MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021898	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527327370
2	NC_021898	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527327371
3	NC_021898	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527327371
4	NC_021898	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527327371
5	NC_021898	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527327371
6	NC_021898	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527327372
7	NC_021898	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021898	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527327375
9	NC_021898	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527327376
10	NC_021898	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527327377
11	NC_021898	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527327378
12	NC_021898	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527327378
13	NC_021898	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527327379
14	NC_021898	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527327380
15	NC_021898	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527327380
16	NC_021898	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527327382
17	NC_021898	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527327383
18	NC_021898	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527327383
19	NC_021898	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527327383
20	NC_021898	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527327386
21	NC_021898	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527327388
22	NC_021898	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527327388
23	NC_021898	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527327388
24	NC_021898	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527327389
25	NC_021898	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527327390
26	NC_021898	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527327390
27	NC_021898	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527327392
28	NC_021898	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527327392
29	NC_021898	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527327393
30	NC_021898	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527327394
31	NC_021898	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527327395
32	NC_021898	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021898	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527327401
34	NC_021898	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527327401
35	NC_021898	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527327402
36	NC_021898	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527327403
37	NC_021898	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527327405
38	NC_021898	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527327405
39	NC_021898	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021898	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527327409
41	NC_021898	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527327411
42	NC_021898	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527327411
43	NC_021898	GAAGA	2	10	47939	47948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021898	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527327414
45	NC_021898	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527327415
46	NC_021898	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527327418
47	NC_021898	AATTT	2	10	54048	54057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021898	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527327419
49	NC_021898	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527327420
50	NC_021898	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527327422
51	NC_021898	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527327425
52	NC_021898	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527327426
53	NC_021898	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527327426
54	NC_021898	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527327428
55	NC_021898	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527327428
56	NC_021898	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527327430
57	NC_021898	AAAAG	2	10	68992	69001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021898	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527327431
59	NC_021898	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527327431
60	NC_021898	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527327431
61	NC_021898	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527327431
62	NC_021898	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527327431
63	NC_021898	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021898	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527327433
65	NC_021898	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527327433
66	NC_021898	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527327434
67	NC_021898	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527327435
68	NC_021898	AAAAG	2	10	76685	76694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021898	ATCAA	2	10	78383	78392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021898	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527327439
71	NC_021898	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527327439
72	NC_021898	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527327441
73	NC_021898	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527327441
74	NC_021898	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527327443
75	NC_021898	TTTGT	2	10	85122	85131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021898	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527327444
77	NC_021898	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527327445
78	NC_021898	AATAA	2	10	88121	88130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021898	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527327448
80	NC_021898	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527327449
81	NC_021898	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527327450
82	NC_021898	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527327452
83	NC_021898	CTTTT	2	10	94193	94202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021898	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527327453
85	NC_021898	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527327453
86	NC_021898	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527327455
87	NC_021898	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527327455
88	NC_021898	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527327455
89	NC_021898	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527327455
90	NC_021898	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527327455
91	NC_021898	ACAAA	2	10	97738	97747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021898	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527327456
93	NC_021898	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527327457
94	NC_021898	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527327458
95	NC_021898	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527327460
96	NC_021898	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527327460
97	NC_021898	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527327460
98	NC_021898	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527327461
99	NC_021898	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527327461
100	NC_021898	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527327464
101	NC_021898	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527327466
102	NC_021898	GCTCT	2	10	114018	114027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021898	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527327469
104	NC_021898	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527327469
105	NC_021898	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527327469
106	NC_021898	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527327470
107	NC_021898	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527327470
108	NC_021898	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527327473
109	NC_021898	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527327476
110	NC_021898	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527327476
111	NC_021898	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527327480
112	NC_021898	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527327484
113	NC_021898	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527327484
114	NC_021898	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527327486
115	NC_021898	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527327486
116	NC_021898	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527327488
117	NC_021898	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527327489
118	NC_021898	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527327490
119	NC_021898	TTGCA	2	10	137071	137080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021898	AAGAG	2	10	138323	138332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021898	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527327496
122	NC_021898	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527327497
123	NC_021898	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527327497
124	NC_021898	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527327498
125	NC_021898	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527327499
126	NC_021898	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527327501
127	NC_021898	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527327501
128	NC_021898	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527327503
129	NC_021898	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527327504
130	NC_021898	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527327505
131	NC_021898	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527327509
132	NC_021898	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527327509
133	NC_021898	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527327512
134	NC_021898	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527327516
135	NC_021898	CAAAA	2	10	161798	161807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021898	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527327519
137	NC_021898	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527327519
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252	NC_021898	CTTGT	2	10	329953	329962	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_021898	CCTTT	2	10	330409	330418	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_021898	CTAAA	2	10	333512	333521	60 %	20 %	0 %	20 %	527327672
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256	NC_021898	TCCAT	2	10	334230	334239	20 %	40 %	0 %	40 %	527327672
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262	NC_021898	GTTAC	2	10	346132	346141	20 %	40 %	20 %	20 %	527327683
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264	NC_021898	CCTTC	2	10	349556	349565	0 %	40 %	0 %	60 %	527327684
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266	NC_021898	ATTTA	2	10	353652	353661	40 %	60 %	0 %	0 %	527327685
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