MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/3

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021897	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527326450
2	NC_021897	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527326451
3	NC_021897	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527326451
4	NC_021897	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527326451
5	NC_021897	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527326451
6	NC_021897	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527326452
7	NC_021897	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527326454
8	NC_021897	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527326455
9	NC_021897	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527326456
10	NC_021897	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527326457
11	NC_021897	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527326457
12	NC_021897	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527326458
13	NC_021897	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527326459
14	NC_021897	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527326459
15	NC_021897	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527326461
16	NC_021897	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527326462
17	NC_021897	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527326462
18	NC_021897	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527326462
19	NC_021897	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527326465
20	NC_021897	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527326467
21	NC_021897	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527326467
22	NC_021897	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527326467
23	NC_021897	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527326468
24	NC_021897	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527326469
25	NC_021897	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527326469
26	NC_021897	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527326471
27	NC_021897	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527326471
28	NC_021897	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527326472
29	NC_021897	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527326473
30	NC_021897	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527326474
31	NC_021897	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527326480
32	NC_021897	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527326480
33	NC_021897	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527326481
34	NC_021897	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527326482
35	NC_021897	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527326484
36	NC_021897	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527326484
37	NC_021897	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527326488
38	NC_021897	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527326490
39	NC_021897	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527326490
40	NC_021897	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527326493
41	NC_021897	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527326494
42	NC_021897	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527326497
43	NC_021897	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527326498
44	NC_021897	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527326499
45	NC_021897	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527326501
46	NC_021897	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527326504
47	NC_021897	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527326505
48	NC_021897	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527326505
49	NC_021897	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527326507
50	NC_021897	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527326507
51	NC_021897	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527326509
52	NC_021897	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527326510
53	NC_021897	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527326510
54	NC_021897	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527326510
55	NC_021897	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527326510
56	NC_021897	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527326510
57	NC_021897	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527326512
58	NC_021897	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527326512
59	NC_021897	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527326513
60	NC_021897	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527326514
61	NC_021897	TGTCT	2	10	79945	79954	0 %	60 %	20 %	20 %	527326518
62	NC_021897	TTACT	2	10	80452	80461	20 %	60 %	0 %	20 %	527326518
63	NC_021897	AGAAA	2	10	81842	81851	80 %	0 %	20 %	0 %	527326520
64	NC_021897	GGAAG	2	10	82355	82364	40 %	0 %	60 %	0 %	527326520
65	NC_021897	GATCC	2	10	85906	85915	20 %	20 %	20 %	40 %	527326523
66	NC_021897	AGAGC	2	10	87241	87250	40 %	0 %	40 %	20 %	527326524
67	NC_021897	TTTTC	2	10	90973	90982	0 %	80 %	0 %	20 %	527326527
68	NC_021897	GGATG	2	10	91233	91242	20 %	20 %	60 %	0 %	527326528
69	NC_021897	CAACA	2	10	92772	92781	60 %	0 %	0 %	40 %	527326529
70	NC_021897	ACAGC	2	10	93817	93826	40 %	0 %	20 %	40 %	527326531
71	NC_021897	GGAAC	2	10	94529	94538	40 %	0 %	40 %	20 %	527326532
72	NC_021897	GGATT	2	10	95429	95438	20 %	40 %	40 %	0 %	527326532
73	NC_021897	CAATC	2	10	96531	96540	40 %	20 %	0 %	40 %	527326534
74	NC_021897	TTTGC	2	10	96665	96674	0 %	60 %	20 %	20 %	527326534
75	NC_021897	ATTCA	2	10	96929	96938	40 %	40 %	0 %	20 %	527326534
76	NC_021897	GATCC	2	10	97188	97197	20 %	20 %	20 %	40 %	527326534
77	NC_021897	GTTTT	2	10	97609	97618	0 %	80 %	20 %	0 %	527326534
78	NC_021897	AAGCT	2	10	98813	98822	40 %	20 %	20 %	20 %	527326535
79	NC_021897	AGGGG	2	10	99172	99181	20 %	0 %	80 %	0 %	527326535
80	NC_021897	ATAGC	2	10	99871	99880	40 %	20 %	20 %	20 %	527326536
81	NC_021897	TTCCC	2	10	100475	100484	0 %	40 %	0 %	60 %	527326537
82	NC_021897	AGCGA	2	10	102799	102808	40 %	0 %	40 %	20 %	527326539
83	NC_021897	TTTCT	2	10	103157	103166	0 %	80 %	0 %	20 %	527326539
84	NC_021897	ATCAT	2	10	104363	104372	40 %	40 %	0 %	20 %	527326540
85	NC_021897	GGCAT	2	10	105071	105080	20 %	20 %	40 %	20 %	527326540
86	NC_021897	AAAGC	2	10	108797	108806	60 %	0 %	20 %	20 %	527326543
87	NC_021897	GCATT	2	10	109957	109966	20 %	40 %	20 %	20 %	527326545
88	NC_021897	TGTTT	2	10	114646	114655	0 %	80 %	20 %	0 %	527326548
89	NC_021897	CATGT	2	10	115024	115033	20 %	40 %	20 %	20 %	527326548
90	NC_021897	TATCG	2	10	115728	115737	20 %	40 %	20 %	20 %	527326548
91	NC_021897	TTTCT	2	10	116244	116253	0 %	80 %	0 %	20 %	527326549
92	NC_021897	AAAGA	2	10	118489	118498	80 %	0 %	20 %	0 %	527326551
93	NC_021897	TACAA	2	10	126227	126236	60 %	20 %	0 %	20 %	527326557
94	NC_021897	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	527326560
95	NC_021897	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	527326560
96	NC_021897	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	527326562
97	NC_021897	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	527326562
98	NC_021897	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	527326565
99	NC_021897	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	527326566
100	NC_021897	TCCAG	2	10	139918	139927	20 %	20 %	20 %	40 %	527326572
101	NC_021897	GTACA	2	10	140649	140658	40 %	20 %	20 %	20 %	527326573
102	NC_021897	TAGAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	527326573
103	NC_021897	AAAAG	2	10	141434	141443	80 %	0 %	20 %	0 %	527326574
104	NC_021897	AAAAC	2	10	141914	141923	80 %	0 %	0 %	20 %	527326575
105	NC_021897	TGCTA	2	10	143000	143009	20 %	40 %	20 %	20 %	527326577
106	NC_021897	GGAGC	2	10	143047	143056	20 %	0 %	60 %	20 %	527326577
107	NC_021897	CTGGG	2	10	144461	144470	0 %	20 %	60 %	20 %	527326579
108	NC_021897	GTTTT	2	10	145208	145217	0 %	80 %	20 %	0 %	527326580
109	NC_021897	GAACC	2	10	148942	148951	40 %	0 %	20 %	40 %	527326581
110	NC_021897	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	527326587
111	NC_021897	AGGAA	2	10	159673	159682	60 %	0 %	40 %	0 %	527326591
112	NC_021897	AGAGA	2	10	162913	162922	60 %	0 %	40 %	0 %	527326594
113	NC_021897	AGCAA	2	10	163348	163357	60 %	0 %	20 %	20 %	527326594
114	NC_021897	TATGA	2	10	163772	163781	40 %	40 %	20 %	0 %	527326595
115	NC_021897	CAAAA	2	10	166851	166860	80 %	0 %	0 %	20 %	527326596
116	NC_021897	AAGAG	2	10	167684	167693	60 %	0 %	40 %	0 %	527326596
117	NC_021897	GATTG	2	10	168029	168038	20 %	40 %	40 %	0 %	527326596
118	NC_021897	GTTTT	2	10	174510	174519	0 %	80 %	20 %	0 %	527326600
119	NC_021897	TATTG	2	10	174533	174542	20 %	60 %	20 %	0 %	527326600
120	NC_021897	CAGCA	2	10	174892	174901	40 %	0 %	20 %	40 %	527326600
121	NC_021897	TAGGA	2	10	175197	175206	40 %	20 %	40 %	0 %	527326601
122	NC_021897	TGATT	2	10	177124	177133	20 %	60 %	20 %	0 %	527326602
123	NC_021897	TCAAT	2	10	177765	177774	40 %	40 %	0 %	20 %	527326602
124	NC_021897	TTTTC	2	10	177804	177813	0 %	80 %	0 %	20 %	527326602
125	NC_021897	GGAAT	2	10	179370	179379	40 %	20 %	40 %	0 %	527326603
126	NC_021897	TTGAA	2	10	181290	181299	40 %	40 %	20 %	0 %	527326604
127	NC_021897	AGGGG	2	10	182301	182310	20 %	0 %	80 %	0 %	527326604
128	NC_021897	TTGAG	2	10	182864	182873	20 %	40 %	40 %	0 %	527326605
129	NC_021897	ATAGA	2	10	182886	182895	60 %	20 %	20 %	0 %	527326605
130	NC_021897	ACGAT	2	10	185046	185055	40 %	20 %	20 %	20 %	527326606
131	NC_021897	GGATC	2	10	188154	188163	20 %	20 %	40 %	20 %	527326608
132	NC_021897	CAGAT	2	10	188269	188278	40 %	20 %	20 %	20 %	527326608
133	NC_021897	TTGTA	2	10	194834	194843	20 %	60 %	20 %	0 %	527326609
134	NC_021897	AAAAG	2	10	195538	195547	80 %	0 %	20 %	0 %	527326610
135	NC_021897	TATCA	2	10	195611	195620	40 %	40 %	0 %	20 %	527326610
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