MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021893	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021893	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021893	GAAAAG	2	12	56366	56377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021893	AGTTGT	2	12	57562	57573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021893	CTTGTT	2	12	58619	58630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021893	AAAAAT	2	12	60925	60936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021893	ATCTAG	2	12	76636	76647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021893	TTTTAG	2	12	115917	115928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021893	TAAAAA	2	12	120589	120600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021893	AGAAAA	2	12	182796	182807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021893	ATTTGC	2	12	188708	188719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021893	TATGAA	3	18	191730	191747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021893	TTTTAC	2	12	217052	217063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021893	TTTTTA	2	12	251584	251595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021893	AGGAGA	2	12	266684	266695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021893	ATATTA	2	12	275580	275591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021893	AAAAAG	2	12	319754	319765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021893	AGAATA	2	12	357244	357255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021893	TTTTAA	2	12	405404	405415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021893	ACATCA	2	12	422708	422719	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021893	TAACTA	2	12	498936	498947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021893	AAGAAA	2	12	498949	498960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021893	AGAATA	2	12	504924	504935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021893	AACTAA	2	12	510656	510667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021893	TCCCTC	2	12	544680	544691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021893	AAAAAT	2	12	562650	562661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021893	TAGGGG	2	12	601818	601829	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021893	TCTTTT	2	12	613813	613824	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021893	TCTGCA	2	12	741482	741493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021893	TATTTT	2	12	750959	750970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021893	GAGAAA	2	12	798432	798443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021893	TTTTCT	2	12	800890	800901	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021893	ATTTTT	2	12	804669	804680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021893	TTTTTA	2	12	831149	831160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021893	TAAGGA	2	12	852145	852156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021893	CCGGAG	2	12	853063	853074	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021893	CCTCTA	2	12	866208	866219	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021893	TAAGGA	2	12	874189	874200	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021893	CCGGAG	2	12	875107	875118	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021893	GACGGC	2	12	917526	917537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021893	AAACAA	2	12	919214	919225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021893	AATTTT	2	12	1038218	1038229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021893	TAAAAT	2	12	1038230	1038241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.