MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527321569
2	NC_021891	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527321570
3	NC_021891	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527321570
4	NC_021891	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527321570
5	NC_021891	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527321570
6	NC_021891	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527321571
7	NC_021891	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527321574
8	NC_021891	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527321575
9	NC_021891	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527321576
10	NC_021891	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527321577
11	NC_021891	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527321577
12	NC_021891	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527321578
13	NC_021891	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527321579
14	NC_021891	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527321579
15	NC_021891	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527321581
16	NC_021891	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527321582
17	NC_021891	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527321582
18	NC_021891	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527321582
19	NC_021891	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527321585
20	NC_021891	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527321586
21	NC_021891	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527321586
22	NC_021891	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527321586
23	NC_021891	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527321587
24	NC_021891	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527321588
25	NC_021891	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527321588
26	NC_021891	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527321590
27	NC_021891	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527321590
28	NC_021891	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527321591
29	NC_021891	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527321592
30	NC_021891	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527321593
31	NC_021891	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527321599
32	NC_021891	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527321599
33	NC_021891	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527321600
34	NC_021891	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527321601
35	NC_021891	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527321603
36	NC_021891	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527321603
37	NC_021891	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527321607
38	NC_021891	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527321609
39	NC_021891	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527321609
40	NC_021891	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527321612
41	NC_021891	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527321613
42	NC_021891	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527321616
43	NC_021891	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527321617
44	NC_021891	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527321618
45	NC_021891	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527321620
46	NC_021891	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527321622
47	NC_021891	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527321623
48	NC_021891	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527321623
49	NC_021891	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527321625
50	NC_021891	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527321625
51	NC_021891	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527321627
52	NC_021891	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527321628
53	NC_021891	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527321628
54	NC_021891	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527321628
55	NC_021891	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527321628
56	NC_021891	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527321628
57	NC_021891	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527321630
58	NC_021891	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527321630
59	NC_021891	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527321631
60	NC_021891	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527321632
61	NC_021891	TGTCT	2	10	79945	79954	0 %	60 %	20 %	20 %	527321636
62	NC_021891	TTACT	2	10	80452	80461	20 %	60 %	0 %	20 %	527321636
63	NC_021891	AGAAA	2	10	81842	81851	80 %	0 %	20 %	0 %	527321638
64	NC_021891	GGAAG	2	10	82355	82364	40 %	0 %	60 %	0 %	527321638
65	NC_021891	GATCC	2	10	85906	85915	20 %	20 %	20 %	40 %	527321641
66	NC_021891	AGAGC	2	10	87241	87250	40 %	0 %	40 %	20 %	527321642
67	NC_021891	TTTTC	2	10	90973	90982	0 %	80 %	0 %	20 %	527321645
68	NC_021891	GGATG	2	10	91233	91242	20 %	20 %	60 %	0 %	527321646
69	NC_021891	CAACA	2	10	92772	92781	60 %	0 %	0 %	40 %	527321647
70	NC_021891	ACAGC	2	10	93817	93826	40 %	0 %	20 %	40 %	527321649
71	NC_021891	GGAAC	2	10	94529	94538	40 %	0 %	40 %	20 %	527321650
72	NC_021891	GGATT	2	10	95429	95438	20 %	40 %	40 %	0 %	527321650
73	NC_021891	CAATC	2	10	96531	96540	40 %	20 %	0 %	40 %	527321652
74	NC_021891	TTTGC	2	10	96665	96674	0 %	60 %	20 %	20 %	527321652
75	NC_021891	ATTCA	2	10	96929	96938	40 %	40 %	0 %	20 %	527321652
76	NC_021891	GATCC	2	10	97188	97197	20 %	20 %	20 %	40 %	527321652
77	NC_021891	GTTTT	2	10	97609	97618	0 %	80 %	20 %	0 %	527321652
78	NC_021891	AAGCT	2	10	98813	98822	40 %	20 %	20 %	20 %	527321653
79	NC_021891	AGGGG	2	10	99172	99181	20 %	0 %	80 %	0 %	527321653
80	NC_021891	ATAGC	2	10	99871	99880	40 %	20 %	20 %	20 %	527321654
81	NC_021891	TTCCC	2	10	100475	100484	0 %	40 %	0 %	60 %	527321655
82	NC_021891	AGCGA	2	10	102799	102808	40 %	0 %	40 %	20 %	527321657
83	NC_021891	TTTCT	2	10	103157	103166	0 %	80 %	0 %	20 %	527321657
84	NC_021891	ATCAT	2	10	104363	104372	40 %	40 %	0 %	20 %	527321658
85	NC_021891	GGCAT	2	10	105071	105080	20 %	20 %	40 %	20 %	527321658
86	NC_021891	AAAGC	2	10	108797	108806	60 %	0 %	20 %	20 %	527321661
87	NC_021891	GCATT	2	10	109957	109966	20 %	40 %	20 %	20 %	527321663
88	NC_021891	TGTTT	2	10	114646	114655	0 %	80 %	20 %	0 %	527321666
89	NC_021891	CATGT	2	10	115024	115033	20 %	40 %	20 %	20 %	527321666
90	NC_021891	TATCG	2	10	115728	115737	20 %	40 %	20 %	20 %	527321666
91	NC_021891	TTTCT	2	10	116244	116253	0 %	80 %	0 %	20 %	527321667
92	NC_021891	AAAGA	2	10	118489	118498	80 %	0 %	20 %	0 %	527321669
93	NC_021891	TACAA	2	10	126227	126236	60 %	20 %	0 %	20 %	527321675
94	NC_021891	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	527321678
95	NC_021891	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	527321678
96	NC_021891	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	527321680
97	NC_021891	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	527321680
98	NC_021891	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	527321683
99	NC_021891	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	527321684
100	NC_021891	TCCAG	2	10	139918	139927	20 %	20 %	20 %	40 %	527321689
101	NC_021891	GTACA	2	10	140649	140658	40 %	20 %	20 %	20 %	527321690
102	NC_021891	TAGAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	527321690
103	NC_021891	AAAAG	2	10	141434	141443	80 %	0 %	20 %	0 %	527321691
104	NC_021891	AAAAC	2	10	141914	141923	80 %	0 %	0 %	20 %	527321692
105	NC_021891	TGCTA	2	10	143000	143009	20 %	40 %	20 %	20 %	527321694
106	NC_021891	GGAGC	2	10	143047	143056	20 %	0 %	60 %	20 %	527321694
107	NC_021891	CTGGG	2	10	144461	144470	0 %	20 %	60 %	20 %	527321696
108	NC_021891	GTTTT	2	10	145208	145217	0 %	80 %	20 %	0 %	527321697
109	NC_021891	GAACC	2	10	148942	148951	40 %	0 %	20 %	40 %	527321698
110	NC_021891	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	527321704
111	NC_021891	AGGAA	2	10	159673	159682	60 %	0 %	40 %	0 %	527321708
112	NC_021891	AGAGA	2	10	162913	162922	60 %	0 %	40 %	0 %	527321711
113	NC_021891	AGCAA	2	10	163348	163357	60 %	0 %	20 %	20 %	527321711
114	NC_021891	TATGA	2	10	163772	163781	40 %	40 %	20 %	0 %	527321712
115	NC_021891	CAAAA	2	10	166851	166860	80 %	0 %	0 %	20 %	527321713
116	NC_021891	AAGAG	2	10	167684	167693	60 %	0 %	40 %	0 %	527321713
117	NC_021891	GATTG	2	10	168029	168038	20 %	40 %	40 %	0 %	527321713
118	NC_021891	GTTTT	2	10	174510	174519	0 %	80 %	20 %	0 %	527321717
119	NC_021891	TATTG	2	10	174533	174542	20 %	60 %	20 %	0 %	527321717
120	NC_021891	CAGCA	2	10	174892	174901	40 %	0 %	20 %	40 %	527321717
121	NC_021891	TAGGA	2	10	175197	175206	40 %	20 %	40 %	0 %	527321718
122	NC_021891	TGATT	2	10	177124	177133	20 %	60 %	20 %	0 %	527321719
123	NC_021891	TCAAT	2	10	177765	177774	40 %	40 %	0 %	20 %	527321719
124	NC_021891	TTTTC	2	10	177804	177813	0 %	80 %	0 %	20 %	527321719
125	NC_021891	GGAAT	2	10	179370	179379	40 %	20 %	40 %	0 %	527321720
126	NC_021891	TTGAA	2	10	181290	181299	40 %	40 %	20 %	0 %	527321721
127	NC_021891	AGGGG	2	10	182301	182310	20 %	0 %	80 %	0 %	527321721
128	NC_021891	TTGAG	2	10	182864	182873	20 %	40 %	40 %	0 %	527321722
129	NC_021891	ATAGA	2	10	182886	182895	60 %	20 %	20 %	0 %	527321722
130	NC_021891	ACGAT	2	10	185046	185055	40 %	20 %	20 %	20 %	527321723
131	NC_021891	GGATC	2	10	188154	188163	20 %	20 %	40 %	20 %	527321725
132	NC_021891	CAGAT	2	10	188269	188278	40 %	20 %	20 %	20 %	527321725
133	NC_021891	TTGTA	2	10	194834	194843	20 %	60 %	20 %	0 %	527321726
134	NC_021891	AAAAG	2	10	195538	195547	80 %	0 %	20 %	0 %	527321727
135	NC_021891	TATCA	2	10	195611	195620	40 %	40 %	0 %	20 %	527321727
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