MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 2975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021892	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021892	AAGG	2	8	1307	1314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021892	AGTA	2	8	1487	1494	50 %	25 %	25 %	0 %	527322503
5	NC_021892	ATGA	2	8	1891	1898	50 %	25 %	25 %	0 %	527322504
6	NC_021892	GATA	2	8	1929	1936	50 %	25 %	25 %	0 %	527322504
7	NC_021892	TTTC	2	8	2226	2233	0 %	75 %	0 %	25 %	527322505
8	NC_021892	CATG	2	8	3107	3114	25 %	25 %	25 %	25 %	527322505
9	NC_021892	TTCC	2	8	3412	3419	0 %	50 %	0 %	50 %	527322505
10	NC_021892	TTTA	2	8	3810	3817	25 %	75 %	0 %	0 %	527322506
11	NC_021892	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	527322506
12	NC_021892	GACG	2	8	4857	4864	25 %	0 %	50 %	25 %	527322506
13	NC_021892	TTGG	2	8	4960	4967	0 %	50 %	50 %	0 %	527322506
14	NC_021892	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	527322507
15	NC_021892	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	527322507
16	NC_021892	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	527322507
17	NC_021892	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021892	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	527322508
19	NC_021892	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	527322508
20	NC_021892	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021892	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021892	TTTG	2	8	7186	7193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021892	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	527322509
24	NC_021892	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	527322510
25	NC_021892	AGCG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	527322510
26	NC_021892	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	527322510
27	NC_021892	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	527322510
28	NC_021892	TATT	2	8	9308	9315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021892	TTCG	2	8	9417	9424	0 %	50 %	25 %	25 %	527322511
30	NC_021892	AATT	2	8	9522	9529	50 %	50 %	0 %	0 %	527322511
31	NC_021892	ATGG	2	8	9581	9588	25 %	25 %	50 %	0 %	527322511
32	NC_021892	CTTT	2	8	10206	10213	0 %	75 %	0 %	25 %	527322512
33	NC_021892	GCAA	2	8	10423	10430	50 %	0 %	25 %	25 %	527322512
34	NC_021892	AGCC	2	8	10653	10660	25 %	0 %	25 %	50 %	527322512
35	NC_021892	GAAA	2	8	10796	10803	75 %	0 %	25 %	0 %	527322512
36	NC_021892	AGAA	2	8	11200	11207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021892	AATG	2	8	11539	11546	50 %	25 %	25 %	0 %	527322513
38	NC_021892	GTTT	2	8	12571	12578	0 %	75 %	25 %	0 %	527322514
39	NC_021892	ATGC	2	8	13001	13008	25 %	25 %	25 %	25 %	527322514
40	NC_021892	AAGG	2	8	13435	13442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021892	TTGT	2	8	14036	14043	0 %	75 %	25 %	0 %	527322515
42	NC_021892	TTCT	2	8	14207	14214	0 %	75 %	0 %	25 %	527322515
43	NC_021892	ATTT	2	8	14413	14420	25 %	75 %	0 %	0 %	527322515
44	NC_021892	TTTC	2	8	15075	15082	0 %	75 %	0 %	25 %	527322516
45	NC_021892	AAAT	2	8	15557	15564	75 %	25 %	0 %	0 %	527322516
46	NC_021892	CAAA	2	8	16069	16076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021892	GTAA	2	8	16399	16406	50 %	25 %	25 %	0 %	527322517
48	NC_021892	CTAA	2	8	16592	16599	50 %	25 %	0 %	25 %	527322517
49	NC_021892	AGAA	2	8	16855	16862	75 %	0 %	25 %	0 %	527322517
50	NC_021892	ATTT	2	8	17001	17008	25 %	75 %	0 %	0 %	527322517
51	NC_021892	TGCG	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021892	GAAG	2	8	19507	19514	50 %	0 %	50 %	0 %	527322519
53	NC_021892	TTTG	2	8	19533	19540	0 %	75 %	25 %	0 %	527322519
54	NC_021892	TGTA	2	8	20225	20232	25 %	50 %	25 %	0 %	527322520
55	NC_021892	CGCT	2	8	21265	21272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021892	TTAA	2	8	21286	21293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021892	GTTA	2	8	21323	21330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021892	GATC	2	8	21378	21385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021892	GATG	2	8	21641	21648	25 %	25 %	50 %	0 %	527322522
60	NC_021892	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	527322522
61	NC_021892	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	527322522
62	NC_021892	GGTT	2	8	23091	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	527322522
63	NC_021892	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	527322522
64	NC_021892	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	527322522
65	NC_021892	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	527322522
66	NC_021892	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	527322522
67	NC_021892	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	527322523
68	NC_021892	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	527322523
69	NC_021892	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	527322523
70	NC_021892	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	527322523
71	NC_021892	GCTT	2	8	26285	26292	0 %	50 %	25 %	25 %	527322523
72	NC_021892	GGAA	2	8	26868	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	527322524
73	NC_021892	TTAA	2	8	26941	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	527322524
74	NC_021892	AAAG	2	8	26991	26998	75 %	0 %	25 %	0 %	527322524
75	NC_021892	GGGC	2	8	27271	27278	0 %	0 %	75 %	25 %	527322524
76	NC_021892	GTTT	2	8	27554	27561	0 %	75 %	25 %	0 %	527322525
77	NC_021892	CAGA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	25 %	25 %	527322525
78	NC_021892	ATTG	2	8	27935	27942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021892	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	527322527
80	NC_021892	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
81	NC_021892	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
82	NC_021892	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	527322527
83	NC_021892	AAAG	2	8	30321	30328	75 %	0 %	25 %	0 %	527322528
84	NC_021892	AAAC	2	8	30391	30398	75 %	0 %	0 %	25 %	527322528
85	NC_021892	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	527322528
86	NC_021892	GATA	2	8	31643	31650	50 %	25 %	25 %	0 %	527322530
87	NC_021892	TGAT	2	8	34138	34145	25 %	50 %	25 %	0 %	527322533
88	NC_021892	AAGA	3	12	34266	34277	75 %	0 %	25 %	0 %	527322533
89	NC_021892	AAGC	2	8	34486	34493	50 %	0 %	25 %	25 %	527322534
90	NC_021892	GTTC	2	8	34519	34526	0 %	50 %	25 %	25 %	527322534
91	NC_021892	GGCA	2	8	34898	34905	25 %	0 %	50 %	25 %	527322535
92	NC_021892	TCGA	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	527322535
93	NC_021892	TGCT	2	8	35308	35315	0 %	50 %	25 %	25 %	527322535
94	NC_021892	TATG	2	8	35451	35458	25 %	50 %	25 %	0 %	527322535
95	NC_021892	TTGG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	527322535
96	NC_021892	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	527322535
97	NC_021892	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	527322536
98	NC_021892	ATGA	2	8	37122	37129	50 %	25 %	25 %	0 %	527322536
99	NC_021892	TAGG	2	8	37281	37288	25 %	25 %	50 %	0 %	527322536
100	NC_021892	CAAT	2	8	37465	37472	50 %	25 %	0 %	25 %	527322536
101	NC_021892	AATG	2	8	38252	38259	50 %	25 %	25 %	0 %	527322536
102	NC_021892	AGAA	2	8	39089	39096	75 %	0 %	25 %	0 %	527322537
103	NC_021892	AAGA	2	8	39141	39148	75 %	0 %	25 %	0 %	527322537
104	NC_021892	ATCC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	527322537
105	NC_021892	TAAT	2	8	39360	39367	50 %	50 %	0 %	0 %	527322537
106	NC_021892	GTGC	2	8	41449	41456	0 %	25 %	50 %	25 %	527322539
107	NC_021892	AGAA	2	8	41868	41875	75 %	0 %	25 %	0 %	527322539
108	NC_021892	GGAT	2	8	42020	42027	25 %	25 %	50 %	0 %	527322539
109	NC_021892	AAAC	2	8	43228	43235	75 %	0 %	0 %	25 %	527322542
110	NC_021892	CAAT	2	8	43432	43439	50 %	25 %	0 %	25 %	527322542
111	NC_021892	TGTT	2	8	43812	43819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021892	AATA	2	8	44050	44057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021892	ATTT	2	8	44188	44195	25 %	75 %	0 %	0 %	527322544
114	NC_021892	GGAA	2	8	44215	44222	50 %	0 %	50 %	0 %	527322544
115	NC_021892	GCTC	2	8	44496	44503	0 %	25 %	25 %	50 %	527322544
116	NC_021892	TTCT	2	8	44638	44645	0 %	75 %	0 %	25 %	527322544
117	NC_021892	TTGA	2	8	45238	45245	25 %	50 %	25 %	0 %	527322545
118	NC_021892	TGTT	2	8	45410	45417	0 %	75 %	25 %	0 %	527322545
119	NC_021892	CTAT	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	527322545
120	NC_021892	TGTT	2	8	45469	45476	0 %	75 %	25 %	0 %	527322545
121	NC_021892	CTAT	2	8	45765	45772	25 %	50 %	0 %	25 %	527322545
122	NC_021892	AAGA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	527322546
123	NC_021892	AAGA	2	8	46317	46324	75 %	0 %	25 %	0 %	527322546
124	NC_021892	AAAG	2	8	46357	46364	75 %	0 %	25 %	0 %	527322546
125	NC_021892	AAGA	2	8	46472	46479	75 %	0 %	25 %	0 %	527322546
126	NC_021892	ACTT	2	8	46733	46740	25 %	50 %	0 %	25 %	527322546
127	NC_021892	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	527322546
128	NC_021892	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	527322546
129	NC_021892	GAAC	2	8	47937	47944	50 %	0 %	25 %	25 %	527322546
130	NC_021892	AAGT	2	8	47972	47979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021892	AACA	2	8	48182	48189	75 %	0 %	0 %	25 %	527322547
132	NC_021892	CTTT	2	8	48378	48385	0 %	75 %	0 %	25 %	527322547
133	NC_021892	CTTT	2	8	49263	49270	0 %	75 %	0 %	25 %	527322548
134	NC_021892	GTAG	2	8	49281	49288	25 %	25 %	50 %	0 %	527322548
135	NC_021892	GAAG	2	8	50709	50716	50 %	0 %	50 %	0 %	527322549
136	NC_021892	TTCA	2	8	51131	51138	25 %	50 %	0 %	25 %	527322549
137	NC_021892	TATT	2	8	52175	52182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021892	GGAT	2	8	52256	52263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021892	GGAA	2	8	52406	52413	50 %	0 %	50 %	0 %	527322551
140	NC_021892	TTAA	2	8	53147	53154	50 %	50 %	0 %	0 %	527322551
141	NC_021892	CCTT	2	8	53354	53361	0 %	50 %	0 %	50 %	527322552
142	NC_021892	TTTA	2	8	53521	53528	25 %	75 %	0 %	0 %	527322552
143	NC_021892	AAAG	2	8	53745	53752	75 %	0 %	25 %	0 %	527322552
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161	NC_021892	AGAA	2	8	58137	58144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021892	TATT	2	8	97769	97776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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