MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	TGTGA	2	10	3279	3288	20 %	40 %	40 %	0 %	527322505
2	NC_021892	TTGAA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	527322506
3	NC_021892	GAGAA	2	10	3929	3938	60 %	0 %	40 %	0 %	527322506
4	NC_021892	GAAAA	2	10	4366	4375	80 %	0 %	20 %	0 %	527322506
5	NC_021892	TTACA	2	10	4521	4530	40 %	40 %	0 %	20 %	527322506
6	NC_021892	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	527322507
7	NC_021892	TGGTA	2	10	7689	7698	20 %	40 %	40 %	0 %	527322509
8	NC_021892	CGAAA	2	10	9097	9106	60 %	0 %	20 %	20 %	527322510
9	NC_021892	GGCTG	2	10	9731	9740	0 %	20 %	60 %	20 %	527322511
10	NC_021892	CCTCT	2	10	10523	10532	0 %	40 %	0 %	60 %	527322512
11	NC_021892	AAAGG	2	10	10682	10691	60 %	0 %	40 %	0 %	527322512
12	NC_021892	AAGAA	2	10	11802	11811	80 %	0 %	20 %	0 %	527322513
13	NC_021892	AAAGA	2	10	13200	13209	80 %	0 %	20 %	0 %	527322514
14	NC_021892	GGTGT	2	10	13304	13313	0 %	40 %	60 %	0 %	527322514
15	NC_021892	GATTT	2	10	15046	15055	20 %	60 %	20 %	0 %	527322516
16	NC_021892	CGTTC	2	10	16157	16166	0 %	40 %	20 %	40 %	527322517
17	NC_021892	GCTTC	2	10	16530	16539	0 %	40 %	20 %	40 %	527322517
18	NC_021892	GAAGG	2	10	16901	16910	40 %	0 %	60 %	0 %	527322517
19	NC_021892	GTTGT	2	10	20327	20336	0 %	60 %	40 %	0 %	527322520
20	NC_021892	AAGAT	2	10	21439	21448	60 %	20 %	20 %	0 %	527322522
21	NC_021892	TTTGC	2	10	22050	22059	0 %	60 %	20 %	20 %	527322522
22	NC_021892	GGAAA	2	10	23804	23813	60 %	0 %	40 %	0 %	527322522
23	NC_021892	AGAGG	2	10	25529	25538	40 %	0 %	60 %	0 %	527322523
24	NC_021892	GGAGA	2	10	27308	27317	40 %	0 %	60 %	0 %	527322524
25	NC_021892	ATCCG	2	10	28059	28068	20 %	20 %	20 %	40 %	527322526
26	NC_021892	AGGGT	2	10	28577	28586	20 %	20 %	60 %	0 %	527322526
27	NC_021892	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	527322527
28	NC_021892	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	527322528
29	NC_021892	GAGCT	2	10	31456	31465	20 %	20 %	40 %	20 %	527322529
30	NC_021892	CTATT	2	10	36130	36139	20 %	60 %	0 %	20 %	527322535
31	NC_021892	TCCTA	2	10	36177	36186	20 %	40 %	0 %	40 %	527322535
32	NC_021892	ACGAT	2	10	38092	38101	40 %	20 %	20 %	20 %	527322536
33	NC_021892	TTTGA	2	10	38457	38466	20 %	60 %	20 %	0 %	527322536
34	NC_021892	AGCAA	2	10	42108	42117	60 %	0 %	20 %	20 %	527322539
35	NC_021892	CGATG	2	10	42165	42174	20 %	20 %	40 %	20 %	527322539
36	NC_021892	TGCAA	2	10	42323	42332	40 %	20 %	20 %	20 %	527322540
37	NC_021892	CAAAA	2	10	42642	42651	80 %	0 %	0 %	20 %	527322540
38	NC_021892	TTTAT	2	10	44237	44246	20 %	80 %	0 %	0 %	527322544
39	NC_021892	CTTTC	2	10	46333	46342	0 %	60 %	0 %	40 %	527322546
40	NC_021892	AGTTT	2	10	46872	46881	20 %	60 %	20 %	0 %	527322546
41	NC_021892	CTTTT	2	10	50036	50045	0 %	80 %	0 %	20 %	527322549
42	NC_021892	CCGTA	2	10	53811	53820	20 %	20 %	20 %	40 %	527322552
43	NC_021892	TCAGA	2	10	54703	54712	40 %	20 %	20 %	20 %	527322553
44	NC_021892	TTATC	2	10	55230	55239	20 %	60 %	0 %	20 %	527322553
45	NC_021892	TGAGT	2	10	55251	55260	20 %	40 %	40 %	0 %	527322553
46	NC_021892	GTTGT	2	10	56298	56307	0 %	60 %	40 %	0 %	527322554
47	NC_021892	GAGCA	2	10	59814	59823	40 %	0 %	40 %	20 %	527322556
48	NC_021892	TGTGA	2	10	62263	62272	20 %	40 %	40 %	0 %	527322559
49	NC_021892	CCTTC	2	10	64064	64073	0 %	40 %	0 %	60 %	527322560
50	NC_021892	AGGAG	2	10	66292	66301	40 %	0 %	60 %	0 %	527322562
51	NC_021892	GTTAA	2	10	66422	66431	40 %	40 %	20 %	0 %	527322562
52	NC_021892	CAAGC	2	10	68800	68809	40 %	0 %	20 %	40 %	527322564
53	NC_021892	GCGAT	2	10	69860	69869	20 %	20 %	40 %	20 %	527322565
54	NC_021892	CTCTT	2	10	70214	70223	0 %	60 %	0 %	40 %	527322565
55	NC_021892	AGGGG	2	10	70860	70869	20 %	0 %	80 %	0 %	527322565
56	NC_021892	AAGAA	2	10	70902	70911	80 %	0 %	20 %	0 %	527322565
57	NC_021892	ATTGG	2	10	72192	72201	20 %	40 %	40 %	0 %	527322567
58	NC_021892	GAAAA	2	10	73264	73273	80 %	0 %	20 %	0 %	527322567
59	NC_021892	TGGGA	2	10	73681	73690	20 %	20 %	60 %	0 %	527322568
60	NC_021892	TATTT	2	10	76208	76217	20 %	80 %	0 %	0 %	527322569
61	NC_021892	TGTCT	2	10	80001	80010	0 %	60 %	20 %	20 %	527322573
62	NC_021892	TTACT	2	10	80508	80517	20 %	60 %	0 %	20 %	527322573
63	NC_021892	AGAAA	2	10	81898	81907	80 %	0 %	20 %	0 %	527322575
64	NC_021892	GGAAG	2	10	82411	82420	40 %	0 %	60 %	0 %	527322575
65	NC_021892	GATCC	2	10	85962	85971	20 %	20 %	20 %	40 %	527322578
66	NC_021892	AGAGC	2	10	87297	87306	40 %	0 %	40 %	20 %	527322579
67	NC_021892	TTTTC	2	10	91029	91038	0 %	80 %	0 %	20 %	527322582
68	NC_021892	GGATG	2	10	91289	91298	20 %	20 %	60 %	0 %	527322583
69	NC_021892	CAACA	2	10	92828	92837	60 %	0 %	0 %	40 %	527322584
70	NC_021892	ACAGC	2	10	93873	93882	40 %	0 %	20 %	40 %	527322586
71	NC_021892	GGAAC	2	10	94585	94594	40 %	0 %	40 %	20 %	527322587
72	NC_021892	GGATT	2	10	95485	95494	20 %	40 %	40 %	0 %	527322587
73	NC_021892	CAATC	2	10	96587	96596	40 %	20 %	0 %	40 %	527322589
74	NC_021892	TTTGC	2	10	96721	96730	0 %	60 %	20 %	20 %	527322589
75	NC_021892	ATTCA	2	10	96985	96994	40 %	40 %	0 %	20 %	527322589
76	NC_021892	GATCC	2	10	97244	97253	20 %	20 %	20 %	40 %	527322589
77	NC_021892	GTTTT	2	10	97665	97674	0 %	80 %	20 %	0 %	527322589
78	NC_021892	AAGCT	2	10	98868	98877	40 %	20 %	20 %	20 %	527322590
79	NC_021892	AGGGG	2	10	99227	99236	20 %	0 %	80 %	0 %	527322590
80	NC_021892	ATAGC	2	10	99926	99935	40 %	20 %	20 %	20 %	527322591
81	NC_021892	AGCGA	2	10	102854	102863	40 %	0 %	40 %	20 %	527322594
82	NC_021892	TTTCT	2	10	103212	103221	0 %	80 %	0 %	20 %	527322594
83	NC_021892	CTTCT	2	10	103266	103275	0 %	60 %	0 %	40 %	527322594
84	NC_021892	ATCAT	2	10	104418	104427	40 %	40 %	0 %	20 %	527322595
85	NC_021892	GGCAT	2	10	105126	105135	20 %	20 %	40 %	20 %	527322595
86	NC_021892	AAAGC	2	10	108852	108861	60 %	0 %	20 %	20 %	527322598
87	NC_021892	GCATT	2	10	110012	110021	20 %	40 %	20 %	20 %	527322600
88	NC_021892	TGTTT	2	10	114689	114698	0 %	80 %	20 %	0 %	527322603
89	NC_021892	CATGT	2	10	115067	115076	20 %	40 %	20 %	20 %	527322603
90	NC_021892	TATCG	2	10	115771	115780	20 %	40 %	20 %	20 %	527322603
91	NC_021892	TTTCT	2	10	116287	116296	0 %	80 %	0 %	20 %	527322604
92	NC_021892	ATGCT	2	10	118210	118219	20 %	40 %	20 %	20 %	527322606
93	NC_021892	AAAGA	2	10	118531	118540	80 %	0 %	20 %	0 %	527322606
94	NC_021892	GCTTC	2	10	122521	122530	0 %	40 %	20 %	40 %	527322609
95	NC_021892	TACAA	2	10	126310	126319	60 %	20 %	0 %	20 %	527322613
96	NC_021892	ATCCA	2	10	128715	128724	40 %	20 %	0 %	40 %	527322616
97	NC_021892	GAAGA	2	10	130265	130274	60 %	0 %	40 %	0 %	527322616
98	NC_021892	AAAAG	2	10	132178	132187	80 %	0 %	20 %	0 %	527322617
99	NC_021892	GATTC	2	10	132509	132518	20 %	40 %	20 %	20 %	527322617
100	NC_021892	GGATA	2	10	135129	135138	40 %	20 %	40 %	0 %	527322619
101	NC_021892	ATTGG	2	10	135794	135803	20 %	40 %	40 %	0 %	527322620
102	NC_021892	ATTGT	2	10	135827	135836	20 %	60 %	20 %	0 %	527322620
103	NC_021892	TGTTT	2	10	136253	136262	0 %	80 %	20 %	0 %	527322621
104	NC_021892	TCCAG	2	10	139998	140007	20 %	20 %	20 %	40 %	527322627
105	NC_021892	GTACA	2	10	140729	140738	40 %	20 %	20 %	20 %	527322628
106	NC_021892	TAGAT	2	10	141102	141111	40 %	40 %	20 %	0 %	527322628
107	NC_021892	AAAAG	2	10	141514	141523	80 %	0 %	20 %	0 %	527322629
108	NC_021892	AAAAC	2	10	141994	142003	80 %	0 %	0 %	20 %	527322630
109	NC_021892	TGCTA	2	10	143080	143089	20 %	40 %	20 %	20 %	527322632
110	NC_021892	GGAGC	2	10	143127	143136	20 %	0 %	60 %	20 %	527322632
111	NC_021892	CTGGG	2	10	144541	144550	0 %	20 %	60 %	20 %	527322634
112	NC_021892	GTTTT	2	10	145288	145297	0 %	80 %	20 %	0 %	527322635
113	NC_021892	GAACC	2	10	149022	149031	40 %	0 %	20 %	40 %	527322636
114	NC_021892	TTCTT	2	10	155195	155204	0 %	80 %	0 %	20 %	527322642
115	NC_021892	AGGAA	2	10	159752	159761	60 %	0 %	40 %	0 %	527322646
116	NC_021892	AGAGA	2	10	162983	162992	60 %	0 %	40 %	0 %	527322649
117	NC_021892	AGCAA	2	10	163418	163427	60 %	0 %	20 %	20 %	527322649
118	NC_021892	CAAAA	2	10	166921	166930	80 %	0 %	0 %	20 %	527322651
119	NC_021892	AAGAG	2	10	167754	167763	60 %	0 %	40 %	0 %	527322651
120	NC_021892	GTTTT	2	10	174578	174587	0 %	80 %	20 %	0 %	527322655
121	NC_021892	TATTG	2	10	174601	174610	20 %	60 %	20 %	0 %	527322655
122	NC_021892	CAGCA	2	10	174960	174969	40 %	0 %	20 %	40 %	527322655
123	NC_021892	TAGGA	2	10	175267	175276	40 %	20 %	40 %	0 %	527322656
124	NC_021892	TGATT	2	10	177194	177203	20 %	60 %	20 %	0 %	527322657
125	NC_021892	TCAAT	2	10	177835	177844	40 %	40 %	0 %	20 %	527322657
126	NC_021892	TTTTC	2	10	177874	177883	0 %	80 %	0 %	20 %	527322657
127	NC_021892	AGAGT	2	10	180817	180826	40 %	20 %	40 %	0 %	527322658
128	NC_021892	TTGAA	2	10	181350	181359	40 %	40 %	20 %	0 %	527322659
129	NC_021892	TTGAG	2	10	182910	182919	20 %	40 %	40 %	0 %	527322660
130	NC_021892	GAATG	2	10	182935	182944	40 %	20 %	40 %	0 %	527322660
131	NC_021892	AGAGA	2	10	184978	184987	60 %	0 %	40 %	0 %	527322663
132	NC_021892	ACGAT	2	10	187039	187048	40 %	20 %	20 %	20 %	527322664
133	NC_021892	GGATC	2	10	190144	190153	20 %	20 %	40 %	20 %	527322667
134	NC_021892	CAGAT	2	10	190259	190268	40 %	20 %	20 %	20 %	527322667
135	NC_021892	AAAAG	2	10	192855	192864	80 %	0 %	20 %	0 %	527322668
136	NC_021892	TATCA	2	10	192928	192937	40 %	40 %	0 %	20 %	527322668
137	NC_021892	GATCT	2	10	193074	193083	20 %	40 %	20 %	20 %	527322668
138	NC_021892	GATTA	2	10	194327	194336	40 %	40 %	20 %	0 %	527322670
139	NC_021892	AGAAA	2	10	197026	197035	80 %	0 %	20 %	0 %	527322675
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393	NC_021892	AGAAA	2	10	619211	619220	80 %	0 %	20 %	0 %	527323071
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396	NC_021892	TTTAT	2	10	627657	627666	20 %	80 %	0 %	0 %	527323078
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