MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021893	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527323462
2	NC_021893	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527323463
3	NC_021893	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527323463
4	NC_021893	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527323463
5	NC_021893	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527323463
6	NC_021893	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527323464
7	NC_021893	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527323467
8	NC_021893	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527323468
9	NC_021893	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527323469
10	NC_021893	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527323470
11	NC_021893	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527323470
12	NC_021893	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527323471
13	NC_021893	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527323472
14	NC_021893	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527323472
15	NC_021893	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527323474
16	NC_021893	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527323475
17	NC_021893	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527323475
18	NC_021893	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527323475
19	NC_021893	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527323478
20	NC_021893	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527323480
21	NC_021893	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527323480
22	NC_021893	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527323480
23	NC_021893	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527323481
24	NC_021893	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527323482
25	NC_021893	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527323482
26	NC_021893	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527323484
27	NC_021893	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527323484
28	NC_021893	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527323485
29	NC_021893	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527323486
30	NC_021893	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527323487
31	NC_021893	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527323493
32	NC_021893	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527323493
33	NC_021893	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527323494
34	NC_021893	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527323495
35	NC_021893	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527323497
36	NC_021893	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527323497
37	NC_021893	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527323501
38	NC_021893	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527323503
39	NC_021893	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527323503
40	NC_021893	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527323506
41	NC_021893	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527323507
42	NC_021893	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527323510
43	NC_021893	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527323511
44	NC_021893	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527323512
45	NC_021893	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527323514
46	NC_021893	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527323517
47	NC_021893	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527323518
48	NC_021893	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527323518
49	NC_021893	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527323520
50	NC_021893	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527323520
51	NC_021893	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527323522
52	NC_021893	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527323523
53	NC_021893	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527323523
54	NC_021893	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527323523
55	NC_021893	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527323523
56	NC_021893	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527323523
57	NC_021893	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527323525
58	NC_021893	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527323525
59	NC_021893	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527323526
60	NC_021893	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527323527
61	NC_021893	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527323531
62	NC_021893	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527323531
63	NC_021893	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527323533
64	NC_021893	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527323533
65	NC_021893	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527323535
66	NC_021893	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527323536
67	NC_021893	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527323537
68	NC_021893	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527323540
69	NC_021893	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527323541
70	NC_021893	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527323542
71	NC_021893	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527323544
72	NC_021893	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527323545
73	NC_021893	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527323545
74	NC_021893	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527323547
75	NC_021893	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527323547
76	NC_021893	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527323547
77	NC_021893	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527323547
78	NC_021893	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527323547
79	NC_021893	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527323548
80	NC_021893	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527323549
81	NC_021893	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527323550
82	NC_021893	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527323552
83	NC_021893	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527323552
84	NC_021893	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527323552
85	NC_021893	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527323553
86	NC_021893	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527323553
87	NC_021893	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527323556
88	NC_021893	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527323558
89	NC_021893	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527323561
90	NC_021893	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527323561
91	NC_021893	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527323561
92	NC_021893	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527323562
93	NC_021893	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527323562
94	NC_021893	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527323565
95	NC_021893	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527323568
96	NC_021893	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527323568
97	NC_021893	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527323572
98	NC_021893	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527323575
99	NC_021893	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527323575
100	NC_021893	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527323577
101	NC_021893	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527323577
102	NC_021893	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527323579
103	NC_021893	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527323580
104	NC_021893	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527323581
105	NC_021893	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527323587
106	NC_021893	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527323588
107	NC_021893	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527323588
108	NC_021893	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527323589
109	NC_021893	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527323590
110	NC_021893	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527323592
111	NC_021893	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527323592
112	NC_021893	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527323594
113	NC_021893	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527323595
114	NC_021893	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527323596
115	NC_021893	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527323600
116	NC_021893	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527323600
117	NC_021893	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527323603
118	NC_021893	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527323607
119	NC_021893	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527323610
120	NC_021893	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527323610
121	NC_021893	TATGA	2	10	163885	163894	40 %	40 %	20 %	0 %	527323611
122	NC_021893	CAAAA	2	10	166964	166973	80 %	0 %	0 %	20 %	527323612
123	NC_021893	AAGAG	2	10	167797	167806	60 %	0 %	40 %	0 %	527323612
124	NC_021893	GATTG	2	10	168142	168151	20 %	40 %	40 %	0 %	527323612
125	NC_021893	GTTTT	2	10	174621	174630	0 %	80 %	20 %	0 %	527323616
126	NC_021893	TATTG	2	10	174644	174653	20 %	60 %	20 %	0 %	527323616
127	NC_021893	CAGCA	2	10	175003	175012	40 %	0 %	20 %	40 %	527323616
128	NC_021893	TAGGA	2	10	175308	175317	40 %	20 %	40 %	0 %	527323617
129	NC_021893	TGATT	2	10	177235	177244	20 %	60 %	20 %	0 %	527323618
130	NC_021893	TCAAT	2	10	177876	177885	40 %	40 %	0 %	20 %	527323618
131	NC_021893	TTTTC	2	10	177915	177924	0 %	80 %	0 %	20 %	527323618
132	NC_021893	AGAGT	2	10	180861	180870	40 %	20 %	40 %	0 %	527323619
133	NC_021893	TTGAA	2	10	181551	181560	40 %	40 %	20 %	0 %	527323620
134	NC_021893	TGAGT	2	10	182365	182374	20 %	40 %	40 %	0 %	527323620
135	NC_021893	TTGAG	2	10	183115	183124	20 %	40 %	40 %	0 %	527323621
136	NC_021893	ATAGA	2	10	183137	183146	60 %	20 %	20 %	0 %	527323621
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