MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii DC

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021894	TTTA	2	8	9213	9220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021894	TTAA	2	8	14102	14109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021894	TAAA	3	12	14164	14175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021894	TCGT	2	8	37323	37330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021894	TAGG	2	8	37334	37341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021894	ATGA	2	8	42595	42602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021894	TAAT	2	8	49779	49786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021894	ATTT	2	8	55448	55455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021894	TTAA	2	8	55487	55494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021894	GCAA	2	8	60355	60362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021894	TTAG	2	8	64153	64160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021894	TAAT	2	8	64228	64235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021894	GTAG	2	8	75612	75619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021894	TTTA	2	8	75661	75668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021894	ATTT	2	8	79909	79916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021894	CTAT	2	8	80030	80037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021894	TAAT	2	8	103855	103862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021894	ATTT	2	8	121057	121064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021894	AAAT	2	8	121632	121639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021894	GTAC	2	8	122228	122235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021894	TAAT	2	8	122292	122299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021894	ATTT	2	8	122581	122588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021894	CTTT	2	8	122714	122721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021894	GTTA	2	8	123462	123469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021894	TCGC	2	8	123521	123528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021894	TAAT	2	8	123608	123615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021894	AATT	2	8	123731	123738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021894	CCTT	2	8	124968	124975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021894	TAAA	2	8	131910	131917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021894	ATAA	2	8	131929	131936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021894	ATTG	2	8	172349	172356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021894	TTCT	2	8	172410	172417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.