MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021896	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021896	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021896	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021896	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021896	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021896	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021896	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021896	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021896	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021896	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021896	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021896	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021896	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021896	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021896	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021896	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021896	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021896	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021896	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021896	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021896	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021896	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021896	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021896	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021896	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021896	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021896	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021896	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021896	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021896	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021896	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021896	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021896	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021896	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021896	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021896	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021896	TA	3	6	85228	85233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021896	TC	3	6	90449	90454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021896	GA	3	6	90581	90586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021896	CT	3	6	92931	92936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021896	GA	3	6	93459	93464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021896	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021896	TC	3	6	99952	99957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021896	AT	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021896	GC	3	6	102109	102114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021896	TA	3	6	106679	106684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021896	TG	3	6	115933	115938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021896	AG	4	8	118521	118528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021896	GA	3	6	120343	120348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021896	TA	3	6	122651	122656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021896	GT	3	6	123641	123646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021896	CT	3	6	128177	128182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021896	TC	3	6	130499	130504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021896	TG	3	6	133407	133412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021896	TG	3	6	137015	137020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021896	AG	3	6	138260	138265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021896	AT	3	6	142555	142560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021896	AG	3	6	157362	157367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021896	TC	3	6	171834	171839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021896	AG	3	6	171966	171971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021896	CT	3	6	171984	171989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021896	TG	3	6	178473	178478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021896	CT	3	6	178612	178617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021896	GA	3	6	179166	179171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021896	CT	3	6	179492	179497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021896	TA	3	6	183671	183676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021896	GA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021896	GA	3	6	184526	184531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021896	GA	3	6	184558	184563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021896	AG	3	6	188612	188617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021896	TC	3	6	188772	188777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021896	AT	3	6	189113	189118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021896	AG	3	6	192892	192897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021896	TC	3	6	195884	195889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021896	AG	3	6	197716	197721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021896	CT	3	6	197728	197733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021896	CT	3	6	199642	199647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021896	GA	4	8	202701	202708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021896	CT	4	8	202749	202756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021896	TA	3	6	204330	204335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021896	AG	3	6	214021	214026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021896	TA	3	6	215575	215580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021896	CT	3	6	217218	217223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021896	TC	3	6	220219	220224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021896	AG	3	6	220250	220255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021896	TC	3	6	234449	234454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021896	AG	3	6	234475	234480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021896	AC	3	6	239398	239403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021896	GA	3	6	246484	246489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021896	TG	3	6	246594	246599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021896	AG	3	6	247394	247399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021896	GA	3	6	248273	248278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021896	AG	3	6	248398	248403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021896	TA	3	6	250219	250224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021896	AG	3	6	252510	252515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021896	TC	3	6	252536	252541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021896	TA	3	6	260377	260382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021896	AG	3	6	260457	260462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021896	CA	3	6	262184	262189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021896	TC	3	6	264083	264088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021896	TA	3	6	269634	269639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021896	AT	4	8	280194	280201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021896	CT	3	6	281046	281051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021896	TC	4	8	281137	281144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021896	TC	3	6	282828	282833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021896	TC	3	6	282885	282890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021896	CT	3	6	283358	283363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021896	AT	3	6	295372	295377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021896	CA	3	6	297701	297706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021896	GA	3	6	302432	302437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021896	AG	3	6	311650	311655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021896	CT	3	6	343610	343615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021896	CT	3	6	346681	346686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021896	TC	3	6	350907	350912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021896	TC	3	6	354737	354742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021896	CT	3	6	354823	354828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021896	AC	3	6	358156	358161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021896	GA	3	6	360066	360071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021896	TC	3	6	360144	360149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021896	TA	3	6	360345	360350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021896	CT	4	8	377486	377493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021896	CG	3	6	387325	387330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021896	CA	3	6	388375	388380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021896	TC	3	6	390922	390927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021896	CT	3	6	391412	391417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021896	GA	3	6	391666	391671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021896	CT	3	6	406759	406764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021896	CT	3	6	425494	425499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021896	CT	3	6	426517	426522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021896	AG	3	6	426863	426868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021896	GA	3	6	428558	428563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021896	AC	3	6	432556	432561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021896	CT	3	6	436827	436832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021896	AC	3	6	436865	436870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021896	CA	3	6	439334	439339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021896	CT	3	6	440738	440743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021896	CT	3	6	450020	450025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021896	AG	3	6	456161	456166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021896	TC	3	6	462699	462704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021896	AT	3	6	462768	462773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021896	GA	4	8	464142	464149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021896	TA	3	6	464185	464190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021896	TC	3	6	476016	476021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021896	AC	3	6	481547	481552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021896	GA	4	8	481592	481599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021896	CA	3	6	481629	481634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021896	TC	3	6	481670	481675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021896	AC	3	6	486105	486110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021896	AG	3	6	486267	486272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021896	CT	3	6	486286	486291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021896	CT	3	6	489565	489570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021896	CT	3	6	490083	490088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021896	TG	3	6	490116	490121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021896	TA	3	6	490229	490234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.