MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021896	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527325523
2	NC_021896	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527325524
3	NC_021896	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527325524
4	NC_021896	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527325524
5	NC_021896	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527325524
6	NC_021896	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527325525
7	NC_021896	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021896	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527325527
9	NC_021896	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527325528
10	NC_021896	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527325529
11	NC_021896	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527325530
12	NC_021896	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527325530
13	NC_021896	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527325531
14	NC_021896	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527325532
15	NC_021896	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527325532
16	NC_021896	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527325534
17	NC_021896	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527325535
18	NC_021896	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527325535
19	NC_021896	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527325535
20	NC_021896	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527325538
21	NC_021896	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527325539
22	NC_021896	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527325539
23	NC_021896	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527325539
24	NC_021896	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527325540
25	NC_021896	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527325541
26	NC_021896	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527325541
27	NC_021896	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527325543
28	NC_021896	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527325543
29	NC_021896	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527325544
30	NC_021896	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527325545
31	NC_021896	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527325546
32	NC_021896	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021896	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527325552
34	NC_021896	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527325552
35	NC_021896	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527325553
36	NC_021896	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527325554
37	NC_021896	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527325556
38	NC_021896	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527325556
39	NC_021896	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021896	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527325560
41	NC_021896	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527325562
42	NC_021896	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527325562
43	NC_021896	GAAGA	2	10	47939	47948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021896	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527325565
45	NC_021896	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527325566
46	NC_021896	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527325569
47	NC_021896	AATTT	2	10	54048	54057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021896	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527325570
49	NC_021896	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527325571
50	NC_021896	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527325573
51	NC_021896	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527325576
52	NC_021896	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527325577
53	NC_021896	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527325577
54	NC_021896	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527325579
55	NC_021896	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527325579
56	NC_021896	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527325581
57	NC_021896	AAAAG	2	10	68992	69001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021896	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527325582
59	NC_021896	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527325582
60	NC_021896	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527325582
61	NC_021896	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527325582
62	NC_021896	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527325582
63	NC_021896	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021896	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527325584
65	NC_021896	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527325584
66	NC_021896	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527325585
67	NC_021896	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527325586
68	NC_021896	AAAAG	2	10	76685	76694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021896	ATCAA	2	10	78383	78392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021896	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527325590
71	NC_021896	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527325590
72	NC_021896	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527325592
73	NC_021896	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527325592
74	NC_021896	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527325594
75	NC_021896	TTTGT	2	10	85122	85131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021896	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527325595
77	NC_021896	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527325596
78	NC_021896	AATAA	2	10	88121	88130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021896	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527325599
80	NC_021896	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527325600
81	NC_021896	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527325601
82	NC_021896	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527325603
83	NC_021896	CTTTT	2	10	94193	94202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021896	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527325604
85	NC_021896	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527325604
86	NC_021896	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527325606
87	NC_021896	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527325606
88	NC_021896	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527325606
89	NC_021896	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527325606
90	NC_021896	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527325606
91	NC_021896	ACAAA	2	10	97738	97747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021896	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527325607
93	NC_021896	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527325608
94	NC_021896	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527325609
95	NC_021896	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527325611
96	NC_021896	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527325611
97	NC_021896	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527325611
98	NC_021896	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527325612
99	NC_021896	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527325612
100	NC_021896	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527325615
101	NC_021896	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527325617
102	NC_021896	GCTCT	2	10	114018	114027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021896	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527325620
104	NC_021896	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527325620
105	NC_021896	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527325620
106	NC_021896	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527325621
107	NC_021896	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527325621
108	NC_021896	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527325624
109	NC_021896	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527325627
110	NC_021896	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527325627
111	NC_021896	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527325631
112	NC_021896	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527325634
113	NC_021896	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527325634
114	NC_021896	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527325636
115	NC_021896	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527325636
116	NC_021896	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527325638
117	NC_021896	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527325639
118	NC_021896	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527325640
119	NC_021896	TTGCA	2	10	137071	137080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021896	AAGAG	2	10	138323	138332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021896	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527325646
122	NC_021896	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527325647
123	NC_021896	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527325647
124	NC_021896	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527325648
125	NC_021896	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527325649
126	NC_021896	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527325651
127	NC_021896	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527325651
128	NC_021896	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527325653
129	NC_021896	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527325654
130	NC_021896	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527325655
131	NC_021896	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527325659
132	NC_021896	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527325659
133	NC_021896	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527325662
134	NC_021896	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527325666
135	NC_021896	CAAAA	2	10	161798	161807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021896	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527325669
137	NC_021896	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527325669
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254	NC_021896	CTAAA	2	10	333514	333523	60 %	20 %	0 %	20 %	527325823
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262	NC_021896	ATCTC	2	10	347351	347360	20 %	40 %	0 %	40 %	527325836
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266	NC_021896	TAGCA	2	10	353899	353908	40 %	20 %	20 %	20 %	527325837
267	NC_021896	AAGGC	2	10	358165	358174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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