MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 12829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021896	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325521
2	NC_021896	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325521
3	NC_021896	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325521
4	NC_021896	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325521
5	NC_021896	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325521
6	NC_021896	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325521
7	NC_021896	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325521
8	NC_021896	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325521
9	NC_021896	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325521
10	NC_021896	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325521
11	NC_021896	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
12	NC_021896	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325522
13	NC_021896	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325522
14	NC_021896	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325522
15	NC_021896	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
16	NC_021896	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
17	NC_021896	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325522
18	NC_021896	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325523
19	NC_021896	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
20	NC_021896	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325523
21	NC_021896	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325523
22	NC_021896	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
23	NC_021896	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325523
24	NC_021896	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
25	NC_021896	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325523
26	NC_021896	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
27	NC_021896	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325523
28	NC_021896	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325523
29	NC_021896	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
30	NC_021896	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325523
31	NC_021896	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325523
32	NC_021896	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
33	NC_021896	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
34	NC_021896	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
35	NC_021896	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325523
36	NC_021896	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
37	NC_021896	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
38	NC_021896	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325523
39	NC_021896	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
40	NC_021896	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325524
41	NC_021896	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
42	NC_021896	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
43	NC_021896	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
44	NC_021896	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
45	NC_021896	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325524
46	NC_021896	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
47	NC_021896	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
48	NC_021896	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
49	NC_021896	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325524
50	NC_021896	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325524
51	NC_021896	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
52	NC_021896	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
53	NC_021896	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325524
54	NC_021896	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325524
55	NC_021896	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325524
56	NC_021896	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325525
57	NC_021896	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325525
58	NC_021896	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
59	NC_021896	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325525
60	NC_021896	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325525
61	NC_021896	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
62	NC_021896	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
63	NC_021896	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
64	NC_021896	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
65	NC_021896	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325525
66	NC_021896	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
67	NC_021896	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325525
68	NC_021896	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325525
69	NC_021896	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325525
70	NC_021896	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325525
71	NC_021896	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
72	NC_021896	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325525
73	NC_021896	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325526
74	NC_021896	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325526
75	NC_021896	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325526
76	NC_021896	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325526
77	NC_021896	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325526
78	NC_021896	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325527
79	NC_021896	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325527
80	NC_021896	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325527
81	NC_021896	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325527
82	NC_021896	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325527
83	NC_021896	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325528
84	NC_021896	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325528
85	NC_021896	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325528
86	NC_021896	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325528
87	NC_021896	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325528
88	NC_021896	AGG	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325528
89	NC_021896	GAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325528
90	NC_021896	CAG	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325528
91	NC_021896	TGT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325528
92	NC_021896	GAG	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325528
93	NC_021896	TAC	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325528
94	NC_021896	GTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325528
95	NC_021896	AAG	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325528
96	NC_021896	GAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325528
97	NC_021896	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325529
98	NC_021896	AGA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325529
99	NC_021896	TGC	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325529
100	NC_021896	GAA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325529
101	NC_021896	TCG	2	6	9752	9757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325529
102	NC_021896	TGG	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325529
103	NC_021896	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325530
104	NC_021896	AGC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325530
105	NC_021896	CTT	2	6	10000	10005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325530
106	NC_021896	ATG	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325530
107	NC_021896	CGT	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325530
108	NC_021896	GAC	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325530
109	NC_021896	GGT	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325530
110	NC_021896	GAA	2	6	10491	10496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325530
111	NC_021896	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325530
112	NC_021896	GGA	2	6	10575	10580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325530
113	NC_021896	CGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325530
114	NC_021896	CTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325530
115	NC_021896	TTG	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325530
116	NC_021896	CTT	2	6	10792	10797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325530
117	NC_021896	ATC	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325530
118	NC_021896	TGT	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325530
119	NC_021896	AGA	2	6	11014	11019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325530
120	NC_021896	AGG	2	6	11053	11058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325530
121	NC_021896	GAT	2	6	11113	11118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325530
122	NC_021896	CGA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325530
123	NC_021896	AAT	2	6	11332	11337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325531
124	NC_021896	AGG	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325531
125	NC_021896	ATA	3	9	11585	11593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325531
126	NC_021896	TAT	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325531
127	NC_021896	ACA	2	6	11615	11620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325531
128	NC_021896	TAG	2	6	11714	11719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325531
129	NC_021896	TAC	2	6	11908	11913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325531
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142	NC_021896	CAT	2	6	12848	12853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325532
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