MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021895	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021895	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021895	GAAAAG	2	12	56366	56377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021895	AGTTGT	2	12	57562	57573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021895	CTTGTT	2	12	58619	58630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021895	AAAAAT	2	12	60925	60936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021895	ATCTAG	2	12	76636	76647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021895	TTTTAG	2	12	115917	115928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021895	TAAAAA	2	12	120589	120600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021895	AGAAAA	2	12	182658	182669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021895	GGATAT	2	12	192128	192139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021895	GAATGC	2	12	193656	193667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021895	TATGAA	2	12	198169	198180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021895	TTTTAC	2	12	224491	224502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021895	TTTTTA	2	12	259023	259034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021895	AGGAGA	2	12	274123	274134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021895	ATATTA	2	12	283019	283030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021895	AAAAAG	2	12	327192	327203	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021895	AGAATA	2	12	364684	364695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021895	TTTTAA	2	12	412824	412835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021895	ACATCA	2	12	430128	430139	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021895	TAACTA	2	12	506396	506407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021895	AAGAAA	2	12	506409	506420	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021895	AGAATA	2	12	512383	512394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021895	AACTAA	2	12	518056	518067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021895	TCCCTC	2	12	551946	551957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021895	AAAAAT	2	12	569918	569929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021895	TAGGGG	2	12	609071	609082	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021895	TCTTTT	2	12	621056	621067	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021895	TTATTT	2	12	652269	652280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021895	TATTTT	2	12	758208	758219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021895	TTTTCT	2	12	808108	808119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021895	ATTTTT	2	12	811887	811898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021895	TTTTTA	2	12	838366	838377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021895	TAAGGA	2	12	859362	859373	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021895	CCGGAG	2	12	860280	860291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021895	CCTCTA	2	12	873425	873436	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021895	TAAGGA	2	12	881406	881417	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021895	CCGGAG	2	12	882324	882335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021895	GACGGC	2	12	924743	924754	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021895	AAACAA	2	12	926431	926442	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021895	AATTTT	2	12	1045435	1045446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021895	TAAAAT	2	12	1045447	1045458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.