MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021898	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021898	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021898	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021898	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
5	NC_021898	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
6	NC_021898	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
7	NC_021898	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527327371
8	NC_021898	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527327372
9	NC_021898	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527327372
10	NC_021898	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
11	NC_021898	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527327372
12	NC_021898	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
13	NC_021898	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527327372
14	NC_021898	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021898	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527327375
16	NC_021898	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527327376
17	NC_021898	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527327376
18	NC_021898	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	527327376
19	NC_021898	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021898	GA	3	6	9869	9874	50 %	0 %	50 %	0 %	527327378
21	NC_021898	AG	3	6	10086	10091	50 %	0 %	50 %	0 %	527327378
22	NC_021898	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021898	AG	3	6	11312	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	527327379
24	NC_021898	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527327379
25	NC_021898	TG	3	6	12775	12780	0 %	50 %	50 %	0 %	527327380
26	NC_021898	AG	3	6	12924	12929	50 %	0 %	50 %	0 %	527327380
27	NC_021898	AG	4	8	13080	13087	50 %	0 %	50 %	0 %	527327380
28	NC_021898	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021898	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021898	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	527327381
31	NC_021898	CT	3	6	14698	14703	0 %	50 %	0 %	50 %	527327381
32	NC_021898	AG	3	6	15748	15753	50 %	0 %	50 %	0 %	527327382
33	NC_021898	TC	3	6	15788	15793	0 %	50 %	0 %	50 %	527327382
34	NC_021898	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	527327383
35	NC_021898	AG	3	6	16388	16393	50 %	0 %	50 %	0 %	527327383
36	NC_021898	GA	3	6	17172	17177	50 %	0 %	50 %	0 %	527327383
37	NC_021898	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021898	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021898	GA	3	6	17775	17780	50 %	0 %	50 %	0 %	527327384
40	NC_021898	TC	3	6	18225	18230	0 %	50 %	0 %	50 %	527327384
41	NC_021898	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021898	TC	3	6	18653	18658	0 %	50 %	0 %	50 %	527327385
43	NC_021898	GA	3	6	18668	18673	50 %	0 %	50 %	0 %	527327385
44	NC_021898	GA	3	6	18767	18772	50 %	0 %	50 %	0 %	527327385
45	NC_021898	AG	3	6	19233	19238	50 %	0 %	50 %	0 %	527327385
46	NC_021898	AG	4	8	19519	19526	50 %	0 %	50 %	0 %	527327385
47	NC_021898	GT	3	6	19782	19787	0 %	50 %	50 %	0 %	527327385
48	NC_021898	AG	3	6	20010	20015	50 %	0 %	50 %	0 %	527327386
49	NC_021898	TG	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	527327386
50	NC_021898	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	527327387
51	NC_021898	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021898	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021898	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021898	CT	4	8	21920	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	527327388
55	NC_021898	AT	3	6	22190	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	527327388
56	NC_021898	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	527327388
57	NC_021898	GA	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	527327388
58	NC_021898	GA	3	6	23925	23930	50 %	0 %	50 %	0 %	527327388
59	NC_021898	AG	3	6	24306	24311	50 %	0 %	50 %	0 %	527327388
60	NC_021898	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	527327389
61	NC_021898	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	527327389
62	NC_021898	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	527327389
63	NC_021898	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	527327389
64	NC_021898	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021898	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021898	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	527327390
67	NC_021898	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	527327390
68	NC_021898	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021898	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021898	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	527327392
71	NC_021898	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	527327392
72	NC_021898	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527327392
73	NC_021898	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527327392
74	NC_021898	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527327393
75	NC_021898	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	527327394
76	NC_021898	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527327394
77	NC_021898	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	527327394
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90	NC_021898	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021898	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021898	GA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	50 %	0 %	527327402
93	NC_021898	CT	3	6	37019	37024	0 %	50 %	0 %	50 %	527327402
94	NC_021898	AG	3	6	37530	37535	50 %	0 %	50 %	0 %	527327402
95	NC_021898	AG	3	6	38076	38081	50 %	0 %	50 %	0 %	527327402
96	NC_021898	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	527327402
97	NC_021898	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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99	NC_021898	AG	3	6	39524	39529	50 %	0 %	50 %	0 %	527327403
100	NC_021898	AG	3	6	39624	39629	50 %	0 %	50 %	0 %	527327403
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105	NC_021898	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	527327404
106	NC_021898	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	527327404
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108	NC_021898	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	527327404
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110	NC_021898	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	527327405
111	NC_021898	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	527327405
112	NC_021898	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021898	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021898	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021898	TG	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	527327406
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118	NC_021898	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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123	NC_021898	AG	3	6	45514	45519	50 %	0 %	50 %	0 %	527327410
124	NC_021898	AG	4	8	45954	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	527327411
125	NC_021898	CT	3	6	46145	46150	0 %	50 %	0 %	50 %	527327411
126	NC_021898	TG	3	6	46346	46351	0 %	50 %	50 %	0 %	527327411
127	NC_021898	AG	3	6	46399	46404	50 %	0 %	50 %	0 %	527327411
128	NC_021898	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021898	AG	3	6	49326	49331	50 %	0 %	50 %	0 %	527327413
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131	NC_021898	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021898	TC	3	6	52896	52901	0 %	50 %	0 %	50 %	527327417
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141	NC_021898	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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