MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 2441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021892	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021892	TC	3	6	1668	1673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021892	AG	3	6	2151	2156	50 %	0 %	50 %	0 %	527322505
5	NC_021892	GA	3	6	2819	2824	50 %	0 %	50 %	0 %	527322505
6	NC_021892	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	527322506
7	NC_021892	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	527322507
8	NC_021892	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	527322507
9	NC_021892	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	527322507
10	NC_021892	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	527322507
11	NC_021892	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	527322507
12	NC_021892	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021892	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	527322509
14	NC_021892	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	527322510
15	NC_021892	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	527322510
16	NC_021892	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	527322510
17	NC_021892	GA	3	6	9864	9869	50 %	0 %	50 %	0 %	527322512
18	NC_021892	AG	3	6	10081	10086	50 %	0 %	50 %	0 %	527322512
19	NC_021892	TA	3	6	11246	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021892	AG	3	6	11307	11312	50 %	0 %	50 %	0 %	527322513
21	NC_021892	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	527322513
22	NC_021892	TG	3	6	12770	12775	0 %	50 %	50 %	0 %	527322514
23	NC_021892	AG	3	6	12919	12924	50 %	0 %	50 %	0 %	527322514
24	NC_021892	AG	4	8	13075	13082	50 %	0 %	50 %	0 %	527322514
25	NC_021892	TA	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021892	TA	4	8	13560	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021892	AC	3	6	14403	14408	50 %	0 %	0 %	50 %	527322515
28	NC_021892	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	527322516
29	NC_021892	TC	3	6	15782	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	527322516
30	NC_021892	GA	3	6	16311	16316	50 %	0 %	50 %	0 %	527322517
31	NC_021892	AG	3	6	16382	16387	50 %	0 %	50 %	0 %	527322517
32	NC_021892	GA	3	6	17166	17171	50 %	0 %	50 %	0 %	527322517
33	NC_021892	AG	3	6	17512	17517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021892	GA	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021892	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	527322518
36	NC_021892	TC	3	6	18219	18224	0 %	50 %	0 %	50 %	527322518
37	NC_021892	CT	3	6	18447	18452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021892	TC	3	6	18647	18652	0 %	50 %	0 %	50 %	527322519
39	NC_021892	GA	3	6	18662	18667	50 %	0 %	50 %	0 %	527322519
40	NC_021892	GA	3	6	18761	18766	50 %	0 %	50 %	0 %	527322519
41	NC_021892	AG	3	6	19227	19232	50 %	0 %	50 %	0 %	527322519
42	NC_021892	AG	4	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527322519
43	NC_021892	GT	3	6	19776	19781	0 %	50 %	50 %	0 %	527322519
44	NC_021892	AG	3	6	20004	20009	50 %	0 %	50 %	0 %	527322520
45	NC_021892	TG	3	6	20117	20122	0 %	50 %	50 %	0 %	527322520
46	NC_021892	AG	3	6	20513	20518	50 %	0 %	50 %	0 %	527322521
47	NC_021892	GA	3	6	20671	20676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021892	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021892	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021892	CT	4	8	21914	21921	0 %	50 %	0 %	50 %	527322522
51	NC_021892	AT	3	6	22184	22189	50 %	50 %	0 %	0 %	527322522
52	NC_021892	AT	3	6	22508	22513	50 %	50 %	0 %	0 %	527322522
53	NC_021892	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	527322522
54	NC_021892	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	527322522
55	NC_021892	GA	3	6	25717	25722	50 %	0 %	50 %	0 %	527322523
56	NC_021892	GT	3	6	25737	25742	0 %	50 %	50 %	0 %	527322523
57	NC_021892	TA	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	527322523
58	NC_021892	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	527322523
59	NC_021892	GA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021892	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021892	AT	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	527322524
62	NC_021892	GA	3	6	27016	27021	50 %	0 %	50 %	0 %	527322524
63	NC_021892	TC	3	6	27884	27889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021892	AG	3	6	27967	27972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021892	TG	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	527322526
66	NC_021892	TC	3	6	28443	28448	0 %	50 %	0 %	50 %	527322526
67	NC_021892	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	527322526
68	NC_021892	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	527322526
69	NC_021892	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	527322527
70	NC_021892	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
71	NC_021892	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	527322528
72	NC_021892	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
73	NC_021892	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
74	NC_021892	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	527322529
75	NC_021892	TC	3	6	31652	31657	0 %	50 %	0 %	50 %	527322530
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77	NC_021892	CT	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	527322530
78	NC_021892	AG	3	6	32264	32269	50 %	0 %	50 %	0 %	527322530
79	NC_021892	TC	3	6	33761	33766	0 %	50 %	0 %	50 %	527322532
80	NC_021892	AG	3	6	33774	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	527322532
81	NC_021892	AG	3	6	33912	33917	50 %	0 %	50 %	0 %	527322533
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83	NC_021892	GA	4	8	34628	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	527322534
84	NC_021892	GA	3	6	36381	36386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021892	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021892	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	527322536
87	NC_021892	CT	3	6	37014	37019	0 %	50 %	0 %	50 %	527322536
88	NC_021892	AG	3	6	37525	37530	50 %	0 %	50 %	0 %	527322536
89	NC_021892	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	527322536
90	NC_021892	AG	3	6	38598	38603	50 %	0 %	50 %	0 %	527322536
91	NC_021892	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021892	GA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	50 %	0 %	527322537
93	NC_021892	AG	3	6	39519	39524	50 %	0 %	50 %	0 %	527322537
94	NC_021892	AG	3	6	39619	39624	50 %	0 %	50 %	0 %	527322537
95	NC_021892	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021892	GC	3	6	40575	40580	0 %	0 %	50 %	50 %	527322538
97	NC_021892	AG	3	6	40596	40601	50 %	0 %	50 %	0 %	527322538
98	NC_021892	GC	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	527322538
99	NC_021892	GA	3	6	40810	40815	50 %	0 %	50 %	0 %	527322538
100	NC_021892	TC	3	6	40819	40824	0 %	50 %	0 %	50 %	527322538
101	NC_021892	GC	3	6	40884	40889	0 %	0 %	50 %	50 %	527322538
102	NC_021892	GA	3	6	41024	41029	50 %	0 %	50 %	0 %	527322538
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104	NC_021892	GA	3	6	42000	42005	50 %	0 %	50 %	0 %	527322539
105	NC_021892	GA	4	8	42010	42017	50 %	0 %	50 %	0 %	527322539
106	NC_021892	AG	3	6	42246	42251	50 %	0 %	50 %	0 %	527322539
107	NC_021892	CT	3	6	42312	42317	0 %	50 %	0 %	50 %	527322540
108	NC_021892	GA	5	10	42588	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	527322540
109	NC_021892	AC	3	6	43469	43474	50 %	0 %	0 %	50 %	527322542
110	NC_021892	TC	3	6	43638	43643	0 %	50 %	0 %	50 %	527322542
111	NC_021892	TC	3	6	43803	43808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021892	TA	3	6	43955	43960	50 %	50 %	0 %	0 %	527322543
113	NC_021892	TC	3	6	44867	44872	0 %	50 %	0 %	50 %	527322544
114	NC_021892	GA	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	527322545
115	NC_021892	TG	3	6	45568	45573	0 %	50 %	50 %	0 %	527322545
116	NC_021892	AG	3	6	45579	45584	50 %	0 %	50 %	0 %	527322545
117	NC_021892	AG	4	8	46020	46027	50 %	0 %	50 %	0 %	527322546
118	NC_021892	CT	3	6	46211	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	527322546
119	NC_021892	TG	3	6	46412	46417	0 %	50 %	50 %	0 %	527322546
120	NC_021892	AG	3	6	46465	46470	50 %	0 %	50 %	0 %	527322546
121	NC_021892	AG	3	6	48038	48043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021892	AG	3	6	49390	49395	50 %	0 %	50 %	0 %	527322548
123	NC_021892	CA	3	6	50056	50061	50 %	0 %	0 %	50 %	527322549
124	NC_021892	TG	4	8	51386	51393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021892	TC	3	6	52899	52904	0 %	50 %	0 %	50 %	527322551
126	NC_021892	CA	3	6	52950	52955	50 %	0 %	0 %	50 %	527322551
127	NC_021892	GA	3	6	53371	53376	50 %	0 %	50 %	0 %	527322552
128	NC_021892	CT	3	6	53688	53693	0 %	50 %	0 %	50 %	527322552
129	NC_021892	CT	3	6	54385	54390	0 %	50 %	0 %	50 %	527322553
130	NC_021892	AT	3	6	55575	55580	50 %	50 %	0 %	0 %	527322553
131	NC_021892	GA	3	6	55612	55617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021892	CT	3	6	56510	56515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021892	GT	3	6	56560	56565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021892	TG	3	6	57267	57272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021892	CT	3	6	58148	58153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021892	GA	3	6	59714	59719	50 %	0 %	50 %	0 %	527322556
137	NC_021892	GT	3	6	59852	59857	0 %	50 %	50 %	0 %	527322556
138	NC_021892	TC	3	6	60600	60605	0 %	50 %	0 %	50 %	527322557
139	NC_021892	GA	3	6	60828	60833	50 %	0 %	50 %	0 %	527322558
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141	NC_021892	AT	3	6	61476	61481	50 %	50 %	0 %	0 %	527322559
142	NC_021892	GA	3	6	61499	61504	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
143	NC_021892	GA	3	6	61625	61630	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
144	NC_021892	GA	3	6	62440	62445	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
145	NC_021892	GA	3	6	62705	62710	50 %	0 %	50 %	0 %	527322559
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