MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2/55

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021893	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021893	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021893	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021893	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021893	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021893	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021893	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021893	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021893	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021893	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021893	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021893	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021893	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021893	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021893	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021893	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021893	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021893	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021893	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021893	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021893	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021893	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021893	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021893	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021893	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021893	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021893	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021893	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021893	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021893	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021893	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021893	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021893	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021893	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021893	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021893	TA	3	6	85228	85233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021893	TC	3	6	90449	90454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021893	GA	3	6	90581	90586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021893	CT	3	6	92931	92936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021893	GA	3	6	93459	93464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021893	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021893	TC	3	6	99952	99957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021893	AT	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021893	GC	3	6	102109	102114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021893	TA	3	6	106679	106684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021893	TG	3	6	115933	115938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021893	AG	4	8	118521	118528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021893	GA	3	6	120343	120348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021893	TA	3	6	122651	122656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021893	GT	3	6	123641	123646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021893	CT	3	6	128177	128182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021893	TC	3	6	130499	130504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021893	TG	3	6	133407	133412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021893	TG	3	6	137015	137020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021893	AG	3	6	138260	138265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021893	AT	3	6	142555	142560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021893	AG	3	6	157362	157367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021893	TC	3	6	171834	171839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021893	AG	3	6	171966	171971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021893	CT	3	6	171984	171989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021893	TG	3	6	178473	178478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021893	CT	3	6	178612	178617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021893	GA	3	6	179166	179171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021893	CT	3	6	179492	179497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021893	TA	3	6	183671	183676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021893	GA	3	6	183887	183892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021893	GA	3	6	184526	184531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021893	GA	3	6	184558	184563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021893	AG	3	6	188612	188617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021893	TC	3	6	188772	188777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021893	AT	3	6	189113	189118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021893	AG	3	6	192892	192897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021893	TC	3	6	195884	195889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021893	AG	3	6	197716	197721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021893	CT	3	6	197728	197733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021893	CT	3	6	199642	199647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021893	GA	4	8	202701	202708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021893	CT	4	8	202749	202756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021893	TA	3	6	204330	204335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021893	AG	3	6	214021	214026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021893	TA	3	6	215575	215580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021893	CT	3	6	217218	217223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021893	TC	3	6	220219	220224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021893	AG	3	6	220250	220255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021893	TC	3	6	234449	234454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021893	AG	3	6	234475	234480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021893	AC	3	6	239398	239403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021893	GA	3	6	246484	246489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021893	TG	3	6	246594	246599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021893	AG	3	6	247394	247399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021893	GA	3	6	248273	248278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021893	AG	3	6	248398	248403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021893	TA	3	6	250219	250224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021893	AG	3	6	252510	252515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021893	TC	3	6	252536	252541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021893	TA	3	6	260377	260382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021893	AG	3	6	260457	260462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021893	CA	3	6	262184	262189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021893	TC	3	6	264083	264088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021893	TA	3	6	269634	269639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021893	AT	4	8	280194	280201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021893	CT	3	6	281046	281051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021893	TC	4	8	281137	281144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021893	TC	3	6	282828	282833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021893	TC	3	6	282885	282890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021893	CT	3	6	283358	283363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021893	AT	3	6	295372	295377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021893	CA	3	6	297701	297706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021893	GA	3	6	302432	302437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021893	AG	3	6	311650	311655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021893	CT	3	6	343622	343627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021893	CT	3	6	346693	346698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021893	TC	3	6	350919	350924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021893	CT	3	6	354835	354840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021893	AC	3	6	358168	358173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021893	GA	3	6	360079	360084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021893	TC	3	6	360157	360162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021893	TA	3	6	360358	360363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021893	GC	3	6	361887	361892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021893	TC	3	6	362190	362195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021893	CT	4	8	377493	377500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021893	CG	3	6	387332	387337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021893	CA	3	6	388382	388387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021893	TC	3	6	390929	390934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021893	CT	3	6	391419	391424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021893	GA	3	6	391673	391678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021893	CT	3	6	406766	406771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021893	CT	3	6	425501	425506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021893	CT	3	6	426524	426529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021893	AG	3	6	426870	426875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021893	GA	3	6	428565	428570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021893	AC	3	6	432563	432568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021893	CT	3	6	436834	436839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021893	AC	3	6	436872	436877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021893	CA	3	6	439341	439346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021893	CT	3	6	440741	440746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021893	CT	3	6	450023	450028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021893	AG	3	6	456164	456169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021893	TC	3	6	462702	462707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021893	AT	3	6	462771	462776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021893	GA	4	8	464145	464152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021893	TA	3	6	464188	464193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021893	TC	3	6	476013	476018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021893	AC	3	6	481554	481559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021893	GA	4	8	481599	481606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021893	CA	3	6	481636	481641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021893	TC	3	6	481677	481682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021893	AC	3	6	486112	486117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021893	AG	3	6	486274	486279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021893	CT	3	6	486293	486298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021893	CT	3	6	489572	489577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021893	CT	3	6	490090	490095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021893	TG	3	6	490123	490128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021893	TA	3	6	490236	490241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.