MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 2513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021893	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527323460
2	NC_021893	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527323461
3	NC_021893	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527323461
4	NC_021893	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527323462
5	NC_021893	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527323462
6	NC_021893	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527323463
7	NC_021893	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527323463
8	NC_021893	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527323463
9	NC_021893	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527323463
10	NC_021893	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527323464
11	NC_021893	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527323464
12	NC_021893	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527323464
13	NC_021893	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527323465
14	NC_021893	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527323465
15	NC_021893	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527323466
16	NC_021893	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527323466
17	NC_021893	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527323467
18	NC_021893	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527323468
19	NC_021893	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527323468
20	NC_021893	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527323468
21	NC_021893	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527323468
22	NC_021893	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527323469
23	NC_021893	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527323469
24	NC_021893	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527323469
25	NC_021893	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527323470
26	NC_021893	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527323470
27	NC_021893	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527323470
28	NC_021893	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527323470
29	NC_021893	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527323471
30	NC_021893	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527323472
31	NC_021893	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527323472
32	NC_021893	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527323473
33	NC_021893	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527323473
34	NC_021893	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527323473
35	NC_021893	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527323474
36	NC_021893	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527323474
37	NC_021893	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527323475
38	NC_021893	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527323475
39	NC_021893	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527323475
40	NC_021893	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527323475
41	NC_021893	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527323475
42	NC_021893	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527323477
43	NC_021893	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527323480
44	NC_021893	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527323480
45	NC_021893	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527323480
46	NC_021893	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527323480
47	NC_021893	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527323480
48	NC_021893	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527323480
49	NC_021893	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527323480
50	NC_021893	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527323480
51	NC_021893	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527323481
52	NC_021893	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527323481
53	NC_021893	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527323481
54	NC_021893	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527323481
55	NC_021893	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527323481
56	NC_021893	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527323482
57	NC_021893	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527323482
58	NC_021893	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527323482
59	NC_021893	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527323482
60	NC_021893	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527323483
61	NC_021893	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527323483
62	NC_021893	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527323485
63	NC_021893	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527323485
64	NC_021893	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527323485
65	NC_021893	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527323485
66	NC_021893	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527323486
67	NC_021893	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527323486
68	NC_021893	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527323486
69	NC_021893	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527323488
70	NC_021893	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527323491
71	NC_021893	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527323491
72	NC_021893	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527323492
73	NC_021893	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527323492
74	NC_021893	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527323493
75	NC_021893	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527323493
76	NC_021893	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527323493
77	NC_021893	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527323493
78	NC_021893	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527323494
79	NC_021893	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527323494
80	NC_021893	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527323494
81	NC_021893	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527323494
82	NC_021893	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527323494
83	NC_021893	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527323495
84	NC_021893	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527323495
85	NC_021893	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527323495
86	NC_021893	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527323495
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89	NC_021893	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527323497
90	NC_021893	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527323499
91	NC_021893	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527323499
92	NC_021893	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527323501
93	NC_021893	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527323501
94	NC_021893	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527323501
95	NC_021893	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527323502
96	NC_021893	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527323502
97	NC_021893	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527323502
98	NC_021893	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527323502
99	NC_021893	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527323502
100	NC_021893	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527323503
101	NC_021893	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527323503
102	NC_021893	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527323503
103	NC_021893	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527323503
104	NC_021893	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527323503
105	NC_021893	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527323503
106	NC_021893	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527323503
107	NC_021893	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527323503
108	NC_021893	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527323504
109	NC_021893	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527323504
110	NC_021893	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527323505
111	NC_021893	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527323505
112	NC_021893	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527323507
113	NC_021893	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527323507
114	NC_021893	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527323507
115	NC_021893	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527323509
116	NC_021893	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527323509
117	NC_021893	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527323510
118	NC_021893	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527323510
119	NC_021893	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527323510
120	NC_021893	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527323510
121	NC_021893	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527323510
122	NC_021893	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527323510
123	NC_021893	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527323511
124	NC_021893	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527323511
125	NC_021893	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527323511
126	NC_021893	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527323511
127	NC_021893	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527323511
128	NC_021893	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527323511
129	NC_021893	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527323512
130	NC_021893	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527323512
131	NC_021893	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527323512
132	NC_021893	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527323513
133	NC_021893	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527323513
134	NC_021893	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527323514
135	NC_021893	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527323514
136	NC_021893	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527323514
137	NC_021893	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527323514
138	NC_021893	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527323514
139	NC_021893	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527323514
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