MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 2498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021895	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527324596
2	NC_021895	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527324597
3	NC_021895	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527324597
4	NC_021895	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527324598
5	NC_021895	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527324598
6	NC_021895	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527324599
7	NC_021895	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527324599
8	NC_021895	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527324599
9	NC_021895	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527324599
10	NC_021895	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527324600
11	NC_021895	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527324600
12	NC_021895	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527324600
13	NC_021895	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527324601
14	NC_021895	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527324601
15	NC_021895	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527324602
16	NC_021895	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527324603
17	NC_021895	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527324603
18	NC_021895	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527324603
19	NC_021895	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527324603
20	NC_021895	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527324604
21	NC_021895	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527324604
22	NC_021895	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527324604
23	NC_021895	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527324605
24	NC_021895	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527324605
25	NC_021895	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527324605
26	NC_021895	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527324605
27	NC_021895	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527324606
28	NC_021895	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527324607
29	NC_021895	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527324607
30	NC_021895	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527324608
31	NC_021895	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527324608
32	NC_021895	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527324608
33	NC_021895	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527324609
34	NC_021895	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527324609
35	NC_021895	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527324610
36	NC_021895	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527324610
37	NC_021895	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527324610
38	NC_021895	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527324610
39	NC_021895	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527324610
40	NC_021895	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527324612
41	NC_021895	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527324615
42	NC_021895	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527324615
43	NC_021895	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527324615
44	NC_021895	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527324615
45	NC_021895	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527324615
46	NC_021895	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527324615
47	NC_021895	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527324615
48	NC_021895	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527324615
49	NC_021895	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527324616
50	NC_021895	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527324616
51	NC_021895	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527324616
52	NC_021895	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527324616
53	NC_021895	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527324616
54	NC_021895	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527324617
55	NC_021895	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527324617
56	NC_021895	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527324617
57	NC_021895	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527324617
58	NC_021895	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527324618
59	NC_021895	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527324618
60	NC_021895	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527324620
61	NC_021895	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527324620
62	NC_021895	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527324620
63	NC_021895	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527324620
64	NC_021895	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527324621
65	NC_021895	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527324621
66	NC_021895	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527324621
67	NC_021895	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527324623
68	NC_021895	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527324626
69	NC_021895	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527324626
70	NC_021895	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527324627
71	NC_021895	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527324627
72	NC_021895	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527324628
73	NC_021895	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527324628
74	NC_021895	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527324628
75	NC_021895	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527324628
76	NC_021895	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527324629
77	NC_021895	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527324629
78	NC_021895	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527324629
79	NC_021895	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527324629
80	NC_021895	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527324629
81	NC_021895	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527324630
82	NC_021895	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527324630
83	NC_021895	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527324630
84	NC_021895	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527324630
85	NC_021895	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	527324632
86	NC_021895	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	527324632
87	NC_021895	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527324632
88	NC_021895	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527324634
89	NC_021895	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527324634
90	NC_021895	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527324636
91	NC_021895	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527324636
92	NC_021895	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527324636
93	NC_021895	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527324637
94	NC_021895	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527324637
95	NC_021895	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527324637
96	NC_021895	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527324637
97	NC_021895	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527324637
98	NC_021895	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527324638
99	NC_021895	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527324638
100	NC_021895	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527324638
101	NC_021895	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527324638
102	NC_021895	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527324638
103	NC_021895	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527324638
104	NC_021895	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527324638
105	NC_021895	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527324638
106	NC_021895	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527324639
107	NC_021895	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527324639
108	NC_021895	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527324640
109	NC_021895	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527324640
110	NC_021895	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527324642
111	NC_021895	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527324642
112	NC_021895	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527324642
113	NC_021895	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527324644
114	NC_021895	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527324644
115	NC_021895	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527324645
116	NC_021895	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527324645
117	NC_021895	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527324645
118	NC_021895	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527324645
119	NC_021895	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527324645
120	NC_021895	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527324645
121	NC_021895	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527324646
122	NC_021895	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527324646
123	NC_021895	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527324646
124	NC_021895	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527324646
125	NC_021895	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527324646
126	NC_021895	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527324646
127	NC_021895	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527324647
128	NC_021895	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527324647
129	NC_021895	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527324647
130	NC_021895	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527324648
131	NC_021895	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527324648
132	NC_021895	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527324649
133	NC_021895	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527324649
134	NC_021895	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527324649
135	NC_021895	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527324649
136	NC_021895	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527324649
137	NC_021895	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527324649
138	NC_021895	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527324649
139	NC_021895	CTTT	2	8	60488	60495	0 %	75 %	0 %	25 %	527324650
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