MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 2866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021898	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021898	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021898	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021898	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527327368
5	NC_021898	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
6	NC_021898	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
7	NC_021898	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527327370
8	NC_021898	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
9	NC_021898	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527327371
10	NC_021898	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527327371
11	NC_021898	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527327371
12	NC_021898	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527327371
13	NC_021898	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527327372
14	NC_021898	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527327372
15	NC_021898	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527327372
16	NC_021898	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021898	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527327373
18	NC_021898	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527327373
19	NC_021898	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021898	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527327374
21	NC_021898	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527327374
22	NC_021898	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527327375
23	NC_021898	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527327376
24	NC_021898	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527327376
25	NC_021898	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527327376
26	NC_021898	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527327376
27	NC_021898	TATT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021898	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527327377
29	NC_021898	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527327377
30	NC_021898	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527327377
31	NC_021898	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527327378
32	NC_021898	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527327378
33	NC_021898	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527327378
34	NC_021898	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527327378
35	NC_021898	AGAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021898	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527327379
37	NC_021898	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527327380
38	NC_021898	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527327380
39	NC_021898	AAGG	2	8	13441	13448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021898	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527327381
41	NC_021898	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527327381
42	NC_021898	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527327381
43	NC_021898	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527327382
44	NC_021898	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527327382
45	NC_021898	CAAA	2	8	16075	16082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021898	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527327383
47	NC_021898	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527327383
48	NC_021898	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527327383
49	NC_021898	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527327383
50	NC_021898	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527327383
51	NC_021898	TGCG	2	8	18529	18536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021898	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527327385
53	NC_021898	GCCA	2	8	21023	21030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021898	CGCT	2	8	21271	21278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021898	TTAA	2	8	21292	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021898	GTTA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021898	GATC	2	8	21384	21391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021898	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527327388
59	NC_021898	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527327388
60	NC_021898	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527327388
61	NC_021898	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527327388
62	NC_021898	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527327388
63	NC_021898	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527327388
64	NC_021898	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527327388
65	NC_021898	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527327388
66	NC_021898	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527327389
67	NC_021898	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527327389
68	NC_021898	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527327389
69	NC_021898	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527327389
70	NC_021898	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527327389
71	NC_021898	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527327390
72	NC_021898	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527327390
73	NC_021898	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527327390
74	NC_021898	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527327390
75	NC_021898	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527327391
76	NC_021898	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527327391
77	NC_021898	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021898	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527327393
79	NC_021898	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527327393
80	NC_021898	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527327393
81	NC_021898	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527327393
82	NC_021898	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527327394
83	NC_021898	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527327394
84	NC_021898	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527327394
85	NC_021898	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527327396
86	NC_021898	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527327399
87	NC_021898	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527327399
88	NC_021898	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527327400
89	NC_021898	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527327400
90	NC_021898	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527327401
91	NC_021898	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527327401
92	NC_021898	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527327401
93	NC_021898	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527327401
94	NC_021898	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527327402
95	NC_021898	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527327402
96	NC_021898	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527327402
97	NC_021898	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527327402
98	NC_021898	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527327402
99	NC_021898	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527327403
100	NC_021898	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527327403
101	NC_021898	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527327403
102	NC_021898	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527327403
103	NC_021898	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	527327405
104	NC_021898	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	527327405
105	NC_021898	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527327405
106	NC_021898	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527327407
107	NC_021898	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527327407
108	NC_021898	TGTT	2	8	43747	43754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021898	AATA	2	8	43985	43992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021898	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527327409
111	NC_021898	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527327409
112	NC_021898	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527327409
113	NC_021898	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527327410
114	NC_021898	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527327410
115	NC_021898	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527327410
116	NC_021898	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527327410
117	NC_021898	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527327410
118	NC_021898	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527327411
119	NC_021898	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527327411
120	NC_021898	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527327411
121	NC_021898	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527327411
122	NC_021898	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527327411
123	NC_021898	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527327411
124	NC_021898	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527327411
125	NC_021898	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527327411
126	NC_021898	AAGT	2	8	47906	47913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021898	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527327412
128	NC_021898	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527327412
129	NC_021898	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527327413
130	NC_021898	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527327413
131	NC_021898	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527327415
132	NC_021898	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527327415
133	NC_021898	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527327415
134	NC_021898	TATT	2	8	52172	52179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021898	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527327417
136	NC_021898	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527327417
137	NC_021898	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527327418
138	NC_021898	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527327418
139	NC_021898	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527327418
140	NC_021898	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527327418
141	NC_021898	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527327418
142	NC_021898	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527327418
143	NC_021898	GTTT	2	8	54032	54039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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