 %	0 %	527328330
100	NC_021899	AG	3	6	39624	39629	50 %	0 %	50 %	0 %	527328330
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102	NC_021899	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	527328331
103	NC_021899	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	527328331
104	NC_021899	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	527328331
105	NC_021899	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	527328331
106	NC_021899	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	527328331
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108	NC_021899	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	527328331
109	NC_021899	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	527328332
110	NC_021899	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	527328332
111	NC_021899	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	527328332
112	NC_021899	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021899	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021899	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021899	TG	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	527328333
116	NC_021899	AC	3	6	43404	43409	50 %	0 %	0 %	50 %	527328334
117	NC_021899	TC	3	6	43573	43578	0 %	50 %	0 %	50 %	527328334
118	NC_021899	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021899	TA	3	6	43890	43895	50 %	50 %	0 %	0 %	527328335
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123	NC_021899	AG	3	6	45514	45519	50 %	0 %	50 %	0 %	527328337
124	NC_021899	AG	4	8	45954	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	527328338
125	NC_021899	CT	3	6	46145	46150	0 %	50 %	0 %	50 %	527328338
126	NC_021899	TG	3	6	46346	46351	0 %	50 %	50 %	0 %	527328338
127	NC_021899	AG	3	6	46399	46404	50 %	0 %	50 %	0 %	527328338
128	NC_021899	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021899	AG	3	6	49326	49331	50 %	0 %	50 %	0 %	527328340
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131	NC_021899	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021899	TC	3	6	52896	52901	0 %	50 %	0 %	50 %	527328344
133	NC_021899	CA	3	6	52947	52952	50 %	0 %	0 %	50 %	527328344
134	NC_021899	GA	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	527328345
135	NC_021899	CT	3	6	53685	53690	0 %	50 %	0 %	50 %	527328345
136	NC_021899	CT	3	6	54348	54353	0 %	50 %	0 %	50 %	527328346
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138	NC_021899	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021899	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021899	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021899	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021899	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527328348
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144	NC_021899	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527328349
145	NC_021899	TC	3	6	60562	60567	0 %	50 %	0 %	50 %	527328350
146	NC_021899	GA	3	6	60790	60795	50 %	0 %	50 %	0 %	527328351
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