MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 13222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	ATG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322503
2	NC_021892	GTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322503
3	NC_021892	TCC	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322503
4	NC_021892	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322503
5	NC_021892	AGC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322503
6	NC_021892	AAG	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322503
7	NC_021892	TAC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322503
8	NC_021892	GCT	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322503
9	NC_021892	AAC	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322503
10	NC_021892	AGA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322503
11	NC_021892	AGA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
12	NC_021892	ATC	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322504
13	NC_021892	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322504
14	NC_021892	CAT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322504
15	NC_021892	AGA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
16	NC_021892	AAG	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
17	NC_021892	GGA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322504
18	NC_021892	ATC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322505
19	NC_021892	ATA	2	6	2338	2343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
20	NC_021892	AAC	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322505
21	NC_021892	GGT	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322505
22	NC_021892	AAT	2	6	2523	2528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
23	NC_021892	TTC	2	6	2558	2563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322505
24	NC_021892	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
25	NC_021892	GGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322505
26	NC_021892	CAG	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
27	NC_021892	GTT	2	6	2661	2666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322505
28	NC_021892	GGT	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322505
29	NC_021892	AAG	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
30	NC_021892	ATT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322505
31	NC_021892	TTG	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322505
32	NC_021892	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
33	NC_021892	AAG	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
34	NC_021892	CAG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
35	NC_021892	GCT	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322505
36	NC_021892	AAG	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
37	NC_021892	CAG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
38	NC_021892	GGA	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322505
39	NC_021892	AAT	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
40	NC_021892	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322506
41	NC_021892	TGA	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
42	NC_021892	GTA	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
43	NC_021892	AGA	2	6	3966	3971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
44	NC_021892	GAA	2	6	4150	4155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
45	NC_021892	CGT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322506
46	NC_021892	GTT	2	6	4333	4338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
47	NC_021892	TGA	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
48	NC_021892	TTG	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
49	NC_021892	TTC	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322506
50	NC_021892	TCT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322506
51	NC_021892	AGA	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
52	NC_021892	GTT	2	6	4845	4850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
53	NC_021892	GGT	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322506
54	NC_021892	CTC	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322506
55	NC_021892	AGC	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322506
56	NC_021892	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322507
57	NC_021892	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322507
58	NC_021892	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
59	NC_021892	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322507
60	NC_021892	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322507
61	NC_021892	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
62	NC_021892	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
63	NC_021892	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
64	NC_021892	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
65	NC_021892	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322507
66	NC_021892	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
67	NC_021892	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322507
68	NC_021892	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322507
69	NC_021892	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322507
70	NC_021892	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322507
71	NC_021892	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
72	NC_021892	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322507
73	NC_021892	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322508
74	NC_021892	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322508
75	NC_021892	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322508
76	NC_021892	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322508
77	NC_021892	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322508
78	NC_021892	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322509
79	NC_021892	TCC	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322509
80	NC_021892	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322509
81	NC_021892	TTA	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322509
82	NC_021892	TTC	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322509
83	NC_021892	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322510
84	NC_021892	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322510
85	NC_021892	CTT	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322510
86	NC_021892	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
87	NC_021892	ATA	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322510
88	NC_021892	AGG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
89	NC_021892	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322510
90	NC_021892	CAG	2	6	8799	8804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322510
91	NC_021892	TGT	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322510
92	NC_021892	GAG	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
93	NC_021892	TAC	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322510
94	NC_021892	GTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322510
95	NC_021892	AAG	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322510
96	NC_021892	GAG	2	6	9107	9112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
97	NC_021892	TTA	2	6	9395	9400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322511
98	NC_021892	AGA	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322511
99	NC_021892	TGC	2	6	9660	9665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322511
100	NC_021892	GAA	2	6	9687	9692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322511
101	NC_021892	TCG	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322511
102	NC_021892	TGG	2	6	9770	9775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322511
103	NC_021892	GTA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322512
104	NC_021892	AGC	2	6	9981	9986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322512
105	NC_021892	CTT	2	6	9995	10000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322512
106	NC_021892	ATG	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322512
107	NC_021892	CGT	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322512
108	NC_021892	GAC	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322512
109	NC_021892	GGT	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322512
110	NC_021892	GAA	2	6	10486	10491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322512
111	NC_021892	CAA	2	6	10508	10513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322512
112	NC_021892	GGA	2	6	10570	10575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322512
113	NC_021892	CGA	2	6	10627	10632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322512
114	NC_021892	CTT	2	6	10733	10738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322512
115	NC_021892	TTG	2	6	10773	10778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322512
116	NC_021892	CTT	2	6	10787	10792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322512
117	NC_021892	ATC	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322512
118	NC_021892	TGT	2	6	10903	10908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322512
119	NC_021892	AGA	2	6	11009	11014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322512
120	NC_021892	AGG	2	6	11048	11053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322512
121	NC_021892	GAT	2	6	11108	11113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322512
122	NC_021892	CGA	2	6	11114	11119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322512
123	NC_021892	AAT	2	6	11327	11332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322513
124	NC_021892	AGG	2	6	11570	11575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322513
125	NC_021892	ATA	3	9	11580	11588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322513
126	NC_021892	TAT	2	6	11599	11604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322513
127	NC_021892	ACA	2	6	11610	11615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322513
128	NC_021892	TAC	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322513
129	NC_021892	TCA	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322513
130	NC_021892	TTC	2	6	11948	11953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322513
131	NC_021892	TTA	2	6	11964	11969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322513
132	NC_021892	AGA	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322513
133	NC_021892	CAA	2	6	12307	12312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322513
134	NC_021892	ATC	2	6	12330	12335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322513
135	NC_021892	ATA	2	6	12471	12476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322513
136	NC_021892	ATA	2	6	12563	12568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322514
137	NC_021892	TAC	2	6	12691	12696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322514
138	NC_021892	TGC	2	6	12733	12738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322514
139	NC_021892	GAA	2	6	12792	12797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322514
140	NC_021892	CAT	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322514
141	NC_021892	GAG	2	6	12857	12862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322514
142	NC_021892	TTC	2	6	12886	12891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322514
143	NC_021892	TGA	2	6	13041	13046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322514
144	NC_021892	ATA	2	6	13106	13111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322514
145	NC_021892	CAA	2	6	13210	13215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322514
146	NC_021892	AAT	2	6	13263	13268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322514
147	NC_021892	ACC	2	6	13274	13279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322514
148	NC_021892	GTT	2	6	13644	13649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322515
149	NC_021892	ATG	2	6	13696	13701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322515
150	NC_021892	TGT	2	6	13794	13799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322515
151	NC_021892	TCT	2	6	13916	13921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322515
152	NC_021892	CTT	2	6	14117	14122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322515
153	NC_021892	TGT	2	6	14169	14174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322515
154	NC_021892	CAG	2	6	14321	14326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322515
155	NC_021892	TGC	2	6	14370	14375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322515
156	NC_021892	CTT	2	6	14485	14490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322515
157	NC_021892	AAG	2	6	14665	14670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322515
158	NC_021892	GTT	2	6	14764	14769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322515
159	NC_021892	TTA	2	6	14776	14781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322515
160	NC_021892	ATT	2	6	14851	14856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322515
161	NC_021892	TTA	2	6	14866	14871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322515
162	NC_021892	CTT	2	6	14887	14892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322515
163	NC_021892	TTC	2	6	14983	14988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322516
164	NC_021892	TGT	2	6	14990	14995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322516
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167	NC_021892	TTA	2	6	15384	15389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
168	NC_021892	TAT	2	6	15463	15468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
169	NC_021892	TCA	2	6	15694	15699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322516
170	NC_021892	TTA	2	6	15702	15707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
171	NC_021892	GTA	2	6	15711	15716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322516
172	NC_021892	TTG	2	6	15798	15803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322516
173	NC_021892	TTA	2	6	15843	15848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
174	NC_021892	ACA	2	6	15914	15919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322516
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177	NC_021892	TCA	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322517
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179	NC_021892	ATT	2	6	16471	16476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322517
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192	NC_021892	CAA	2	6	17906	17911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322518
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232	NC_021892	TTC	2	6	22339	22344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322522
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248	NC_021892	AGA	2	6	23705	23710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
249	NC_021892	GAG	2	6	23728	23733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322522
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251	NC_021892	GAA	2	6	24050	24055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
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